Ayebaye Us ti o jẹ ohun ti o jẹ ohun ti o jẹ agbara ti o jẹ eyiti o jẹ eyiti a ṣe agbekalẹ (slaf-seq)
N ṣiṣẹ
Eto imọ-ẹrọ
Awọn ẹya iṣẹ
● Squerecation lori Novaseq pẹlu Pe150.
Igbaradi Ile-ikawe pẹlu fifẹ ilọpo meji, gbigba iboji ti awọn ayẹwo 1000.
● Ọna yii le ṣee lo pẹlu tabi laisi aaye lokan, pẹlu awọn opo ara ilu Bioinlenfes fun ọran kọọkan:
Pẹlu itọkasi Genome: SNP ati Iwari Paarẹ
Laisi tọka si listome: iṣupọ ayẹwo ati iṣawari snop
NinuNi SilicoIpele Ami-Ami Apẹrẹ Ọpọlọpọ Awọn akojọpọ Isinmi Awọn ipo ti wa ni iboju lati wa awọn ti o ṣe agbeka pinpin iṣọkan ti awọn afi Slaf pẹlu Geneome.
Nigba idanwo-iṣaaju, awọn akojọpọ HEMYE mẹta ni idanwo ni awọn ile ikawe 3, ati pe alaye yii ni a lo lati yan apapo herlmuamu fun iṣẹ naa.
Awọn anfani Iṣẹ
●Iwari samisi giga: Ṣepọ eto ọja ọja ọja giga meji laaye fun ilohunsoke ni deede, aridaju pe awọn nọmba taaki ti o pade awọn ibeere Oniruuru ti awọn ibeere iwadi.
● Gbẹkẹle kekere lori lomeome: O le ṣee lo si awọn ẹda pẹlu tabi laisi iyatọ pupọ.
●Apẹrẹ apẹrẹ imudara: Ẹyọkan-henzye, meji-enzyme, tito nkan lẹsẹsẹ ti o jẹ ẹya ti o jẹ ti ẹya-ẹrọ, ati awọn oriṣiriṣi oriṣi ti awọn ensaemusi le ṣe afihan gbogbo awọn ibi-elo oriṣiriṣi tabi awọn ẹda iwadi oriṣiriṣi tabi awọn ẹda iwadi oriṣiriṣi tabi awọn ẹda iwadi oriṣiriṣi. AwọnNi SilicoApẹrẹ ami-tẹlẹ ni a gbe jade lati rii daju pe apẹrẹ iwọn didun to dara julọ.
● Ṣiṣe giga giga ni tito nkan lẹsẹsẹ eyezymatic: Ile-iṣẹ ti ẹyaNi SilicoApẹrẹ ami-tẹlẹ ati idanwo-iṣaaju ti o jẹ idaniloju apẹrẹ ti o dara julọ pẹlu paapaa pinpin awọn afi si commosome (1 aami Slaf / 4kb) ati idinku retive (<5%).
●Imọ-jinlẹ lọpọlọpọPipa
● Ara ile-iṣẹ BioiningPipa
Awọn alaye iṣẹ
| Iru onínọmbà | Iṣeduro olugbe olugbe | Nwon nwon.Mirza | |
| Ijinle aami isale | Nọmba Tag | ||
| Awọn maapu jiini | 2 Awọn obi ati> 150 Ọmọ | Awọn obi: 20x WGS Offsping: 10x | Iwọn pupọ: <400 MB: WGS ti wa ni niyanju <1GB: awọn aami 100K 1-2gb :: 200k tags > 2GB: 300K Tags Awọn aami Max 500K |
| Awọn ijinlẹ Generame-Lodo (Gwas) | Awọn ayẹwo ≥200 | 10x | |
| Itankalẹ jiini | Awọn ayẹwo ≥30, pẹlu> Awọn ayẹwo 10 lati ipinlẹ kọọkan | 10x | |
Awọn ibeere Iṣẹ
Fojusi ≥ 5 ng / μL
Lapapọ iye ≥ 80 ng
Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5
Agarose Gel: Ko si tabi ibajẹ ti o lopin tabi kontaminesonu
Ifijiṣẹ Apẹrẹ Apejuwe
Eiyan: 2 milimita centrifuge tube
(Fun ọpọlọpọ awọn ayẹwo, a ṣeduro lati ma ṣe itọju ni ethanol)
Ami apẹẹrẹ: Awọn ayẹwo nilo lati wa ni aami kedere ati aami si ipilẹ alaye alaye ayẹwo.
Gbigbe: Ice-yinyin: Awọn ayẹwo nilo lati farapọ ninu awọn baagi ni akọkọ o sin ni yinyin-yinyin.
Iṣẹ Iṣẹ Iṣẹ
Apeere QC
Pipego ikọkọ
Slaf-idanwo
Ile-ikawe
Iṣẹ ṣiṣe
Itupalẹ data
Awọn iṣẹ lẹhin-ẹrọ
Pẹlu itupalẹ ti o tẹle:
- Awọn data data QC
- Idagbasoke Slaf
Aworan lati tọka lome
Laisi aye logelime: clustering
- Onínọmbà ti awọn samisi slaf .: Awọn iṣiro, pinpin kọja lome
- Awari Awari: SNP, Inld, SNV, ipe CV pipe ati sisọ
Pinpin awọn aami slaf lori chromosomes:
Pinpin awọn snisps lori awọn chromosomes:
Ariyanjiyan
| Ọdun | Iwe irohin | IF | Akọle | Awọn ohun elo |
| 2022 | Awọn ibaraẹnisọrọ Iseda | 17.694 | Ilana ọjọ-akọọlẹ ti Giga-Christos ati Giga-Ligaome ti igi peony Paeoni Ostiii | Slaf-gwas |
| 2015 | Aṣojuto Phytor | 7.433 | Awọn aṣọ atẹsẹ ti ko ni iha ofin awọn ẹkun liimic ti pataki ti a gbin ninu awọn soybeans | Slaf-gwas |
| 2022 | Iwe iroyin ti iwadii ti ilọsiwaju | 12.822 | Inteome-jakejado Intro ti Caspiess ti Usaship Barbratenes sinu G. hirsutum ṣafihan gaju oke fun ilọsiwaju ti o ni afikun ti didara okun ati eso awọn abulẹ | Awọn Jiini etanfa |
| 2019 | Ohun ọgbin molucular | 10.81 | Awọn onínọmbà Genemimac ati De Novo Apejọ ṣafihan ipilẹṣẹ ti èpo Iresi bi ere ti itiranyan | Awọn Jiini etanfa |
| 2019 | Awọn Jiini Ijinlẹ | 31.616 | Ọna oniyebiye ati oniruuru jiini ti carp ti o wọpọ, caperis cyprinis | Maapu Slaf-asopọ |
| 2014 | Awọn Jiini Ijinlẹ | 25.455 | Epa ti awọn epa ti a gbin pese oye sinu isọdi si Leatypes, polyploid Itankalẹ ati iberbicionom irugbin. | Maapu Slaf-asopọ |
| 2022 | Ohun elo BOTECHhonenologlogy | 9.803 | Idanimọ ti SC1 ṣe afihan yiyan ti o kan, kuro ni mimu ti irugbin ipphology ati akoonu epo lakoko awọn ile dombean | Idagbasoke Slaf-Marku |
| 2022 | Awọn akosile International ti Science Sciencecular | 6.208 | Idanimọ ati Idagbasoke DNA Idagbasoke fun alikas Mollas 2ns (2D) Aropo chromosome aropo | Idagbasoke Slaf-Marku |
| Ọdun | Iwe irohin | IF | Akọle | Awọn ohun elo |
| 2020 | Etún ni ilowo ọgbin | 6.735 | Aworan QTLl ati ẹrọ ikogun ti akoonu suga lakoko eso eso ti Pyrafiolia pyrafolia | Maapu jiini |
| 2022 | Ohun elo BOTECHhonenologlogy | 8.154 | Idanimọ ti SC1 ṣe afihan iparun ti o kan ati kuro ti ounjẹ iṣiṣẹ ati epo lakoko ti a fi ofin de
| Spp pipe |
| 2022 | Etún ni ilowo ọgbin | 6.623 | Akọsilẹ Genesisi agbegbe ti awọn iwe afọwọkọ ti ko ni oye ninu agbegbe ogbele.
| Gwas |
