Ipinya ti arin ti ni aṣeyọri nipasẹ 10 × abereyo Christium ™, eyiti o wa awọn irele-ilọpo meji. Ninu eto yii, awọn ilẹkẹ kekere pẹlu awọn ọja Barcode ati alakọbẹrẹ, asan ati eekanna kan ti samisi ni epo nanolice silẹ, ti o n ṣiṣẹ-emulsion (tim). Ni kete ti wa ni agbekalẹ, lunsis sẹẹli ati itusilẹ ti awọn apoti aṣiṣẹ ni a fi ni okun kọọkan. MRNA ti wa ni paarọ sinu awọn monocules cdna pẹlu 10 × barcodes ati UMI, eyiti o wa labẹ ile-ikawe sẹsẹ.
Igbaradi ti Idaduro Ẹru-ọna lati inu awọn timo
● Lilo ti giale-ọti-in-in-emulsion (3) atẹle nipa iṣelọpọ CDNA
● kọọkan ni ilẹ-ikele ni a ti kojọpọ pẹlu awọn alakoko ti o jẹ ti awọn apakan 4:
poly (dt) iru fun Mrna alakọbẹrẹ ati iṣelọpọ CDNHE,
Alailẹgbẹ Alailẹgbẹ (UMi) lati ṣe atunṣe biagi
10x Barcode
Atẹle ti apakan ti apakan ka 1 Alabojuto
Ẹyọkan-nucleus Rannaching awọn idiwọn ti awọn idiwọn ti ẹyọkan ti o ni ọwọ, mu ṣiṣẹ:
● Lilo awọn ayẹwo ti o tutu ati kii ṣe opin si awọn ayẹwo alabapade
● Wahala kikan ti awọn sẹẹli ti o tutu nigbati a ṣe afiwe si itọju enzmatic ti awọn sẹẹli alabapade, tan afihan ninu awọn data kikọsilẹ ni irisi awọn jiini ti o nira
Ko si nilo fun yiyọkuro akọkọ ti awọn sẹẹli ẹjẹ pupa
Iwọn ila opin sẹẹli Kolopin
● Lọgan pupọ ti awọn ayẹwo ti o yẹ fun igbekale, pẹlu awọn oriṣi ẹran ara ati ẹlẹgẹ ti o jẹ proring
Cell / àsopọ | Idi |
Arun Unromen | Ko lagbara lati gba alabapade tabi awọn ajo ti a fipamọ |
Cell eru, Megakaryocyte, ọra ... | Iwọn ila opin sẹẹli jẹ tobi ju lati tẹ irinse naa |
Ẹdọ ... | Ẹlẹgẹ lati fọ, lagbara lati ṣe iyatọ awọn sẹẹli nikan |
Ẹjẹ Neuron, ọpọlọ ... | Diẹ sii ifura, rọrun lati wahala, yoo yi awọn abajade awọn iṣedede pada |
Pancreakes, tairodu ... | Ọlọrọ ninu awọn ensaemus |
Ẹyọkan-nucleus | Ẹyọkan |
Iwọn ila opin nkan ti ko ni ailopin | Iwọn ila opin sẹẹli: 10-40 μm |
Ohun elo naa le jẹ àsopọ tutu | Ohun elo naa gbọdọ jẹ àsopọ alabapade |
Aapọn kekere ti awọn sẹẹli ti o tutu | Itọju enzmumme le fa ifura wahala sẹẹli |
Ko si awọn sẹẹli ẹjẹ pupa nilo lati yọkuro | Awọn sẹẹli ẹjẹ pupa nilo lati yọkuro |
Iparun n ṣalaye bioinformation | Gbogbo sẹẹli n ṣafihan bioinformation |
Awọn ibeere ayẹwo | Ile-ikawe | Nwon nwon.Mirza | Data niyanju | Iṣakoso Didara |
Eranko eranko ≥ 200 mg Ohun ọgbin àsopọ ≥ 400 miligiramu | 10x jiini sr cdna ile-ikawe | ILLLILILU PAS150 | 100k pe awọn kika fun sẹẹli (100-200 GB) | 700-1200 nuclei / μL ati suclei iduroṣinṣin ṣe akiyesi labẹ maikirosikopu |
Fun awọn alaye diẹ sii lori itọsọna igbaradi iwadii ati iṣẹ iṣẹ iṣẹ, jọwọ lero free lati ba a sọrọIkọwe BMKGEN
Pẹlu itupalẹ ti o tẹle:
Alekun iṣakoso: Nọmba ti awọn sẹẹli, iṣawari Gene, idanimọ deede ti awọn sẹẹli, awọn sẹẹli RNA ati ṣiṣe ikosile
Onínọmbà ayẹwo Inerner:
Clusters sẹẹli ati asọtẹlẹ custoation
Ọpa onínọmbà ikolu: idanimọ ti awọn asọ ni awọn iṣupọ
Iyọọda iṣẹ ati ohun aflichment ti awọn iṣu iṣupọ
● Onínọmbà Inter-ẹgbẹ:
Apapo data
Ọpa onínọmbà ikolu: idanimọ ti awọn asọ ni awọn ẹgbẹ
Iyọọda iṣẹ ati idarasi ti awọn ipin ẹgbẹ
● Onínọmbà:
Ẹrọ itupalẹ sẹẹli
Itupalẹ pseutotime
Onínọmbà ibaraẹnisọrọ sẹẹli (cherphondb)
Gene ṣeto itupalẹ enrichment (Gsea)
Onínọmbà apẹẹrẹ
Olumulo sẹẹli:
Ọpa onínọmbà ikolu: awọn iṣu iṣupọ
Ijọyin Ẹgbẹ
Ọpa onínọmbà ikolu: Awọn asọ ẹgbẹ
Ijinlẹ ti ilọsiwaju:
Onínọmbà pseudotume:
Itupalẹ CLUMCLE:
Ṣawari awọn ilọsiwaju ti o ni irọrun nipasẹ BMKGEN's Clequese Awọn iṣẹ nipasẹ 10x Chrobium ninu awọn ikede ifihan wọnyi:
Wang, L. et al. (2021) 'Onínọmbà viscmiptomic onínọmbà fi han ala-ilẹ ti ẹdọfúnAwọn igbesẹ ti Ile-ẹkọ ti Orilẹ-ede ti Awọn Imọ Amẹrika ti Amẹrika ti Amẹrika, 118 (2), p. E2005590118. DI: 10,1073 / PNAS.2005590118
Zhegn, H. et al. (2022) 'Nẹtiwọki Agbaye kariaye fun awọn ikosile jiini ijóEtún ni imunorlogy, 13, p. 879824. Ise: 10.33889 / Fimmmu.202.87984 / BIBTEX.
Tian, H. et al. (203)Ariwo, 566, p. 739238. Ise: 10.1016 / J.aquaculture.20.739238.
Yu, y. et al. (2023)Akàn inu28 (5), PP. 798-8. Ise: 10.1007 / s10120-0-0-0-01409-X / metirics.