-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Awọn transcriptomics aaye duro ni iwaju ti imotuntun imọ-jinlẹ, n fun awọn oniwadi ni agbara lati wa sinu awọn ilana ikosile jiini intricate laarin awọn tissu lakoko ti o tọju ipo aye wọn. Laarin awọn iru ẹrọ lọpọlọpọ, BMKGene ti ṣe agbekalẹ BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, ti nṣogo ipinnu imudara ti 3.5µm, ti o de opin iwọn sẹẹli, ati mu awọn eto ipinnu ipele-pupọ ṣiṣẹ. Chirún S3000 naa, ti o nfihan isunmọ awọn aaye miliọnu 4, n gba awọn microwells ti o fẹlẹfẹlẹ pẹlu awọn ilẹkẹ ti o kojọpọ pẹlu awọn iwadii imudani ti aye. Ile-ikawe cDNA kan, ti o ni idarato pẹlu awọn koodu iwọle aye, ti pese sile lati chirún S3000 ati atẹle atẹle lori pẹpẹ Illumina NovaSeq. Apapo ti awọn ayẹwo ni aaye barcoded ati awọn UMI ṣe idaniloju deede ati pato ti data ti ipilẹṣẹ. Awọn chirún BMKManu S3000 jẹ wapọ pupọ, nfunni ni awọn eto ipinnu ipele-pupọ ti o le jẹ aifwy daradara si awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi ati awọn ipele alaye ti o fẹ. Aṣamubadọgba yii wa ni chirún bi yiyan ti o tayọ fun awọn ikẹkọ aye transcriptomics lọpọlọpọ, aridaju iṣupọ aye to peye pẹlu ariwo kekere. Lilo imọ-ẹrọ ipin sẹẹli pẹlu BMKManu S3000 n jẹ ki iyasọtọ ti data transcriptional si awọn aala ti awọn sẹẹli, ti o yorisi itupalẹ ti o ni itumọ ti ara taara. Pẹlupẹlu, ipinnu ilọsiwaju ti awọn abajade S3000 ni nọmba ti o ga julọ ti awọn Jiini ati awọn UMI ti a rii fun sẹẹli kan, ti o mu ki itupalẹ deede diẹ sii ti awọn ilana transcription aye ati ikojọpọ awọn sẹẹli.
-
Nikan- arin RNA Sequencing
Idagbasoke imudani sẹẹli-ẹyọkan ati awọn imọ-ẹrọ ikole ile ikawe aṣa, papọ pẹlu ilana ṣiṣe-giga, ti ṣe iyipada awọn ikẹkọ ikosile jiini ni ipele sẹẹli. Aṣeyọri yii ngbanilaaye fun imọ-jinlẹ ati imọ-jinlẹ diẹ sii ti awọn olugbe sẹẹli ti o nipọn, bibori awọn idiwọn ti o nii ṣe pẹlu aropin ikosile jiini lori gbogbo awọn sẹẹli ati titọju ilopọ otitọ laarin awọn olugbe wọnyi. Lakoko ti ilana RNA sẹẹli-ẹyọkan (scRNA-seq) ni awọn anfani ti a ko le sẹ, o koju awọn italaya ni awọn tisọ kan nibiti ṣiṣẹda idadoro sẹẹli-ẹyọkan jẹri nira ati nilo awọn ayẹwo tuntun. Ni BMKGene, a koju idiwo yii nipa fifun ọna-ọna RNA ọkan-nucleus (snRNA-seq) ni lilo imọ-ẹrọ 10X Genomics Chromium-ti-ti-aworan. Ọna yii n gbooro si iwoye ti awọn ayẹwo ti o ni anfani si itupalẹ transcriptome ni ipele sẹẹli-ẹyọkan.
Iyasọtọ ti awọn ekuro jẹ aṣeyọri nipasẹ chirún Chromium 10X Genomics tuntun, ti o nfihan eto microfluidics ikanni mẹjọ pẹlu awọn irekọja meji. Laarin eto yii, awọn ilẹkẹ gel ti o ṣafikun awọn koodu barcodes, awọn alakoko, awọn enzymu, ati ẹyọkan kan ni a fi sinu awọn iwọn epo nanoliter, ti o ṣẹda Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Lẹhin dida GEM, sẹẹli lysis ati idasilẹ koodu waye laarin GEM kọọkan. Lẹ́yìn náà, àwọn molecule mRNA farada ìkọ̀wé àdàkọ sí àwọn cDNA, tí ó ń ṣàkópọ̀ 10X barcodes àti Àwọn Ìdámọ̀ Mọ́likula Alailẹgbẹ (UMIs). Awọn cDNA wọnyi ni a tẹriba si kikọ ile ikawe ti o ṣe deede, ni irọrun ti o lagbara ati iwadii kikun ti awọn profaili ikosile pupọ ni ipele sẹẹli-ẹyọkan.
Platform: 10× Genomics Chromium ati Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Awọn transcriptomics aaye jẹ imọ-ẹrọ gige-eti ti o fun laaye awọn oniwadi lati ṣe iwadii awọn ilana ikosile pupọ laarin awọn tisọ lakoko ti o tọju ipo aye wọn. Syeed ti o lagbara ni agbegbe yii jẹ 10x Genomics Visium pọ pẹlu ilana ilana Illumina. Ilana ti 10X Visium wa lori chirún amọja kan pẹlu agbegbe yiyan ti a yan nibiti a ti gbe awọn apakan àsopọ. Agbegbe yiyaworan ni awọn aaye ti o ni koodu koodu, kọọkan ti o baamu si ipo aye alailẹgbẹ laarin àsopọ. Awọn ohun elo RNA ti o gba lati inu ẹran ara lẹhinna ni aami pẹlu awọn idamọ molikula alailẹgbẹ (UMIs) lakoko ilana iṣipopada. Awọn aaye ti o ni koodu koodu ati awọn UMI jẹ ki aworan agbaye to peye ati iwọn ikosile jiini ni ipinnu sẹẹli-ẹyọkan. Apapo ti awọn ayẹwo ni aaye barcoded ati awọn UMI ṣe idaniloju deede ati pato ti data ti ipilẹṣẹ. Nipa lilo imọ-ẹrọ Spatial Transcriptomics yii, awọn oniwadi le ni oye ti o jinlẹ ti eto aye ti awọn sẹẹli ati awọn ibaraenisepo molikula ti o nwaye laarin awọn tisọ, fifun awọn oye ti ko niyelori si awọn ilana ti o wa labẹ awọn ilana ti ibi ni awọn aaye pupọ, pẹlu oncology, neuroscience, isedale idagbasoke, ajẹsara , ati awọn ẹkọ imọ-aye.
Platform: 10X Genomics Visium ati Illumina NovaSeq
