Pacbio Kikun-ipari tiransikiripiti

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, ngbanilaaye idanimọ deede ti awọn isoforms tiransikiripiti, tan ina lori polyadenylation yiyan ati splicing, ati yori si iṣiro ikosile pupọ diẹ sii deede. BMKCloud PacBio Pipeline Transcriptome ni kikun jẹ apẹrẹ lati ṣe itupalẹ awọn ile-ikawe cDNA ti a ṣe lẹsẹsẹ ni ipo Iṣeduro Ijẹwọgba Circular (CCS) ati ṣe idanimọ awọn ilana Ipari Kikun Kii-Chimeric (FLNC), eyiti o wa ni akojọpọ lẹhinna si awọn iwe afọwọkọ ti kii ṣe laiṣe. Ayẹwo BUSCO ti o tẹle ṣe ayẹwo pipe ti apejọ transcriptome. Lati inu iwe-kikọ ti o pejọ, awọn itupalẹ lọpọlọpọ ni a ṣe: pipin yiyan, atunwi ọkọọkan ti o rọrun (SSR), asọtẹlẹ lncRNA ati awọn jiini ibi-afẹde ti o baamu, asọtẹlẹ ti awọn Jiini aramada, itupalẹ idile pupọ, itupalẹ ifosiwewe transcription, ati asọye iṣẹ ṣiṣe ti awọn iwe afọwọkọ.