Mrna-Seq (NGS) pẹlu ipinya itọkasi

Mrna-Seq (NGS) pẹlu ipinya itọkasi

RNA-Seaq jẹ ohun elo boṣewa kọja igbesi aye ati awọn abawọn irugbin, gbilẹ aafo laarin awọn ẹla ati awọn amuaradagba. Agbara rẹ wa ni iṣawari awọn iwe afọwọkọ tuntun ki o le ṣe akiyesi ikosile wọn ni dukia kan. O ti lo pupọ fun awọn ijinlẹ Ifiranṣẹ Ifiweranṣẹ, Imọlẹ ti o ni ibatan si ọpọlọpọ awọn aṣa tabi awọn ohun afọwọkọ, bii ifiwera si awọn iru-bok tabi ṣafihan ikosile awọ labẹ awọn ipo kan pato. BMKCCCloud M MMKCloud (itọkasi) Ṣepọ awọn ikosile ikosile, itupalẹ ikosile ti iyatọ ati pe o jẹ ki o jẹ irọrun ati ore-ore. Awọn olumulo le gbe data RNA-Seaq wọn si awọsanma, nibiti app naa nfunni ni okeerẹ, ojutu ti onínọmbà biogint. Ni afikun, o ṣe pataki iriri Onibara, nfunni awọn iṣẹ ti ara ẹni ti o yẹ si awọn iwulo awọn olumulo. Awọn olumulo le ṣeto awọn afiwera ki o fi ijabọ Pipeline nipasẹ ara wọn, wo awọn ijabọ ibaraenisọrọ, wo awọn asawọn ga

Awọn abajade demo

Iwakusa data

Owo ti o wọle

Akọsilẹ akọkọ

Itọkasi

Awọn abajade demo

Iwakusa data

Owo ti o wọle

Syeed:Illina, MGI
Nwon.Mirza:RNA-Seaq
Agbekalẹ: Paried, mimọ data.
Iru Ile-ikawe:fr-unstranded, fr-chicstrow tabi FR-Ekeji
Ka gigun:150 BP
Iru faili faili:*. Eto naa yoolaifọwọyi pa awọn faili.Fun apẹẹrẹ * _1 Alifix so pọ pẹlu * ._ 6.2ETFIX.
Nọmba ti awọn ayẹwo:Ko si awọn ihamọ lori nọmba naati awọn ayẹwo, ṣugbọn akoko onínọmbà yoo pọ si bi nọmba tiawọn ayẹwo dagba.
Ibeere data ti a ṣe iṣeduro:6G fun apẹẹrẹ

Akọsilẹ akọkọ

Onínọmbà akọkọ ati awọn irinṣẹ biogiptiramu ti Mrna-Seq (itọkasi)Pipeline jẹ bi atẹle:

1. Iṣakoso Diddata Didara:

Yiyọ ti awọn ọna-giga didara-didara, awọn atẹle ilana adapa,ati bẹbẹ lọ;

• Awọn irin: ti ile-gbigbe ti ni idagbasoke;

• Apejọ awọn kika ti o mọ pẹlu imọ-jinlẹ-mimọ kan si awọnKíkéénì.

• Awọn irinṣẹ:Afaya2, samtools

3. Onikale didara didara:

• Fi onínọmbà gigun, itupalẹ igbejade, ati bẹbẹ sii;

• Awọn irinṣẹ:samtools;

• AKIYESI TOPINSTSTYSTIONS, Apejuwe ẸyaAsọtẹlẹ Ẹya Funny, ati bẹbẹ sii;

• Awọn irinṣẹ:Okun, gffcompare, Gaki,Okuta iyebiye, Itusilẹ, atiHmmer.

5. Onínọmbà ikopa:

• Ṣiṣe ayẹwo Deg, onínọmbà ibatan, iṣẹ ṣiṣehrichment;

•Orisirisi awọn abajade wiwo;

•RpẹluSogseq, Deeq2, GGPLOT2, Daxseq

Itọkasi

1. KIM, Daehwa et. "Iwọn ile-iṣe-iṣe-iṣe-ara atiJiini pẹlu Hertat2 ati Ọga-Genetype. "AyanmọImọ-ẹkọ imọ-imọ37 (2019): 907 - 915.

2. McKenna, Aaroni ati Al. "Ohun elo irinṣẹ Onitari Gensis: AAami mapredrece fun itupalẹ dnaawọn data iṣedede. "Iwadi iye20 9 (2010): 1297-303.

3. L, Heng et. "Apẹrẹ ọkọọkan / ọna kika" atiAwọn samptools. "Bioinformtics25 (2009): 2078 - 2079.

4. Perea, Mihaela et al. "Okun ṣiṣẹ fun ilọsiwajuatunkọ ti ẹrọ afọwọkọ lati awọn ka kika RNA-Seaq. "AyanmọImọ-ẹkọ imọ-imọ33 (2015): 290-295.

5. Nife, Michael I. et al. "Aye ti a ṣatunṣe ti iyipada agbo atiPipinpin fun data RNA-Seq pẹlu deeq2. "OorunẸkọ15 (2014): n. pag.

6. Eddy, sean r .. "awọn iwadii hmm itoju hmm."Plos Iṣiro iṣiro7 (2011): n. pag.

Mrna-Seq (NGS) pẹlu ipinya itọkasi

Mrna-Seq (NGS) pẹlu ipinya itọkasi

Gba agbasọ kan

Fi ifiranṣẹ rẹ ranṣẹ si wa: