Nanopore-ipari Tiranscriptome Sequencing ni kikun-gigun
Nanopore sequencing ṣe iyatọ si ara rẹ lati awọn iru ẹrọ ti o tẹle, ni pe awọn nucleotides ni a ka taara laisi DNA kolaginni ati pe o ṣe awọn kika gigun ni mewa ti kilobases. Eyi n fun ni agbara kika taara ti awọn iwe afọwọkọ ni kikun ati koju awọn italaya ni awọn ikẹkọ transcriptomic.
√ Iwa-aiṣedeede kan pato ti ọkọọkan
√ Iwe kika ipari-kikun ti cDNA si fun awọn ẹkọ igbekalẹ apilẹṣẹ
√ Awọn data ti o kere ju nilo lati bo nọmba kanna ti awọn iwe afọwọkọ
√ Idanimọ ti ọpọ isoforms fun pupọ
√ Iwọn ikosile lori ipele isoform
Aṣoju Pipeline Bioinformatics
Awọn ọran Aṣeyọri Tuntun pẹlu Awọn Imọ-ẹrọ Biomarker
1. Awọn itupalẹ afiwera ti awọn iwe-kikun ni kikun ṣe afihan Gnetum luofuense stem awọn agbara idagbasoke idagbasoke
Iwe akosile: Awọn aala ni Genetics
Atejade: Oṣu Kẹta ọdun 2021
Koko: MinION | Yiyan splicing | APA | lncRNA | Awọn iwe afọwọkọ ti a fihan ni iyatọ
Ka ni kikun-ọrọ
2. Iṣipopada unidirectional ti awọn RNA kekere lati awọn abereyo si awọn gbongbo ni awọn heterografts interspecific
Iwe akosile: Awọn ohun ọgbin iseda
Atejade: Jan. 2021
Koko: Nanopore | Illumina | wiwa mRNA alagbeka gigun ni kikun
3. Ayẹwo transcriptome gigun ni kikun ti awọn gbongbo asparagus ṣe afihan ilana molikula ti ifarada iyọ ti o fa nipasẹ awọn elu mycorrhizal arbuscular
Akosile: Ayika ati Ese idanwo
Atejade: Jan. 2021
Koko: MinION | Awọn iwe afọwọkọ ti a fihan ni iyatọ | Awọn ifosiwewe transcription | Yiyan splicing
4. Awọn Ayipada Ẹda Ẹda ati Tiransikiripiti Gigun Gigun ti Rose (Rosa chinensis) Awọn gbongbo ati Awọn leaves ni Idahun si Wahala Ogbele
Iwe akosile: Ohun ọgbin ati Ẹkọ-ara sẹẹli
Atejade: Oṣu Kẹwa 2020
Koko: PromethION | Awọn iwe afọwọkọ ti a fihan ni iyatọ | Asọtẹlẹ iṣẹ-ṣiṣe | Spliced isoforms | TF ati lncRNA
5. Itupalẹ ati lafiwe okeerẹ ti PacBio ati ilana RNA ti o da lori nanopore ti transcriptome Arabidopsis
Iwe akosile: Ọna ọgbin
Atejade: Oṣu Kẹrin Ọjọ 2020
Koko: GridION | PromethION | PacBio Sequel | Illumina NovaSeq | Titete Jiini | Tiransikiripiti idanimọ | Yiyan splicing | SSR | LncRNA | Isoform quantification
News ati Ifojusi ifọkansi ni pinpin awọn ọran aṣeyọri tuntun pẹlu Awọn imọ-ẹrọ Biomarker, yiya awọn aṣeyọri imọ-jinlẹ aramada bi daradara bi awọn ilana olokiki ti a lo lakoko iwadii naa.
Akoko ifiweranṣẹ: Jan-08-2022