Genome-jakejado Association Analysis
Ṣiṣan iṣẹ
Awọn anfani Iṣẹ
●Imọye nla ati awọn igbasilẹ atẹjade: pẹlu iriri ikojọpọ ni GWAS, BMKGene ti pari awọn ọgọọgọrun ti awọn iṣẹ akanṣe eya ni iwadii GWAS olugbe, awọn oniwadi iranlọwọ lati ṣe atẹjade diẹ sii ju awọn nkan 100, ati ipin ipa ikojọpọ ti de 500.
● Okeerẹ bioinformatics onínọmbà: bisesenlo pẹlu SNP-iwa asepo onínọmbà, jišẹ kan ti ṣeto ti oludije Jiini ati awọn ti o baamu iṣẹ-ṣiṣe alaye.
●Ẹgbẹ bioinformatics ti oye giga ati ọmọ itupalẹ kukuru: pẹlu iriri nla ni itupalẹ jinomics ilọsiwaju, ẹgbẹ BMKGene ṣe awọn itupalẹ okeerẹ pẹlu akoko iyipada iyara.
●Atilẹyin Tita-lẹhin:Ifaramo wa kọja ipari iṣẹ akanṣe pẹlu oṣu mẹta lẹhin-tita akoko iṣẹ. Lakoko yii, a funni ni atẹle iṣẹ akanṣe, iranlọwọ laasigbotitusita, ati awọn akoko Q&A lati koju eyikeyi awọn ibeere ti o ni ibatan si awọn abajade.
Iṣẹ pato ati awọn ibeere
| Iru ti lesese | Niyanju olugbe asekale | Ilana titele | Nucleotide awọn ibeere |
| Gbogbo Jinomii Sequencing | 200 awọn ayẹwo | 10x | Ifojusi: ≥ 1 ng/µL Lapapọ iye≥ 30ng Lopin tabi ko si ibajẹ tabi ibajẹ |
| Àjẹkù Ìmúgbòrò Ibi Kan pato (SLAF) | Ijinle Tag: 10x Nọmba awọn afi: <400 Mb: WGS ni iṣeduro <1Gb: 100K afi 1Gb > 2Gb: 300K afi Max 500k afi | Ifojusi ≥ 5 ng/µL Lapapọ iye ≥ 80 ng Nandrop OD260/280 = 1.6-2.5 Agarose gel: ko si tabi ibajẹ ti o ni opin tabi ibajẹ
|
Aṣayan ohun elo
Awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi, awọn ẹya-ara, landraces/genebanks/awọn idile ti o dapọ/awọn orisun igbẹ
Awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi, awọn ẹya-ara, awọn ilẹ-ilẹ
Idaji-sib ebi / full-sib ebi / egan oro
Sisan Iṣẹ Iṣẹ
Apẹrẹ adanwo
Ifijiṣẹ apẹẹrẹ
RNA isediwon
Ikole ìkàwé
Titele
Itupalẹ data
Lẹhin-tita awọn iṣẹ
Pẹlu itupale wọnyi:
- Itupalẹ ẹgbẹ-ara-jakejado: LM, LMM, EMMAX, awoṣe FASTLMM
- Atọka iṣẹ ti awọn Jiini oludije
SNP-iwa sepo onínọmbà - Manhattan Idite
SNP-iwa sepo onínọmbà - QQ Idite
Ṣawakiri awọn ilọsiwaju ti o ni irọrun nipasẹ awọn iṣẹ BMKGene's de GWAS nipasẹ akojọpọ awọn atẹjade ti a ti ṣoki:
Lv, L. et al. (2023) 'Iwoye sinu ipilẹ jiini ti ifarada amonia ni clam felefele Sinonovacula constricta nipasẹ iwadii ẹgbẹ-jiini jakejado’,Aquaculture, 569, p. 739351. doi: 10.1016 / J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Awọn itupale Multi-omics ti 398 foxtail jero accessions ṣe afihan awọn agbegbe genomic ti o ni nkan ṣe pẹlu ile, awọn abuda metabolite, ati awọn ipa-iredodo’,Ohun ọgbin Molecular, 15 (8), ojú ìwé 1367–1383. doi: 10.1016 / j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Iyaworan Ẹgbẹ Genome-Wide ti Hulless Barely Phenotypes ni Ayika Ogbele',Furontia ni ọgbin Imọ, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, eyiti o ṣe koodu sulfotransferase kan, funni ni atako si awọn igara ọlọjẹ soybean mosaiki G2 ati G3',Ohun ọgbin, Cell & Ayika, 44 (8), ojú ìwé 2777–2792. doi: 10.1111 / PCE.14066.
