Awọn Jiini itirans
Awọn anfani Iṣẹ
Takagi et al.,Iwe irohin ọgbin, 2013
●Okeerẹ Bioyforder onínọmbà:Muu ṣiṣẹ iṣiro ti oniruuru iyatọ, eyiti o ṣe afihan ipo ti o dinku pẹlu ibatan ti o gbẹkẹle ati itankalẹ ti o jọra
●Igbekale adari iyipada: Bii iṣiro akoko ti akoko ajọ ati iyara ti o da lori awọn iyatọ ni nucleotide ati Ipele Amino acids.
●Imọye alala ati titẹjade titẹjadePipa
Awọn ẹgbẹ Ilu Bitiorformation ti o ga julọ ati ọmọ kapaka kukuru: Pẹlu iriri nla ni onínọmbà Jiini ti ilọsiwaju, ẹgbẹ BMKGENU ti awọn atunse kakiri pẹlu akoko titọ iyara.
Atilẹyin Tifoonu lẹhin:Iresi wa loke ipari iṣẹ-ṣiṣe pẹlu akoko iṣẹ iṣowo 3 lẹhin-oṣu. Lakoko yii, a pese atẹle iṣẹ akanṣe iṣẹ akanṣe, Iranlọwọ Iranlọwọ, ati awọn akoko Q & A lati koju awọn ibeere eyikeyi ti o ni ibatan si awọn abajade.
Awọn alaye iṣẹ ati awọn ibeere
| Iru iṣedede | Iṣeduro olugbe olugbe | Nwon nwon.Mirza | Awọn ibeere Nuclelote |
| Gbogbo asiko | ≥ 30 awọn olukaluku, pẹlu ≥ 10 awọn ẹni kọọkan lati ori ẹgbẹ ẹgbẹ kan
| 10x | Fojusi: ≥ 1 ng / μL Lapapọ iyemeji 30ng Ni opin tabi ko si ibajẹ tabi kontaminesonu |
| Apakan ti o ni agbara-kan pato (Slaf) | Ijinle Ami: 10x Nọmba ti awọn afi: <400 MB: WGS ti wa ni niyanju <1GB: awọn aami 100K 1GB > 2GB: 300K Tags Awọn aami Max 500K | Fojusi ≥ 5 ng / μL Lapapọ iye ≥ 80 ng Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5 Agarose Gel: Ko si tabi ibajẹ ti o lopin tabi kontaminesonu
|
Iṣẹ Iṣẹ Iṣẹ sisan
Apẹrẹ idanwo
Ifijiṣẹ apẹẹrẹ
Ile-ikawe Ile-ikawe
Iṣẹ ṣiṣe
Itupalẹ data
Awọn iṣẹ lẹhin-ẹrọ
Iṣẹ pẹlu igbekale ti apẹrẹ olugbe (igi phylylene bakanna, PC, oniruuru olugbe, ati yiyan olugbe ti o yan Didequlilibusibrium, n yan gbigba iye owo-aye). Iṣẹ naa tun le fi onkawe ti adari (fun apẹẹrẹ akoko iyatọ, sisan Ẹya).
*Awọn abajade demo han nibi ni gbogbo awọn jiini ti a tẹjade pẹlu BMKGEN
1. Olowoji ti o ni ikole ti igi phylogenetic, eto olugbe ati PCta da lori awọn iyatọ jiini.
Igi phylognetiki ṣe aṣoju pataki ati awọn ibatan ti o ṣe pataki laarin awọn ẹda pẹlu baba wọn ti o wa.
PCA ṣe ifọkansi si akiyesi isunmọ laarin awọn olugbe.
Ẹya Olugbe fihan niwaju ti agbegbe iha-ilu ti o yatọ ni awọn ofin ni awọn ofin ti awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn ọpọlọpọ awọn igbohunsipo.
Chen, et. al.,Awọn Pnas, 2020
2. Mulveve gbigba
POPELE fọwọsi tọka si ilana kan nipa eyiti o yan aaye anfani ati awọn ọpọlọpọ awọn aaye to ku ati awọn ti awọn aaye ti o sopọsi ati awọn ti awọn aaye ti o jinna si ati awọn ti awọn aaye ti ko jinna, Abajade ni idinku agbegbe.
Iwari wo Genefe lori awọn ẹkun-ilẹ ti o ni yiyan ni a ni ilọsiwaju nipasẹ iṣiro iṣiro atọka jiini (π, fst, Tajima's d) ti gbogbo SNPs laarin igbese sisun kan (10 kb).
Oniruuru nuclelodery (π)
Tajima's d
Atọka atunṣe (fst)
WU, et. al.,Ohun ọgbin molucular, 2018
3.Gee n ṣan
WU, et. al.,Ohun ọgbin molucular, 2018
IWEJO itan
Zhang, et. al.,Isedale iseda & itankalẹ, 2021
5.Divergence akoko
Zhang, et. al.,Isedale iseda & itankalẹ, 2021
Ṣawari awọn ilọsiwaju ti o ni irọrun nipasẹ awọn iṣẹ Jiini BMKGENTET ti BMKGENTS ti o jẹ nipasẹ gbigba ti awọn atẹjade:
Hassanyar, Ak et al. (2023) Awari ti awọn asami ohun elo SNP ati awọn ẹbun iṣẹgun ti o ni nkan ṣe afiwera ni Apeni Cernana idin nipasẹ iṣapẹẹrẹ gbogbo eniyan ',Awọn akosile International ti Science Sciencecular, 24 (7). Ise: 10.3390 / IJM24076 25.
Chai, J. et al. (2022) 'Awari' ti egan kan, salomaally omiran ti ara ilu Ilu Ilu Kannada ṣẹda awọn anfani itọju tuntun ',Iwadii Zological, 2022, Vol. 43, jiji 3, oju-iwe: 469-480, 43 (3), PP. 469-480. Ise: 10.24272 / J.isss.2095-8137.202.101.
Han, M. Et al. (2022) Apẹrẹ asọtẹlẹ ShyloGograph ati itan asọtẹlẹ olugbe ti Inditinuus Elymus Sibiricus L. Lori Qinghai Plateau ',Etún ni ilowo ọgbin, 13, p. 882601. Ise: 10.33889 / FPS.2022.882601 / BIBTEX.
Wang, J. et al. (2022) 'awọn oye ti o jinlẹ si Langan Extenalowo lati apejọ pupọ ti o jẹ apẹrẹ ati awọn jiini olugbe ti awọn iwe ikasẹ gigun',Ẹgbin ara, 9. Ise: 10.1093 / HR / Uhac021.
