Exclusive Agency for Korea

条形pasia-03

Awọn ọja

Illumina kọkọ-ṣe ikawe

Imọ-ẹrọ itẹlera Illumina, ti o da lori Sequencing nipasẹ Synthesis (SBS), jẹ imotuntun NGS ti o gba kariaye, ti o ni iduro fun ṣiṣẹda diẹ sii ju 90% ti data ilana-tẹle agbaye. Ilana ti SBS jẹ pẹlu aworan ti a fi aami si fluorescently awọn ifopinsi iyipada bi a ṣe ṣafikun dNTP kọọkan, ati pe lẹyin ti o pin lati gba isọdọkan ti ipilẹ atẹle. Pẹlu gbogbo awọn dNTP ti o ni ifopinsi mẹrin ti o wa ni ọna ṣiṣe-tẹle kọọkan, idije adayeba dinku irẹwẹsi isọdọkan. Imọ-ẹrọ to wapọ yii ṣe atilẹyin fun kika ẹyọkan ati awọn ile-ikawe-ipari-isopọmọra, ti n pese ounjẹ si ọpọlọpọ awọn ohun elo genomic. Illumina sequencing's ga-throughput agbara ati konge ipo ti o bi a igun kan ninu jinomics iwadi, ifiagbara sayensi lati unravel awọn intricacies ti genomes pẹlu unmatched apejuwe awọn ati ṣiṣe.

Iṣẹ ṣiṣe atẹle ile-ikawe ti a ti ṣe tẹlẹ n jẹ ki awọn alabara murasilẹ awọn ile-ikawe itẹlera lati awọn orisun oriṣiriṣi (mRNA, gbogbo genome, amplicon, awọn ile-ikawe 10x, laarin awọn miiran). Lẹhinna, awọn ile-ikawe wọnyi le firanṣẹ si awọn ile-iṣẹ itọsẹ wa fun iṣakoso didara ati ṣiṣe lẹsẹsẹ ni awọn iru ẹrọ Illumina.


Awọn alaye Iṣẹ

Abajade Ririnkiri

Awọn ẹya ara ẹrọ

Awọn iru ẹrọ:Illumina NovaSeq 6000 ati NovaSeq X Plus

Awọn ọna ṣiṣe atẹle:PE150 ati PE250

Iṣakoso didara ti awọn ile-ikawe ṣaaju ṣiṣe ilana

Tito lẹsẹsẹ data QC ati ifijiṣẹ:ifijiṣẹ ti ijabọ QC ati data aise ni ọna kika fastq lẹhin demultiplexing ati sisẹ Q30 kika

 

 

Awọn anfani Iṣẹ

Iwapọ ti awọn iṣẹ ṣiṣe atẹle:alabara le yan lati tẹle-tẹle nipasẹ ọna, sẹẹli sisan, tabi nipa iye data ti a beere (ilana ipa ọna).

Iriri ti o gbooro lori Syeed ilana ilana Illumina:pẹlu egbegberun titi ise agbese pẹlu orisirisi eya. 

Ifijiṣẹ ti ijabọ QC lẹsẹsẹ:pẹlu awọn metiriki didara, išedede data ati iṣẹ ṣiṣe gbogbogbo ti iṣẹ akanṣe.

Ilana ti o dagba:pẹlu kukuru Tan-ni ayika akoko.

Iṣakoso Didara lile: a ṣe awọn ibeere QC ti o muna lati ṣe iṣeduro ifijiṣẹ ti awọn abajade didara to gaju nigbagbogbo.

 

 

Awọn iru ẹrọ apẹẹrẹ

Platform

Cell sisan

Ipo titele

Ẹyọ

Iṣagbejade ifoju

NovaSeq X

10B (ọ̀nà 8)

PE150

Nikan Lane

Apakan Lane

375Gb / Lane

25B (ọ̀nà 8)

PE150

Nikan Lane

Apakan Lane

1000 Gb/Lane

NovaSeq 6000

SP Flow cell (awọn ọna meji)

PE250

Cell sisan

Nikan Lane

Apakan Lane

325-400 M kika / Lane

S4 sẹẹli ṣiṣan (awọn ọna mẹrin)

PE150

Cell sisan

Nikan Lane

Apakan Lane

~ 800 Gb / Lane

Awọn ibeere apẹẹrẹ

 

Iye Data (X)

Ifojusi (qPCR/nM)

Iwọn didun

Apakan Lane Sequencing

 

 

X ≤ 10 Gb

≥1 nM

≥ 25 μl

10 Gb <X ≤ 50 Gb

≥2 nM

≥ 25 μl

50 Gb <X ≤ 100 Gb

≥3 nM

≥ 25 μl

X> 100 Gb

≥4 nM

≥ 25 μl

Lenii Sequencing

Fun Lane

≥ 1.5 nM / ibi-ikawe

≥ 25 μl / Adagun ibi-ikawe

Ni afikun si ifọkansi ati iye lapapọ, apẹrẹ tente oke ti o yẹ tun nilo.

Akiyesi: Ilana ti ọna ti awọn ile-ikawe oniruuru kekere nilo isunmi PhiX lati rii daju pe pipe ipilẹ to lagbara.

A ṣeduro ifisilẹ awọn ile-ikawe ti a ti ṣajọpọ tẹlẹ bi awọn ayẹwo. Ti o ba nilo BMKGENE lati ṣe akojọpọ ile-ikawe, jọwọ tọka si

awọn ibeere ile-ikawe fun ọna titọ apakan.

Ìwọ̀n Ilé-ìkàwé (Àwòrán Òkè)

Oke akọkọ yẹ ki o wa laarin 300-450 bp.
Awọn ile-ikawe yẹ ki o ni tente oke akọkọ kan, ko si ibajẹ ohun ti nmu badọgba ko si si awọn dimer alakoko.

Jọwọ kan si wa ti awọn ayẹwo rẹ ko ba pade awọn ibeere ohun elo ibẹrẹ.

Ṣiṣẹ Iṣẹ Iṣẹ

igbaradi ayẹwo

Iṣakoso didara ìkàwé

Titele

Titele

Itupalẹ data

Iṣakoso didara data

Ayẹwo QC

Ifijiṣẹ ise agbese


  • Ti tẹlẹ:
  • Itele:

  • Iroyin QC Library

    Ijabọ lori didara ile-ikawe ti pese ṣaaju ṣiṣe lẹsẹsẹ, ṣe ayẹwo iye ile-ikawe, ati pipin.

     

    Ijabọ QC lẹsẹsẹ

     

    Table 1. Statistics on data lesese.

    Apeere ID

    BMKID

    Aise kika

    Data aise (bp)

    Awọn kika mimọ (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Ṣe nọmba 1. Didara pinpin pẹlu kika ni ayẹwo kọọkan

    A9

    olusin 2. Ipilẹ akoonu pinpin

    A10

    Ṣe nọmba 3. Pipin awọn akoonu kika ni data tito lẹsẹsẹ

    A11

     

    gba agbasọ

    Kọ ifiranṣẹ rẹ nibi ki o si fi si wa

    Fi ifiranṣẹ rẹ ranṣẹ si wa: