ProkaryOt
פֿעיִקייטן
רנאַ מוסטער פּראַסעסינג ינוואַלווד רירן דיפּלישאַן נאכגעגאנגען דורך דייניששאַנאַל ראַנאַ ביבליאָטעק צוגרייטונג.
ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס באזירט אויף אַליינמאַנט צו אַ דערמאָנען גענעם
● אַנאַליסיס כולל דזשין אויסדרוק און דילז, אָבער אויך טראַנסקריפּט סטרוקטור און סרנאַ אַנאַליסיס
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●שטרענג קוואַליטעט קאָנטראָל: מיר ינסטרומענט האַרץ קאָנטראָל פונקטן אַריבער אַלע סטאַגעס, פֿון מוסטער און ביבליאָטעק צוגרייטונג צו סיקוואַנסינג און ביאָינפאָרמאַטיקס. די מאַטיקיאַלאַס מאָניטאָרינג ינשורז די עקספּרעס פון קאַנסיסטאַנטלי הויך-קוואַליטעט רעזולטאַטן.
●סטראַנד-ספּעציפיש סיקוואַנסינג דאַטןפֿאַר די RNA ביבליאָטעק צוגרייטונג איז קלאָרסאַל, ענייבאַלינג לעגיטימאַציע פון אַנטי-סענס טראַנסקריפּץ.
●גאַנץ אַנאַליסיס טיילערד צו פּראָקאַריק טראַנסקריפּטאָמעס: די ביאָינפאָרמאַטיק רערנ - ליניע כולל נישט בלויז אַנאַליסיס פון די דזשין אויסדרוק, אָבער אויך אַנאַליסיס פון די טראַנסקריפּט סטרוקטור, אַרייַנגערעכנט לעגיטימאַציע פון אָפּעראָנס, UTRs און פּראַמאָוטערז. עס אויך כולל אַנאַליסיס פון SRNAS, ניימלי אַנאָטאַציע און פאָרויסזאָגן פון צווייטיק סטרוקטור און טאַרגאַץ.
●שטיצן פון פּאָסטן-פארקויפונג: אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
מוסטער באדערפענישן און עקספּרעס
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד | קוואַליטעט קאָנטראָל |
| ררנאַ דיפּליטיד דירעקטיאָנאַל ביבליאָטעק | ילומינאַ פּע 150 | 1-2 גיגאבייט | Q3085% |
מוסטער באדערפענישן:
| Conc. (נג / μ ל) | סומע (μ ג) | ריינקייַט | אָרנטלעכקייַט |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260 / 280 = 1.8-2.0 OD260 / 230 = 1.0-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | Rin≥6.5 |
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
קאַנטיינער: 2 מל סענטרייפוג רער (צין שטער איז נישט רעקאַמענדיד)
מוסטער לייבאַלינג: גרופּע + רעפּלאַקייט ע.יו.000 A1, A2, A3; B1, B2, B3.
טראַנספּאָרט:
1. טרוקן-ייַז: סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּאַקט אין באַגס און בעריד אין טרוקן ייַז.
2. רנאַסטאַבאַל טובז: רנאַ סאַמפּאַלז קענען זיין דאַר אין RNN סטייבאַלאַז טוב (למשל רנאַסטאַבאַל®) און שיפּט אין צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס אַרבעט לויפן
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס וואָרקפלאָוו
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
● רוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
● אַליינמאַנט צו די דערמאָנען גענעם
סטראַטאַליישאַן קוואַליטעט אַסעסמאַנט: RNA פראַגמאַנטיישאַן רומז, אַרייַנלייגן גרייס און סיקוואַנסינג זעטיקונג
● פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן פון פּרעדיקטעד קאָדירונג גענעס
● אויסדרוק אַנאַליסיס: קאָראַליישאַן און הויפּט קאָמפּאָנענט אַנאַליסיס (פּקאַ)
דיפערענטשאַל דזשין עקספּרעססיאָן (דעגס)
● פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן און ענריטשמענט פון דילז
● סרנאַ אַנאַליסיס: פּראָגנאָז, אַנאָטאַציע, ציל און צווייטיק סטרוקטור פּראָגנאָז
● טראַנסקריפּט סטרוקטור אַנאַליסיס: אָפּעראָנס, סטאַרטינג און סאָף שטעלעס, ונטראַנסלאַטעד געגנט (וטס), פּראָמאָטער און ספּ / ינדעפּען / ינדיאַן אַנאַליסיס
סיקוואַנסינג זעטיקונג
פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן פון קאָדירונג גענעס
קאָראַליישאַן צווישן סאַמפּאַלז
דיפערענטשאַל אויסגעדריקט גענעס (דעגס) אַנאַליסיס
פאַנגקשאַנאַל ענריטשמענט אַנאַליסיס
סרנאַ אַנאָטאַציע
ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGENEN ס נאַנאָפּאָרע פול-לענג Mrna סיקוואַנסינג באַדינונגס אין דעם פיטשערד ויסגאַבע.
גואַן, קפּ עט על. (2018)פויליש זשורנאַל פון מיקראָביאָלאָגי, 67 (2), פּ. 223. דאָי: 10.21307 / PJM-2018-024.
