-
קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס
קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס ינוואַלווז די דורכקוק און פאַרגלייַך פון די גאנצע גענאָמע סיקוואַנסיז און סטראַקטשערז צווישן פאַרשידענע מינים. דעם פעלד זוכט צו אַנוויילד די עוואָלוציע פון מינים, דעקאָדע דזשין פאַנגקשאַנז און ילוסיד די גענעטיק רעגולאַטאָרי מעקאַניזאַמז דורך ידענטיפיצירן קאַנסערווד אָדער דייווערדזשאַנט סיקוואַנס סטראַקטשערז און עלעמענטן אַריבער פאַרשידן אָרגאַניזאַמז. א פולשטענדיק קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס לערנען ענקאַמפּאַסאַז אַנאַליזעס אַזאַ ווי דזשין פאַמיליעס, עוואָלוטיאָנאַרי אַנטוויקלונג, גאַנץ דזשינאָום דופּליקאַטיאָן געשעענישן און די פּראַל פון סעלעקטיוו פּרעשערז.
-
עוואָלוטיאָנאַרי גענעטיקס
באַפעלקערונג און עוואָלוטיאָנאַרי גענעטיק אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע איז געגרינדעט אויף די באַזע פון מאַסיוו דערפאַרונג אַקיומיאַלייטיד אין BMK R&D מאַנשאַפֿט פֿאַר יאָרן. עס איז אַ באַניצער-פרייַנדלעך געצייַג ספּעציעל פֿאַר ריסערטשערז וואָס זענען נישט מאַדזשאָרינג אין ביאָינפאָרמאַטיקס. דער פּלאַטפאָרמע ינייבאַלז יקערדיק עוואָלוטיאָנאַרי דזשאַנעטיקס פֿאַרבונדענע יקערדיק אַנאַליסיס אַרייַנגערעכנט פילאָגענעטיק בוים קאַנסטראַקשאַן, לינגקאַדזש דיסעקוויליבריום אַנאַליסיס, גענעטיק דייווערסיטי אַסעסמאַנט, סעלעקטיוו ויסקערן אַנאַליסיס, משפּחה אַנאַליסיס, פּקאַ, באַפעלקערונג סטרוקטור אַנאַליסיס, עטק.
-
הי-C באזירט גענאָמע אַסעמבלי
Hi-C איז אַ מעטאָד דיזיינד צו כאַפּן כראָמאָסאָם קאַנפיגיעריישאַן דורך קאַמביינינג פּראָובינג פּראַקסימאַטי-באזירט ינטעראַקשאַנז און הויך-טרופּוט סיקוואַנסינג. די ינטענסיטי פון די ינטעראַקשאַנז איז געגלויבט צו זיין נעגאַטיוולי קאָראַלייטאַד מיט גשמיות דיסטאַנסע אויף טשראָמאָסאָומז. דעריבער, Hi-C דאַטן זענען געניצט צו פירן די קלאַסטערינג, אָרדערינג און אָריענטירונג פון פארזאמלט סיקוואַנסיז אין אַ פּלאַן גענאָמע און אַנגקערינג די אויף אַ זיכער נומער פון טשראָמאָסאָומז. די טעכנאָלאָגיע ימפּאַוערז אַ כראָמאָסאָם-מדרגה גענאָמע פֿאַרזאַמלונג אין דער אַוועק פון אַ באַפעלקערונג-באזירט גענעטיק מאַפּע. יעדער גענאָמע דאַרף אַ Hi-C.
-
פּלאַנט / כייַע די נאָוואָ גענאָמע סיקוואַנסינג
די נאָוואָסיקוואַנסינג רעפערס צו די קאַנסטראַקשאַן פון אַ גאַנץ גענאָמע פון אַ מינים ניצן סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז אין דער אַוועק פון אַ רעפֿערענץ גענאָמע. די הקדמה און וויידספּרעד אַדאַפּשאַן פון דריט-דור סיקוואַנסינג, מיט מער רידינגז, האָבן באטייטיק ענכאַנסט גענאָמע פֿאַרזאַמלונג דורך ינקריסינג די אָוווערלאַפּ צווישן רידינגז. די ענכאַנסמאַנט איז דער הויפּט פּערטינאַנט ווען דילינג מיט טשאַלאַנדזשינג גענאָמעס, אַזאַ ווי די יגזיביטינג הויך העטעראָזיגאָסיטי, אַ הויך פאַרהעלטעניש פון ריפּעטיטיוו מקומות, פּאָליפּלאָידס און מקומות מיט ריפּעטיטיוו עלעמענטן, אַבנאָרמאַל גק אינהאַלט, אָדער הויך קאַמפּלעקסיטי וואָס זענען טיפּיקלי שוואַך פארזאמלט מיט קורץ-לייענען סיקוואַנסינג. אַליין.
אונדזער איין-האַלטן לייזונג גיט ינאַגרייטיד סיקוואַנסינג באַדינונגס און ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס וואָס צושטעלן אַ הויך-קוואַליטעט דע נאָוואָ אַסעמבאַלד גענאָמע. אַן ערשט גענאָמע יבערבליק מיט Illumina גיט עסטאַמאַץ פון גענאָמע גרייס און קאַמפּלעקסיטי, און די אינפֿאָרמאַציע איז געניצט צו פירן די ווייַטער שריט פון לאַנג-לייענען סיקוואַנסינג מיט PacBio HiFi, נאכגעגאנגען דורךde novoפֿאַרזאַמלונג פון קאָנטיגס. די סאַבסאַקוואַנט נוצן פון HiC פֿאַרזאַמלונג ינייבאַלז אַנגקערינג פון די קאָנטיגס צו די גענאָמע, באקומען אַ כראָמאָסאָם-מדרגה פֿאַרזאַמלונג. צום סוף, די גענאָמע איז אַנאַטייטיד דורך דזשין פאָרויסזאָגן און דורך סיקוואַנסינג אויסגעדריקט גענעס, ריזאָרטינג צו טראַנסקריפּטאָמעס מיט קורץ און לאַנג לייענען.
-
מענטש גאַנץ עקסאָמע סיקוואַנסינג
מענטש גאַנץ עקסאָמע סיקוואַנסינג (hWES) איז וויידלי יקנאַלידזשד ווי אַ פּרייַז-עפעקטיוו און שטאַרק סיקוואַנסינג צוגאַנג פֿאַר פּינפּוינטינג קרענק-קאָזינג מיוטיישאַנז. טראָץ קאַנסטאַטוטינג בלויז וועגן 1.7% פון די גאנצע גענאָמע, עקסאָנס שפּילן אַ קריטיש ראָלע דורך גלייַך ריפלעקטינג די פּראָפיל פון גאַנץ פּראָטעין פאַנגקשאַנז. נאָוטאַבלי, אין די מענטשלעך גענאָמע, איבער 85% פון מיוטיישאַנז שייַכות צו חולאתן באַשייַמפּערלעך אין די פּראָטעין קאָודינג מקומות. BMKGENE אָפפערס אַ פולשטענדיק און פלעקסאַבאַל מענטש גאַנץ עקסאָמע סיקוואַנסינג דינסט מיט צוויי פאַרשידענע עקסאָן קאַפּטשערינג סטראַטעגיעס בנימצא צו טרעפן פאַרשידן פאָרשונג גאָולז.
-
ספּעציפֿיש לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט סיקוואַנסינג (SLAF-Seq)
גענאָטיפּינג מיט הויך-דורכקייט, דער הויפּט אויף גרויס-וואָג פּאַפּיאַליישאַנז, איז אַ פונדאַמענטאַל שריט אין גענעטיק פאַרבאַנד שטודיום און גיט אַ גענעטיק יקער פֿאַר פאַנגקשאַנאַל דזשין ופדעקונג, עוואָלוטיאָנאַרי אַנאַליסיס, אאז"ו ו. אַנשטאָט פון טיף גאַנץ גענאָמע רי-סיקוואַנסינגרידוסט רעפּרעסענטאַטיאָן גענאָמע סיקוואַנסינג (RRGS)איז אָפט אָנגעשטעלט אין די שטודיום צו מינאַמייז די סיקוואַנסינג קאָס פּער מוסטער און האַלטן אַ גלייַך עפעקטיווקייַט אין גענעטיק מאַרקער ופדעקונג. RRGS אַטשיווז דעם דורך דיידזשעסטיד דנאַ מיט ריסטריקשאַן ענזימעס און פאָוקיסינג אויף אַ ספּעציפיש פראַגמענט גרייס קייט, דערמיט סיקוואַנסינג בלויז אַ בראָכצאָל פון די גענאָמע. צווישן די פאַרשידן RRGS מעטאַדאַלאַדזשיז, ספּעציפיש-לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט סיקוואַנסינג (SLAF) איז אַ קוסטאָמיזאַבלע און הויך-קוואַליטעט צוגאַנג. דער אופֿן, ינדיפּענדאַנטלי דעוועלאָפּעד דורך BMKGene, אָפּטימיזעס די ריסטריקשאַן ענזיים שטעלן פֿאַר יעדער פּרויעקט. דאָס ינשורז די דור פון אַ היפּש נומער פון SLAF טאַגס (400-500 בפּס רעגיאָנס פון די גענאָמע סיקוואַנס) וואָס זענען יונאַפאָרמלי פונאנדערגעטיילט איבער די גענאָמע און יפעקטיוולי ויסמיידן ריפּעטיטיוו מקומות, אַזוי אַשורינג דער בעסטער גענעטיק מאַרקער ופדעקונג.
-
פאַר-געמאכט ביבליאָטעק פון Illumina
Illumina סיקוואַנסינג טעכנאָלאָגיע, באזירט אויף סיקוואַנסינג דורך סינטעז (SBS), איז אַ גלאָובאַלי עמברייסט NGS כידעש, פאַראַנטוואָרטלעך פֿאַר דזשענערייטינג איבער 90% פון די וועלט 'ס סיקוואַנסינג דאַטן. דער פּרינציפּ פון SBS ינוואַלווז ימאַגינג פלורעסענטלי לייבאַלד ריווערסאַבאַל טערמינאַטאָרס ווי יעדער דנטפּ איז מוסיף, און דערנאָך קלעאַוועד צו לאָזן די ינקאָרפּעריישאַן פון דער ווייַטער באַזע. מיט אַלע פיר ריווערסאַבאַל טערמינאַטאָר-געבונדן דנטפּס פאָרשטעלן אין יעדער סיקוואַנסינג ציקל, נאַטירלעך פאַרמעסט מינאַמייזיז ינקאָרפּעריישאַן פאָרורטייל. די ווערסאַטאַל טעכנאָלאָגיע שטיצט ביידע איין-לייענען און פּערד-סוף לייברעריז, קייטערינג צו אַ קייט פון גענאָמיק אַפּלאַקיישאַנז. די הויך-דורכקייט קייפּאַבילאַטיז און פּינטלעכקייט פון Illumina סיקוואַנסינג שטעלן עס ווי אַ קאָרנערסטאָון אין גענאָמיקס פאָרשונג, ימפּאַוערינג סייאַנטיס צו אַנראַוואַל די ינטראַקאַסיז פון גענאָמעס מיט אַ גלייַכן דעטאַל און עפעקטיווקייַט.
אונדזער פאַר-געמאכט ביבליאָטעק סיקוואַנסינג דינסט ינייבאַלז קאַסטאַמערז צו צוגרייטן סיקוואַנסינג לייברעריז פון דייווערס קוואלן (מרנאַ, גאַנץ גענאָמע, אַמפּליקאָן, 10 קס לייברעריז, צווישן אנדערע). דערנאָך, די לייברעריז קענען זיין שיפּט צו אונדזער סיקוואַנסינג סענטערס פֿאַר קוואַליטעט קאָנטראָל און סיקוואַנסינג אין Illumina פּלאַטפאָרמס.
