הי-C באזירט גענאָמע פֿאַרזאַמלונג
הי-C איז אַ מעטאָד דיזיינד צו כאַפּן כראָמאָסאָם קאַנפיגיעריישאַן דורך קאַמביינינג פּראָבינג פּראַקסימאַטי-באזירט ינטעראַקשאַנז און הויך-טרופּוט סיקוואַנסינג. די ינטענסיטי פון די ינטעראַקשאַנז איז געמיינט צו זיין נעגאַטיוולי קאָראַלייטאַד מיט גשמיות ווייַטקייט אויף כראָמאָסאָומז. דעריבער, הי-C דאַטן איז געניצט צו פירן די קלאַסטערינג, אָרדערינג און אָריענטיד פון פארזאמלט סיקוואַנסיז אין אַ פּלאַן גענאָמע און אַנגקערינג יענע אויף אַ זיכער נומער פון כראָמאָסאָומז. דעם טעכנאָלאָגיע ימפּרוווז אַ כראָמאָסאָם-מדרגה גענאָמע פֿאַרזאַמלונג אין דער אַוועק פון אַ באַפעלקערונג-באזירט גענעטיק מאַפּע. יעדער ייער דאַרף אַ הי.
סערוויס פֿעיִקייטן
● סיקוואַנסינג אויף יללומינאַ נאָוואַסעעק מיט פּע 150.
● דינסט ריקווייערז געוועב סאַמפּאַלז, אַנשטאָט פון יקסטראַקטיד נוקלעיק אַסאַדז, צו קרייַז-לינק מיט פאָרמאַלדאַכייד און קאַנסערוו די דנאַ פּראָטעין ינטעראַקשאַנז.
● די הי-C עקספּערימענט ינוואַלווז ריסטריקשאַן און ענדיקן פאַרריכטן פון די קלעפּיק ענדס מיט ביאָטין, נאכגעגאנגען דורך סערקיאַלאַזיישאַן פון די ריזאַלטינג אָפן ענדס בשעת פּראַזערווינג די ינטעראַקשאַנז. די דנאַ איז דאַן פּולד אַראָפּ מיט סטרעפּווידיאַן קרעלן און פּיוראַפייד פֿאַר סאַבסאַקוואַנט ביבליאָטעק צוגרייטונג.
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
איבערבליק פון הי-C
(Lieberman-עיאַנס און על.,וויסנשאַפט2009)
●ילימאַנייטינג די נויט פֿאַר גענעטיק באַפעלקערונג דאַטן:הי-C סאַבסטאַטוץ די יקערדיק אינפֿאָרמאַציע פארלאנגט פֿאַר קאַנטיאָן אַנגקערינג.
●הויך מאַרקער געדיכטקייַט:לידינג צו אַ הויך קאַנטיאָן אַנקערינג פאַרהעלטעניש העכער 90%.
●עקסטענסיווע עקספּערטיז און ויסגאַבע רעקאָרדס:במקגענע האט וואַסט דערפאַרונג מיט מער ווי 2000 קאַסעס פון הי-C גענאָמע פֿאַרזאַמלונג פון 1000 פאַרשידענע מינים און פאַרשידן פּאַטענץ. איבער 200 ארויס קאַסעס האָבן אַ אַקיומיאַלאַטיוו פּראַל פאַקטאָר פון איבער 2000.
●העכסט באָקע ביאָינפאָרמיטיאָנס מאַנשאַפֿט:מיט די פּאַטענץ פון די הויז פּאַטענץ און ווייכווארג קאָו יקספּעראַמאַנץ און דאַטן אַנאַליסיס, די זעלבסט-דעוועלאָפּעד וויסואַליזאַטיאָן דאַטן ווייכווארג יניימז מאַנואַל בלאָק מאָווינג, ריווערינג, ריוואָוינג און רעדאָוינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רידוסינג און רעדאָוינג.
●שטיצן פֿאַר פּאָסטן-פארקויפונג:אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
●פולשטענדיק אַנאָטאַציע: מיר נוצן קייפל דאַטאַבייסיז צו פאַרמיננלי אַנאַטייט די גענעס מיט יידענאַפייד ווערייישאַנז און דורכפירן די קאָראַספּאַנדינג ענריטשמענט אַנאַליסיס, צושטעלן ינסייפיץ אויף קייפל פאָרשונג פּראַדזשעקס.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| ביבליאָטעק צוגרייטונג | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | רעקאַמענדיד דאַטן רעזולטאַט | קוואַליטעט קאָנטראָל |
| הי-C ביבליאָטעק | Illumina Noveq PE150 | 100 קס | Q30 ℃ 85% |
מוסטער באדערפענישן
| געוועב | פארלאנגט סומע |
| כייַע וויסקערז | ≥ 2 ג |
| כייַע מוסקל | |
| מאַממאַליאַן בלוט | ≥ 2 מל |
| אָף / פיש בלוט | |
| פּלאַנט-פריש בלאַט | ≥ 3 ג |
| קאַלטשערד סעלז | ≥ 1 קס 107 |
| ינסעקט | ≥ 2 ג |
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
1) רוי דאַטאַ קק
2) הי-ס ביבליאָטעק קק: אָפּשאַצונג פון גילטיק הי-C ינטעראַקשאַנז
3) הי-C פֿאַר אַסעמבליטי: קלאַסטערינג פון קאַנטיניז אין גרופּעס, נאכגעגאנגען דורך קאַנטיג אָרדערינג אין יעדער גרופּע און באַשטימען קאַנטיאָן
4) הי-C אפשאצונג
הי-C ביבליאָטעק קק - אָפּשאַצונג פון הי-C גילטיק ינטעראַקשאַן פּערז
הי-C פֿאַרזאַמלונג - סטאַטיסטיק
פּאָסטן-אַסעמבלי געזאָגט - העאַטמאַפּ פון סיגנאַל ינטענסיטי צווישן בינס
ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene's Hi-C פֿאַרזאַמלונג באַדינונגס דורך אַ געהאלטן זאַמלונג פון אויסגאבעס.
טיאַן, טי עט על. (2023) 'גענאָמע פֿאַרזאַמלונג און גענעטיק דייסעקשאַן פון אַ באַוווסט טריקעניש-קעגנשטעליק מייז גערמפּלאַסץ', נאַטור גענעטיקס 2023 55: 3, 55 (3), פּפּ. 496-50-506. DOI: 10.1038 / S41588-023-01297-י.
וואַנג, זל עט על. (2020) 'א כראָמאָסאָם-וואָג פֿאַרזאַמלונג פון די אַסיאַן האָניקעבעע אַפּיס סעראַנאַ גענאָמע', פראָנטיערס אין דזשאַנעטיקס, 11, פּ. 524140. DOI: 10.33389 / Fgeene.2020.00279 / BIBTEX.
זשאַנג, פ. עט על. (2023) 'ריווילינג עוואָלוציע פון טראָפּאַנע אַלקאַלויד ביאָסינטאַסטיק דורך אַנאַלייזינג צוויי גענאָמעס אין די סאָלאַנאַסעאַע משפּחה', נאַטור קאָמוניקאַציע 2023 14: 1, 14 (1), פּפּ. 1-1), פּפּ. 1-18), פּפּ. 1-18. DOI: 10.1038 / S41467-023-37133-4.
זשאַנג, אַקס. עט על. (2020) 'גענאָמעס פון די באַניאַן בוים און פּאַלינאַטאָר וועסטפּ צושטעלן ינסייץ אין פיגוו-וועספּ קאָעוואָלוטיאָן', צעל, 183 (4), פּפּ. 875-889.E17. DOI: 10.1016 / J.Cell.2020.09.09.043
