הי-C באזירט טשראָמאַטין ינטעראַקשאַן
סערוויס פֿעיִקייטן
● סיקוואַנסינג אויף Illumina NovaSeq מיט PE150.
● סערוויס ריקווייערז געוועב סאַמפּאַלז, אַנשטאָט פון יקסטראַקטיד נוקלעיק אַסאַדז, צו קרייַז-לינק מיט פאָרמאַלדאַכייד און קאַנסערוו די דנאַ-פּראָטעין ינטעראַקשאַנז.
● די הי-C עקספּערימענט ינוואַלווז ריסטריקשאַן און סוף פאַרריכטן פון די קלעפּיק ענדס מיט ביאָטין, נאכגעגאנגען דורך סערקיאַלאַזיישאַן פון די ריזאַלטינג אָפן ענדס בשעת פּראַזערווינג די ינטעראַקשאַנז. די דנאַ איז דעמאָלט פּולד אַראָפּ מיט סטרעפּטאַווידין קרעלן און פּיוראַפייד פֿאַר סאַבסאַקוואַנט ביבליאָטעק צוגרייטונג.
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●אָפּטימאַל ריסטריקשאַן ענזיים פּלאַן: צו ענשור אַ הויך הי-C עפעקטיווקייַט אויף פאַרשידענע מינים מיט אַרויף צו 93% גילטיק ינטעראַקשאַן פּערז.
●ברייט עקספּערטיז און ויסגאַבע רעקאָרדס:BMKGene האט וואַסט דערפאַרונג מיט> 2000 הי-C סיקוואַנסינג פּראַדזשעקס פון 800 פאַרשידענע מינים און פאַרשידן פּאַטענץ. איבער 100 ארויס קאַסעס מיט אַ אַקיומיאַלאַטיוו פּראַל פאַקטאָר פון איבער 900.
●העכסט באָקע ביאָינפאָרמאַטיקס מאַנשאַפֿט:מיט אין-הויז פּאַטענץ און ווייכווארג קאַפּירייץ פֿאַר Hi-C יקספּעראַמאַנץ און דאַטן אַנאַליסיס און אַ זיך-דעוועלאָפּעד וויזשוואַלאַזיישאַן דאַטן ווייכווארג.
●פּאָסטן-סאַלעס שטיצן:אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. בעשאַס דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכגיין-אַרויף, טראָובלעשאָאָטינג הילף און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייַכות צו די רעזולטאַטן.
●פולשטענדיק אַנאָטאַציע: מיר נוצן קייפל דאַטאַבייסיז צו פאַנגקשאַנאַלי אַנאַטייט די גענעס מיט יידענאַפייד ווערייישאַנז און דורכפירן די קאָראַספּאַנדינג ענריטשמענט אַנאַליסיס, פּראַוויידינג ינסייץ אויף קייפל פאָרשונג פּראַדזשעקס.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | רעקאָממענדעד דאַטן רעזולטאַט | הי-C סיגנאַל האַכלאָטע |
| הי-C ביבליאָטעק | Illumina PE150 | טשראָמאַטין שלייף: 150x גרייס: 50x | טשראָמאַטין שלייף: 10Kb גרייס: 40Kb |
סערוויס רעקווירעמענץ
| מוסטער טיפּ | פארלאנגט סומע |
| כייַע געוועב | ≥2ג |
| גאַנץ בלוט | ≥2מל |
| פונגי | ≥1ג |
| פּלאַנט - יונג געוועב | 1 ג / אַליקוואָט, 2-4 אַליקוואַץ רעקאַמענדיד |
| קולטור סעלז | ≥1x107 |
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
● רוי דאַטן קק;
● מאַפּינג און הי-C ביבליאָטעק QC: גילטיק ינטעראַקשאַן פּערז און ינטעראַקשאַן דעקייַ עקספּאָנענטס (ידעס);
● גענאָמע-ברייט ינטעראַקשאַן פּראָפילינג: סיס / טראַנס אַנאַליסיס און הי-C ינטעראַקשאַן מאַפּע;
● אַנאַליסיס פון אַ / ב אָפּטייל פאַרשפּרייטונג;
● לעגיטימאַציע פון טאַדס און טשראָמאַטין לופּס;
● דיפפערענטשאַל אַנאַליסיס אויף 3 ד טשראָמאַטין סטרוקטור עלעמענטן צווישן סאַמפּאַלז און קאָראַספּאַנדינג פאַנגקשאַנאַל אַנאָטיישאַן פון פֿאַרבונדן גענעס.
סיס און טראַנס פּראָפּאָרציע פאַרשפּרייטונג
העאַטמאַפּ פון טשראָמאָסאָמאַל ינטעראַקשאַנז צווישן סאַמפּאַלז
גענאָמע-ברייט פאַרשפּרייטונג פון א / ב קאַמפּאַרטמאַנץ
גענאָמע-ברייט פאַרשפּרייטונג פון טשראָמאַטין לופּס
וויסואַליזאַטיאָן פון TADs
ויספאָרשן די פאָרשונג אַדוואַנטידזשיז פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene ס Hi-C סיקוואַנסינג באַדינונגס דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.
מענג, טי עט על. (2021) 'א קאָמפּאַראַטיווע ינאַגרייטיד מולטי-אָמיקס אַנאַליסיס יידענאַפייד CA2 ווי אַ ראָמאַן ציל פֿאַר קאָרדאָמאַ',נעוראָ-אָנקאָלאָגי, 23 (10), זז 1709-1722. דאָי: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
זו, ל עט על. (2021) '3 ד דיסאָרגאַנאַזיישאַן און ריעריינדזשמאַנט פון גענאָמע צושטעלן ינסייץ אין פּאַטאַדזשענעסיס פון NAFLD דורך ינאַגרייטיד הי-C, נאַנאָפּאָרע און רנאַ סיקוואַנסינג',Acta Pharmaceutica Sinica B, 11 (10), זז 3150-3164. דאָי: 10.1016/דזש.אַפּסב.2021.03.022.
