פול-לענג מינאַ סיקוואַנסינג-נאַנאָפּאָרע
פֿעיִקייטן
רייזע פון פּאָלי - א מרנאַ נאכגעגאנגען דורך CDNA סינטעז און ביבליאָטעק צוגרייטונג
● סיקוואַנסינג פון די פול-לענג טראַנסקריפּץ
ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס באזירט אויף אַליינמאַנט צו אַ דערמאָנען גענעם
● ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס כולל ניט בלויז אויסדרוק אין דזשין און יסאָפים-מדרגה, אָבער אויך אַנאַליסיס פון לנקנאַ, דזשין פיוזשאַנז, פּאָלי-אַדעניליישאַן און דזשין-אַדעניאַליישאַן און דזשין סטרוקטור
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●קוואַנטאַפאַקיישאַן פון אויסדרוק אין די יסאָפאָרם מדרגה: ענייבאַלינג דיטיילד און פּינטלעך אויסדרוק אַנאַליסיס, אַנוווילינג ענדערונג וואָס קען זיין מאַסקט ווען אַנאַלייזינג די גאנצע דזשין אויסדרוק
●רידוסט דאַטן פאדערונגען:קאַמפּערד צו ווייַטער-גענעראַטיאָן סיקוואַנסינג (נגס), נאַנאָפּאָרע סיקוואַנסינג יגזיבאַץ נידעריקער דאַטן באדערפענישן, אַלאַוינג פֿאַר עקוויוואַלענט לעוועלס פון דזשין עקספּרעססיאָן קוואַנטאַפאַקיישאַן.
●העכער אַקיעראַסי פון אויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן: ביידע אין דזשין און יסאָופאָרם מדרגה
●לעגיטימאַציע פון נאָך טראַנסקריפּטאָמיק אינפֿאָרמאַציע: אָלטערנאַטיוו פּאָליאַדענייליישאַן, Fusion גענעס און LCNRNA און זייער ציל גענעס
●עקסטענסיווע עקספּערטיז: אונדזער מאַנשאַפֿט ברענגט אַ עשירות פון דערפאַרונג צו יעדער פּרויעקט, ווייל געענדיקט איבער 850 נאַנאָפּאָרע קעגן-לענג טראַנסקריפּטאָמע פּראַדזשעקס און פּראַסעסט דורך 8,000 סאַמפּאַלז.
●שטיצן פון פּאָסטן-פארקויפונג: אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
מוסטער באדערפענישן און עקספּרעס
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד | קוואַליטעט קאָנטראָל |
| פּאָלי אַ ענריטשט | ילומינאַ פּע 150 | 6/12 גיגאבייט | דורכשניטלעך קוואַליטעט כעזשבן: Q10 |
מוסטער באדערפענישן:
נוקלעאָטידעס:
| Conc. (נג / μ ל) | סומע (μ ג) | ריינקייַט | אָרנטלעכקייַט |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 אָד 260/230 = 0.5-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | פֿאַר געוויקסן: rin≥7.0; פֿאַר אַנימאַלס: rin≥7.5; 5.018 ס / 18 ס 1.10.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעלינע. |
● געוויקסן:
וואָרצל, סטעם אָדער קרוינבלעטל: 450 מג
בלאַט אָדער זוימען: 300 מג
פרוכט: 1.2 ג
● כייַע:
האַרץ אָדער קישקע: 300 מג
וויסעראַ אָדער מאַרך: 240 מג
מוסקל: 450 מג
ביינער, האָר אָדער הויט: 1 ג
● אַרטראַפּאַדז:
ינסעקץ: 6 ג
קראַסטאַסאַ: 300 מג
● גאַנץ בלוט: 1 רער
● סעלז: 106 סעלז
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
קאַנטיינער: 2 מל סענטרייפוג רער (צין שטער איז נישט רעקאַמענדיד)
מוסטער לייבאַלינג: גרופּע + רעפּלאַקייט ע.יו.000 A1, A2, A3; B1, B2, B3.
טראַנספּאָרט:
1. טרוקן-ייַז: סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּאַקט אין באַגס און בעריד אין טרוקן ייַז.
2. רנאַסטאַבאַל טובז: רנאַ סאַמפּאַלז קענען זיין דאַר אין RNN סטייבאַלאַז טוב (למשל רנאַסטאַבאַל®) און שיפּט אין צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס אַרבעט לויפן
נוקלעאָטידעס:
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
סערוויס אַרבעט לויפן
געוועב:
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
● רוי דאַטן פּראַסעסינג
טראַנסקריפּט לעגיטימאַציע
● אָלטערנאַטיוו ספּלייסינג
● אויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן אין דזשין מדרגה און ייפאָרם מדרגה
● דיפערענטשאַל אויסדרוק אַנאַליסיס
● פונקציע אַנאַטיישאַן און ענריטשמענט (דעגס און דיץ)
אָלטערנאַטיוו ספּלייסינג אַנאַליסיס
אָלטערנאַטיוו פּאָליאַדענייליישאַן אַנאַליסיס (אַפּאַ)
lncrna prtixtion
אַנאָטאַציע פון ראָמאַן גענעס
קלאַסטערינג פון דיץ
פּראָטעין-פּראָטעין נעטוואָרקס אין דילז
ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGENEN ס נאַנאָפּאָרע פול-לענג Mrna סיקוואַנסינג באַדינונגס דורך אַ געהאלטן זאַמלונג פון אויסגאבעס.
גאָנג, ב. עט על. (2023) 'עפּיגענעטיק און טראַנסקריפּטיאָנאַל אַקטאַוויישאַן פון די סעקרעטאָרי, פאַמאָוס אין קלייאָמאַ', זשורנאַל פון דזשאַנעטיקס און גענעטיק, 50 (6), פּפּ. 422-433-433. DOI: 10.1016 / J.JGG.2023.01.008.
ער, ז. עט על. (2023) 'פול-לענג טראַנסקריפּטאַרט סיקוואַנסינג פון לימפאָסיטעס רעספּאָנד צו IFN-γ ריווילז אַ טה 1 ריוועד ימיון ענטפער אין פליאָנדהיס אָוליסיוס)', פיש & שעלפיש יממונאָלאָגי, 134, פּ. 108636. DOI: 10.1016 / J.FSI.2023.108636.
מאַ, י. עט על. (2023) 'קאָמפּאַראַטיווע אַנאַליסיס פון פּאַקביאָ און אויך רנאַ סיקוואַנסינג מעטהאָדס פֿאַר נעמפּילעמאַ נאָומורי ווענום לעגיטימאַציע', גענאָמיקס, 115 (6), פּ. 110709. DOI: 10.1016 / J.YGeno.2023.11070709.
יו, די עט על. (2023) 'נאַנאָ-ס.ק. אַנאַליסיס ריווילז פאַרשידענע פאַנגקשאַנאַל טענדענץ צווישן עקסאָסאָמעס און מיקראָוועסיקלעס דערייווד פון המסק', סטעם צעל פאָרשונג און טעראַפּיע, 14 (1), פּפּ. 1-13. DOI: 10.1186 / S13287-023-03491-5 / טאַבלעס / 6.
