עוואַלושאַנערי דזשאַנעטיקס
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
טאַקאַגי עט על.,דער פאַבריק דזשאָורנאַל2013
●פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס:געבן די אָפּשאַצונג פון גענעטיק דייווערסיטי, וואָס ריפלעקס די עוואָלוטיאָנאַרי פּאָטוראָ פּאָטענציעל פון מינים, און ריווילינג פאַרלאָזלעך פאַלאָגענעטיק באַציונג צווישן מינאַמייזד השפּעה פון קאַנווערזשאַן
●אָפּטיאָנאַל קאַסטאַמייזד אַנאַליסיס: אַזאַ ווי די אָפּשאַצונג פון דיווערגענסע צייט און גיכקייַט באזירט אויף ווערייישאַנז אין נוקלעאָטיע און אַמינאָ אַסאַדז מדרגה.
●עקסטענסיווע עקספּערטיז און ויסגאַבע רעקאָרדס: במקגענע האט אַקיומיאַלייטיד מאַסיוו דערפאַרונג אין באַפעלקערונג און עוואָלוטיאָנאַרי דזשאַנעטיקס פּראַדזשעקס פֿאַר איבער 15 יאָר, און דעקן טויזנטער פון מיטינג צו איבער 1000 פּיאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל, עטק.
● העכסט באָקע ביאָינפאָרמאַטיק מאַנשאַפֿט און קורץ אַנאַליסיס ציקל: מיט גרויס דערפאַרונג אין אַוואַנסירטע גענאָמיקס אַנאַליסיס, במקגענע מאַנשאַפֿט דעלייווערס פולשטענדיק אַנאַליזעס מיט אַ ביסטרע טערנעראַונד צייט.
● פּאָסטן-פארקויפונג שטיצן:אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז און באדערפענישן
| טיפּ פון סיקוואַנסינג | רעקאַמענדיד באַפעלקערונג וואָג | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | נוקלעאָדינג רעקווירעמענץ |
| גאַנץ גענאָמע סיקוואַנסינג | ≥ 30 מענטשן, מיט ≥ 10 מענטשן פון יעדער סובגרופּ
| 10 קס | קאָנסענטראַטיאָן: ≥ 1 נג / μ אָ גאַנץ סומע 30נג לימיטעד אָדער קיין דערנידעריקונג אָדער קאַנטאַמאַניישאַן |
| ספּעציפיש-לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט (סלאַף) | טאַג טיפעניש: 10 קס נומער פון טאַגס: <400 מעגאבייטן: ווגס איז רעקאַמענדיד <1 גב: 100 ק טאַגס 1 גב > 2 גב: 300 ק טאַגס מאַקסימום טאַגס | קאַנסאַנטריישאַן ≥ 5 נג / μ אָ גאַנץ סומע ≥ 80 נג Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5 אַגאַראָסע געל: קיין אָדער לימיטעד דערנידעריקונג אָדער קאַנטאַמאַניישאַן
|
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
סערוויס כולל אַנאַליסיס פון באַפעלקערונג סטרוקטור (פילאָגענעטיק בוים, קוויק, באַפעלקערונג סטראַטאַפאַקיישאַן טשאַרט), באַפעלקערונג דיפּאַטוריז, און באַפעלקערונג סעלעקציע (לינגקאַדזש דיסעוויליבריום, סעלעקטיוו ויסקערן-סעלעקציע פון אַדוואַגאָוס-סעלעקציע פון אַדוואַנטיידזשאַס זייטלעך). די דינסט קענען אויך אַרייַנגערעכנט קאַסטאַמייזד אַנאַליסיס (למשל דיווערדזשענסע צייט, גענע לויפן).
*דעמאָ רעזולטאַטן געוויזן דאָ זענען אַלע פֿון גענאָמעס ארויס מיט במקגענע
1. עוואָלוטיאָן אַנאַליסיס כּולל קאַנסטראַקשאַן פון פילאָגענעטיק בוים, באַפעלקערונג סטרוקטור און פּקאַ באזירט אויף גענעטיק ווערייישאַנז.
פאַלאָגענעטיק בוים רעפּראַזענץ טאַקסאָנאָמיק און עוואָלוטיאָנאַרי באציונגען צווישן מינים מיט פּראָסט אַנסעסטאָר.
פּקאַ יימז צו וויזשוואַלייז נאָענטנאַס צווישן סאַב-פּאַפּיאַליישאַנז.
באַפעלקערונג סטרוקטור ווייזט די בייַזייַן פון דזשאַנעטיקלי בוילעט סאַב-באַפעלקערונג אין טערמינען פון אַלעל פריקוושיווז.
טשען, עט. al.,Pnas, 2020
2. סעלעקטיוו ויסקערן
סעלעקטיוו ויסקערן רעפערס צו אַ פּראָצעס דורך וואָס אַ אַדוואַנטיידזשאַס פּלאַץ איז אויסגעקליבן און פריקווענסי פון לינגקט נייטראַל זייטלעך זענען געוואקסן און די פון אַנלינקד זייטלעך זענען דיקריסט, ריזאַלטינג, ריזאַלטינג, ריזאַלטינג, ריזאַלטינג אין רעדוקציע פון רעגיאָנאַל.
גענאָמע-ברייט דיטעקשאַן אויף סעלעקטיוו ויסקערן מקומות איז פּראַסעסט דורך קאַלקיאַלייטינג באַפעלקערונג גענעטיק ינדעקס (π, fst, tjima's d) פון אַלע סנפּס אין אַ סליידינג פֿענצטער (100 קב) אין זיכער שריט (10 קב) אין זיכער שריט (10 קב).
נוקלעאָטיד דייווערסיטי (π)
טאַדזשימאַ ס ד
פיקסיישאַן אינדעקס (fst)
ווו, עט. al.,מאָלעקולאַר פאַבריק2018
3.Gene לויפן
ווו, עט. al.,מאָלעקולאַר פאַבריק2018
4. דעמאָגראַפיק געשיכטע
זשאַנג, עט. al.,נאַטור עקאָלאָגי און עוואָלוציע, 2021
5.DiverGence צייט
זשאַנג, עט. al.,נאַטור עקאָלאָגי און עוואָלוציע, 2021
ויספאָרשן די עוואַלוניקאַנער פון די קאָנקגין ס עוואָלוטיאָנאַרי דזשאַנעטיקס באַדינונגס דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס:
Hassanyar, AK ET AL. (2023) 'ופדעקונג פון SNP מאָלעקולאַר מאַרקערס און קאַנדידאַט גענעס פֿאַרבונדן מיט Salbrolad Virus קעגנשטעל אין Apis Cerana Cerana Larvae דורך גאַנץ דזשענערע ריסוויסינג',אינטערנאַציאָנאַלע דזשאָורנאַל פון מאָלעקולאַר ססיענסעס, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS24076238.
טשיי, דזש. עט על. (2022) 'ופדעקונג פון אַ ווילד, דזשאַנעטיקלי ריין כינעזיש ריז סאַלאַמאַנדער קריייץ נייַ קאַנסערוויישאַן אַפּערטונאַטיזזאָאָלאָגיש פאָרשונג, 2022, Vol. 43, יושמענט 3, בלעטער: 469-480, 43 (3), פּפּ. 469-480. DOI: 10.24272 / J.issnsn.2095-8137.2022.101.
האַן, מ. עט על. (2022) 'אַפילאָגראָגראַפיקאַל מוסטער און באַפעלקערונג עוואָלוציע געשיכטע פון ינדידזשאַנאַס עלימוס סיביריקוס ל. אויף קינגהאַי-טיבעטאַן פּלאַטאָופראָנטירז אין פאַבריק וויסנשאַפֿט, 13, פּ. 882601. DOI: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX.
וואַנג, דזש. עט על. (2022) 'גענאָמיק ינסייץ אין לאָנגאַן עוואָלוציע פון אַ כראָמאָסאָם-מדרגה-מדרגה גענאָמע אַסעמבלי און באַפעלקערונג גענאָמיקס פון לאָנגאַן אַקסעססאָנס',כאָרטיקאַלטשער פאָרשונג, 9. DOI: 10.1093 / HR / UHAC021.
