Eukaryoic Mrna סיקוואַנסינג-נגס
פֿעיִקייטן
רייזע פון פּאָלי mrna איידער די ביבליאָטעק צוגרייטונג
● אָפּטיאָנאַל דירעקטיאָנאַל מינאַ ביבליאָטעק צוגרייטונג צו געבן די סטראַנד-ספּעציפיש סיקוואַנסינג דאַטן
● ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס פון גענע אויסדרוק און טראַנסקריפּט סטרוקטור
אַדוואַנטאַגעס
●עקסטענסיווע עקספּערטיז: אונדזער מאַנשאַפֿט האט פּראַסעסט איבער 600.000 סאַמפּאַלז ביי BMKGENE, ספּאַננינג דייווערס מוסטער טייפּס אַזאַ ווי צעל קאַלטשערז, געוועבן און גוף פלוידס. מיר ברענגען אַ עשירות פון דערפאַרונג צו יעדער פּרויעקט און האָבן הצלחה קאַמפּליטיד דורך 100,000 מרנאַ-סעק פּראַדזשעקס אין פאַרשידן פאָרשונג דאָומיינז.
●שטרענג קוואַליטעט קאָנטראָל: מיר ינסטרומענט האַרץ קאָנטראָל פונקטן אַריבער אַלע סטאַגעס, פֿון מוסטער און ביבליאָטעק צוגרייטונג צו סיקוואַנסינג און ביאָינפאָרמאַטיקס. דעם מאַטיקיאַלאַס מאָניטאָרינג ינשורז די עקספּרעס פון קאָנסיסטענטלי הויך-קוואַליטעט רעזולטאַטן, פאַרזיכערן איר אַז דיין פּרויעקט איז אין פאַרלאָזלעך הענט.
●פולשטענדיק אַנאָטאַציע: מיר נוצן קייפל דאַטאַבייסיז צו פאַרמינערן דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט גענעס (דעגס) און דורכפירן קאָראַספּאַנדינג ענריטשמענט אַנאַליזעס. דעם פולשטענדיק צוגאַנג גיט ינסייץ אין די סעליאַלער און מאָלעקולאַר פּראַסעסאַז אַנדערלייינג די טראַנסקריפּטאַרט ענטפער, וואָס ינשורינג איר זענט גאָר ינפאָרמד וועגן די רעזולטאַטן פון דיין פּרויעקט.
●שטיצן פון פּאָסטן-פארקויפונג: אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
מוסטער באדערפענישן און עקספּרעס
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד | קוואַליטעט קאָנטראָל |
| פּאָלי אַ ענריטשט | ילומינאַ פּע 150 דנביסק-ט 7 | 6 -10 גיגאבייט | Q3085% |
מוסטער באדערפענישן:
נוקלעאָטידעס:
| Conc. (נג / μ ל) | סומע (μ ג) | ריינקייַט | אָרנטלעכקייַט | |
| נאָרמאַל ביבליאָטעק | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 אָד 260/230 = 0.5-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | פֿאַר געוויקסן: rin≥4.0; פֿאַר אַנימאַלס: rin≥4.5; 5.018 ס / 18 ס 1.10.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעלינע. |
| דירעקטיאָנאַל ביבליאָטעק | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 אָד 260/230 = 0.5-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | פֿאַר געוויקסן: rin≥4.0; פֿאַר אַנימאַלס: rin≥4.5; 5.018 ס / 18 ס 1.10.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעלינע. |
● געוויקסן:
וואָרצל, סטעם אָדער קרוינבלעטל: 450 מג
בלאַט אָדער זוימען: 300 מג
פרוכט: 1.2 ג
●כייַע:
האַרץ אָדער קישקע: 300 מג
וויסעראַ אָדער מאַרך: 240 מג
מוסקל: 450 מג
ביינער, האָר אָדער הויט: 1 ג
● אַרטראַפּאַדז:
ינסעקץ: 6 ג
קראַסטאַסאַ: 300 מג
● גאַנץ בלוט: 1 רער
● סעלז: 106 סעלז
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
קאַנטיינער: 2 מל סענטרייפוג רער (צין שטער איז נישט רעקאַמענדיד)
מוסטער לייבאַלינג: גרופּע + רעפּלאַקייט ע.יו.000 A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
טראַנספּאָרט:
1. טרוקן-ייַז: סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּאַקט אין באַגס און בעריד אין טרוקן ייַז.
2. RNAS טיש טובעס: רנאַ סאַמפּאַלז קענען זיין דאַר אין RNN סטייבאַלאַז טוב (למשל רנאַסטאַבאַל®) און שיפּט אין צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
ביאָינפאָרמאַטיקס
Ukariotic מרנאַ סיקוואַנסינג אַנאַליסיס וואָרקפלאָוו
ביאָינפאָרמאַטיקס
Øרוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
Øדערמאָנען דזשאָון אַליינמאַנט
Øטראַנסקריפּט סטרוקטור אַנאַליסיס
Øאויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן
Øדיפערענטשאַל אויסדרוק אַנאַליסיס
Øפונקציע אַנאָטאַציע און ענריטשמענט
דערמאָנען דזשאָון אַליינמאַנט
דאַטן זעטיקונג
מוסטער קאָראַליישאַן און אַסעסמאַנט פון בייאַלאַדזשיקאַל רעפּליקייץ
דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט גענעס (דעגס)
פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן פון דילז
פאַנגקשאַנאַל ענריטשמענט פון דילז
ויספאָרשן די Eukariotation פון BMKGene.
הואַנג, ל עט על. (2023) 'טריקלאָסאַן און טריקלאָאָקבאַן וויקאַן די אָלפאַקטאָרי קאַפּאַציטעט פון גאָלדפיש דורך קאַנסטריינינג אָדאָראַנט דערקענונג, דיסראַפּטינג אָלפאָלז פון אָלפאַקטאָרי, און דיסטורבינג אָלפאַקטאָרי אינפֿאָרמאַציע, 333, 333, וואסער פאָרשונג, 233, פּ. 119736. DOI: 10.1016 / J.watres.2023.119736.
דזשיאַ, LJ ET AL. (2023) 'Aspergillus fumigatus hijacks human p11 to redirect fungal-containing phagosomes to non-degradative pathway', Cell Host & Microbe, 31(3), pp. 373-388.e10. DOI: 10.1016 / J.Chom.2023.02.002.
דזשין, ק. עט על. (2022) 'טקפּ טראַנסקריפּציע סיבות ינוואַלווד אין שיסן אַנטוויקלונג פון מיין באַמבו (דענדראָקאַלאַמוס לעטיאַטאָרוס מונראָ) ", פראָנטיר אין פאַבריק וויסנשאַפֿט, 13, פּ. 884443. DOI: 10.33389 / FPLS.2022.884443 / BIBTEX.
ווען X. עט על. (2022) 'The Chrysanthemum lavandulifolium genome and the molecular mechanism underlying diverse capitulum types', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
זשאַנג, יאָדזשיע עט על. (2023) 'אַ קאַסקייד נאַנאָרעאַקטאָר פֿאַר ענכאַנסינג סאָנאָדינאַמיק טעראַפּיע אויף קאָלאָרעקטאַל ראַק דורך קאָלאָרגיסטיק ראַסע און אַוטאָפאַגי בלאַקידזש', נאַנאָ הייַנט, 49, פּ. 101798. DOI: 10.1016 / J.Natnetod.2023.101798.
