פּלאַטפאָרמע | ביבליאָטעק גרייס | טעאָרעטיש דאַטן טראָגן (פּער צעל) | איין-באַזע אַקיעראַסי | אַפּלאַקיישאַנז |
נאַנאָפּאָרע | 8 קב, 10 קב, 20 קב, ולטראַלאָנג, CDNA-PCR | 70-90 גב / צעל | 85-92% | סוו פאַך, דאַוואָ, פול-לענג סיקוואַנסינג, ISO-SEQ, דזשין אַנאָטאַציע, דיטעקשאַן פון דנאַ מעטאַלאַטיאָן |
● איבער 5 יאָר דערפאַרונג אויף פּאַקביאָ סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע מיט טויזנטער פון פארמאכט פּראַדזשעקס מיט פאַרשידן מינים.
● במקגענע איז אַן באַאַמטער שוטעף פון אָקספֿאָרד נאַנאָפּאָרע, מיט צווייענדיק פּלאַטפאָרמע רנאַ / דנאַ סערטאַפאַקיישאַן.
● עס זענען מיינסטרים מאָדעלס פון סיקוואַנסערס מיט גאַנץ עקוויפּמענט און גענוג סיקוואַנסינג טרופּוט.
● באַזירט אויף די נאַנאָפּאָרע פּלאַטפאָרמע, מער ווי 10 כייַע און פאַבריק דענאָוואָ ריסערטשיז האָבן שוין ארויס אין ינטערנאַשנאַלי באַרימט דזשערנאַלז.
מוסטער טיפּ | סומע | קאָנסענטרטיאָן (קווביט ®) | באַנד | ריינקייַט | אנדערע |
גענאָמיק דנאַ | אָפענגען אויף דאַטן פאָדערונג | ≥20NG / μ אָ | ≥15μL | OD260 / 280 = 1.7-2.2; OD260 / 230≥1.5; קלאָר שפּיץ אויף 260 נם, קיין קאַנטאַמאַניישאַנז | קאָנסענטראַטיאָן דאַרף זיין געמאסטן דורך קווביט און קווביט / נאַנאָפּאָרע ≤ 2 |
גאַנץ רנאַ | ≥1.2 μ ג | ≥100μG / μ אָ | ≥15μL | OD260 / 280 = 1.7-2.5; OD260 / 230 = 0.5-2.5; קיין קאַנטאַמאַניישאַנז | רין ווערט ≥7.5 |
דאַטן קוואַליטעט אַסעסמאַנט פון דנאַ מוסטער
טיש 1. סטאַטיסטיק אויף ריין דאַטן.
במקיד | Rawseqnum | ראַשים | קינגסעקעקנום | קלינזומאַסע | קלינננ -2לען | קליננ - ליניע | קלעננאַנעאַן | קלינמאַקסלען | קלינרימענאָקוואַל |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
דאַטן קוואַליטעט אַסעסמאַנט פון רנאַ מוסטער
טיש 1. סטאַטיסטיק אויף ריין דאַטן.
פילענאַמע | קליענט | לייענער | Basenum | N50 | מענטאַסט | מאַקסלענגטסטה | Mentqussore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | ק 12 |
פיגורע 1. לייענען לאַנג פאַרשפּרייטונג
פיגורע 2. קוואַליטעט כעזשבן פאַרשפּרייטונג פון ריין דאַטן
פיגורע 3. לענג און קוואַליטעט כעזשבן פאַרשפּרייטונג פון ריין דאַטן