ילומאַ פאַר-געמאכט לייברעריז
פֿעיִקייטן
●פּלאַטפאָרמס:יללומאַ נאָוואַסעק 6000 און נאָוואַסעק רענטגענ פּלוס
●סיקוואַנסינג מאָדעס:פּע 150 און פּע 850
●קוואַליטעט קאָנטראָל פון לייברעריז איידער סיקוואַנסינג
●סיקוואַנסינג דאַטן קק און עקספּרעס:עקספּרעס פון קק באריכט און רוי דאַטן אין פאַסטק פֿאָרמאַט נאָך דעמולטיפּלעקסינג און פֿילטרירונג ק 30 לייענט
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●ווערסאַטילאַטי פון סיקוואַנסינג באַדינונגס:דער קונה קען קלייַבן צו סיקוואַנס דורך שטעג, לויפן צעל, אָדער לויט דאַטן פארלאנגט (פּאַרטיייש שטעג סיקוואַנסינג).
●ברייט דערפאַרונג אויף ילומאַ סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע:מיט טויזנטער פון פארמאכט פּראַדזשעקס מיט פאַרשידן מינים.
●עקספּרעס פון סיקוואַנסינג קק באריכט:מיט קוואַליטעט מעטריקס, דאַטן אַקיעראַסי און קוילעלדיק פאָרשטעלונג פון די סיקוואַנסינג פּרויעקט.
●דערוואַקסן סיקוואַנסינג פּראָצעס:מיט קורץ קער-אַרום צייט.
●שטרענג קוואַליטעט קאָנטראָל: מיר ינסטרומענט שטרענג קוו רעקווירעמענץ צו גאַראַנטירן די עקספּרעס פון קאָנסיסטענט הויך-קוואַליטעט רעזולטאַטן.
מוסטער פּלאַטפאָרמס
| פּלאַטפאָרמע | שטראָם צעל | סיקוואַנסינג מאָדע | אַפּאַראַט | עסטימאַטעד רעזולטאַט |
| Novaseq x | 10 ב (8 ליינז) | פּע 150 | איין שטעג פּאַרטיייש שטעג | 375 גב / שטעג |
| 25 ב (8 ליינז) | פּע 150 | איין שטעג פּאַרטיייש שטעג | 1000 גיגאבייט / שטעג | |
| נאָוואַס 6000 | SP לויפן צעל (2 ליינז) | PE250 | שטראָם צעל איין שטעג פּאַרטיייש שטעג | 325-400 עם לייענט / שטעג |
| S4 לויפן צעל (4 ליינז) | פּע 150 | שטראָם צעל איין שטעג פּאַרטיייש שטעג | ~ 800 גיגאבייט / שטעג |
מוסטער באדערפענישן
| דאַטן סומע (x) | קאַנסאַנטריישאַן (qpcr / nm) | באַנד | |
| פּאַרטיייש שטעג סיקוואַנסינג
| X ≤ 10 גיגאבייט | ≥ 1 נם | ≥ 25 μ ל |
| 10 GB <X ≤ 50 גיגאבייט | ≥ 2 נם | ≥ 25 μ ל | |
| 50 GB <X ≤ 100 גיגאבייט | ≥ 3 נם | ≥ 25 μ ל | |
| X> 100 גיגאבייט | ≥ 4 נם | ≥ 25 μ ל | |
| שטעג סיקוואַנסינג | פּער שטעג | ≥ 1.5 נם / ביבליאָטעק בעקן | ≥ 25 μ ל / ביבליאָטעק בעקן |
אין דערצו צו קאַנסאַנטריישאַן און גאַנץ סומע, אַ פּאַסיק שפּיץ מוסטער איז אויך פארלאנגט.
נאָטיץ: ליין סיקווענסינג פון נידעריק דייווערסיטי לייברעריז ריקווייערז פיקס ספּייק צו ענשור געזונט באַזע פאַך.
מיר רעקאָמענדירן צו פאָרלייגן פאַר-פּאָוללעד לייברעריז ווי סאַמפּאַלז. אויב איר דאַרפן במקגענע צו דורכפירן ביבליאָטעק פּאָאָללינג, ביטע אָפּשיקן צו
די ביבליאָטעק באדערפענישן פֿאַר פּאַרטיייש שטעג סיקוואַנסינג.
ביבליאָטעק גרייס (שפּיץ מאַפּע)
הויפּט שפּיץ זאָל זיין ין 300-450 בפּ.
לייברעריז זאָל האָבן אַ איין הויפּט שפּיץ, קיין אַדאַפּטער קאַנטאַמאַניישאַן און ניט אָנפאַנגער דימערס.
ביטע דערגרייכן אונדז אויב דיין סאַמפּאַלז טאָן ניט טרעפן די באדערפענישן פון מאַטעריאַלס.
סערוויס וואָרקפלאָוו
ביבליאָטעק קוואַליטעט קאָנטראָל
סיקוואַנסינג
דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
איסלעצער עקספּרעס
ביבליאָטעק קק באריכט
א מעלדונג אויף דער קוואַליטעט פון דער ביבליאָטעק איז צוגעשטעלט איידער סיקוואַנסינג, אַסעסינג ביבליאָטעק סומע און פראַגמאַנטיישאַן.
סיקוואַנסינג קק באריכט
טיש 1. סטאַטיסטיק אויף סיקוואַנסינג דאַטן.
| מוסטער שייַן | במקיד | רוי לייענט | רוי דאַטאַ (בפּ) | ריין לייענט (%) | Q20 (%) | ק 30 (%) | גק (%) |
| C_01 | Bmk_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | Bmk_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
פיגורע 1. קוואַליטי פאַרשפּרייטונג צוזאמען רידינג אין יעדער מוסטער
פיגורע 2. באַזע אינהאַלט פאַרשפּרייטונג
פיגורע 3. פאַרשפּרייטונג פון לייענען אינהאַלט אין סיקוואַנסינג דאַטן
