פול-לענג מינאַ סיקוואַנסינג -פּאַביאָ
פֿעיִקייטן
● CDNA סינטעז פון פּאָלי - אַ מרנאַ נאכגעגאנגען דורך ביבליאָטעק צוגרייטונג
● סיקוואַנסינג אין CCS מאָדע, דזשענערייטינג HiFi לייענט
● סיקוואַנסינג פון די פול-לענג טראַנסקריפּץ
● די אַנאַליסיס קען נישט נויטיקן אַ רעפֿערענץ גענאָמע; אָבער, עס קען זיין אנגעשטעלט
● ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס ינייבאַלז אַנאַליסיס פון טראַנסקריפּץ יסאָפאָרם לנקנאַ, דזשין פוזשאַנז, פּאָלי-אַדעניליישאַן און גענע סטרוקטור
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●הויך אַקיעראַסי: Hifi לייענט מיט אַקיעראַסי> 99.9% (ק 30), פאַרגלייַכלעך צו נגס
● אָלטערנאַטיוו ספּלייסינג אַנאַליסיס: סיקוואַנסינג פון די גאנצע טראַנסקריפּץ ינייבאַלז יסאָפאָרם לעגיטימאַציע און כאַראַקטעריזיישאַן
●עקסטענסיווע עקספּערטיז: מיט אַ שפּור רעקאָרד פון קאַמפּליטינג איבער 1100 פּאַקביאָ פול-לענג טראַנסקריפּטאַרטע פּראַדזשעקס און פּראַסעסינג איבער 2300 סאַמפּאַלז, אונדזער מאַנשאַפֿט ברענגט אַ עשירות פון דערפאַרונג צו יעדער פּרויעקט.
●שטיצן פון פּאָסטן-פארקויפונג: אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
מוסטער באדערפענישן און עקספּרעס
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד | קוואַליטעט קאָנטראָל |
| פּאָליאַ ענריטשט Mrna CCS ביבליאָטעק | Pacbio Sequel ii Pacbio Revio | 20/40 גיגאבייט 5/10 עם CCS | Q3085% |
מוסטער באדערפענישן:
נוקלעאָטידעס:
● געוויקסן:
וואָרצל, סטעם אָדער קרוינבלעטל: 450 מג
בלאַט אָדער זוימען: 300 מג
פרוכט: 1.2 ג
● כייַע:
האַרץ אָדער קישקע: 300 מג
וויסעראַ אָדער מאַרך: 240 מג
מוסקל: 450 מג
ביינער, האָר אָדער הויט: 1 ג
● אַרטראַפּאַדז:
ינסעקץ: 6 ג
קראַסטאַסאַ: 300 מג
● גאַנץ בלוט: 1 רער
● סעלז: 106 סעלז
| Conc. (נג / μ ל) | סומע (μ ג) | ריינקייַט | אָרנטלעכקייַט |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 אָד 260/230 = 0.5-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | פֿאַר געוויקסן: rin≥7.5; פֿאַר אַנימאַלס: rin≥8.0; יוני 28s / 18S≥1.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעלינע. |
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
קאַנטיינער: 2 מל סענטרייפוגער רער (צין שטער איז נישט רעקאַמענדיד)
מוסטער לייבאַלינג: גרופּע + רעפּלאַקייט ע.יו.000 A1, A2, A3; B1, B2, B3.
טראַנספּאָרט:
1. טרוקן-ייַז: סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּאַקט אין באַגס און בעריד אין טרוקן ייַז.
2. רנאַסטאַבאַל טובז: רנאַ סאַמפּאַלז קענען זיין דאַר אין RNN סטייבאַלאַז טוב (למשל רנאַסטאַבאַל®) און שיפּט אין צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטן אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגס
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
● רוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
● אָלטערנאַטיוו פּאָליאַדענייליישאַן אַנאַליסיס (אַפּאַ)
● פוסיאָן טראַנסקריפּט אַנאַליסיס
● אָלטערנאַטיוו ספּלייסינג אַנאַליסיס
● בענטשמאַרקינג וניווערסאַל איין-קאָפּיע אָרטאָלאָגס (Busco) אַנאַליסיס
● ראָמאַן טראַנסקריפּט אַנאַליסיס: פּראָגנאָז פון קאָדירונג סיקוואַנסיז (קאָמפּאַקטדיסק) און פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן
● לנקנאַ אַנאַליסיס: פּראָגנאָז פון לנקנאַ און טאַרגאַץ
● מיקראָסאַטעליט לעגיטימאַציע (ססר)
בוסקאָ אַנאַליסיס
אָלטערנאַטיוו ספּלייסינג אַנאַליסיס
אָלטערנאַטיוו פּאָליאַדענייליישאַן אַנאַליסיס (אַפּאַ)
פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן פון ראָמאַן טראַנסקריפּץ
ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGENEN ס נאַנאָפּאָרע פול-לענג Mrna סיקוואַנסינג באַדינונגס אין דעם פיטשערד ויסגאַבע.
מאַ, י. עט על. (2023) 'קאָמפּאַראַטיווע אַנאַליסיס פון פּאַקביאָ און אויך רנאַ סיקוואַנסינג מעטהאָדס פֿאַר נעמפּילעמאַ נאָומורי ווענום לעגיטימאַציע', גענאָמיקס, 115 (6), פּ. 110709. DOI: 10.1016 / J.YGeno.2023.11070709.
Chao, Q. et al. (2019) די דעוועלאָפּאַל דינאַמיק פון די פּאָפּולוס סטעם טראַנסקריפּטאָמע ', פאַבריק ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל, 17 (1), פּפּ. 206-219. DOI: 10.1111 / PBI.12958.
דענג, ה. עט על. (2022) 'דינאַמיש ענדערונגען אין אַסקאָרביק זויער אינהאַלט בעשאַס פרוכט אַנטוויקלונג און רייפּאַנידיאַ לאַטיפאָליאַ (אַ אַסקאָרבאַטע-רייַך פרוכט גערעטעניש) און די אינטערנאציאנאלע זשורנאַל פון מאָלעקולאַר ססיענסעס, 23 (10), פּ. 5808. DOI: 10.3390 / IJMS23105808 / S1.
הואַ, אַקס. עט על. (2022) 'עפעקטיוו פּראָגנאָז פון ביאָסינטעטיק פּאַטוויי גענעס ינוואַלווד אין ביאָאַקטיוו פּאָליפיללינס אין פּאַריז פּאָליפילאַ', קאָמוניקאַציע ביאָלאָגי 2022 5: 1, 5 (1), פּפּ. 1-10. DOI: 10.1038 / S42003-022-03000-ז.
ליו, מ. עט על. (2023) 'קאַמביינד פּאַקביאָ ISO-SEQ און Illumina Rna-SEQ אַנאַליסיס פון די טוטריקק) טראַנסקריפּטאָמע און סיטאָטשראָמע פּ 450 גענעס', ינסעקץ, 14 (4),. 363. DOI: 10.3390 / ינסעקץ 144040363 / S1.
Wang, lijun et al. (201. DOI: 10.1186 / S12864-019-5832-9.
