בולקט סעגרעגאַנט אַנאַליסיס
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
Takagi עט על., דער פאַבריק זשורנאַל, 2013
● פּינטלעך לאָוקאַלאַזיישאַן: מיקסינג בולקס מיט 30+30 צו 200+200 מענטשן צו מינאַמייז הינטערגרונט ראַש; ניט-סאַנאַנאַמאַס מיוטאַטאַנץ-באזירט קאַנדידאַט געגנט פּראָגנאָז.
● פולשטענדיק אַנאַליסיס: אין-טיפקייַט קאַנדידאַט דזשין פונקציע אַנאָטאַציע, אַרייַנגערעכנט NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, עטק.
● פאַסטער טערנעראַונד צייט: גיך דזשין לאָוקאַלאַזיישאַן ין 45 ארבעטן טעג.
● ברייט דערפאַרונג: BMK האט קאַנטריביוטיד אין טויזנטער פון טרייץ לאָוקאַלאַזיישאַן, קאַווערינג פאַרשידן מינים ווי קראַפּס, וואַסער פּראָדוקטן, וואַלד, בלומען, פירות, עטק.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
באפעלקערונג:
סעגרעגאַטינג נאָכקום פון עלטערן מיט אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס.
למשל פ 2 נאָכקום, באַקקראָססינג (בק), רעקאָמבינאַנט ינברעד שורה (ריל)
מיקסינג בעקן
פֿאַר קוואַליטאַטיווע טרייץ: 30-50 מענטשן (מינימום 20) / פאַרנעם
פֿאַר קוואַנטיטאַטיווע טראַטיס: שפּיץ 5% צו 10% מענטשן מיט עקסטרעם פענאָטיפּעס אין דער גאנצער באַפעלקערונג (מינימום 30+30).
רעקאַמענדיד סיקוואַנסינג טיפקייַט
אין מינדסטער 20 קס / פאָטער און 1 קס / זאמען יחיד (למשל פֿאַר זאמען מיקסינג בעקן פון 30 + 30 יחיד, סיקוואַנסינג טיפקייַט וועט זיין 30 קס פּער פאַרנעם)
ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס
● גאַנץ גענאָמע ריסעקווענסינג
● דאַטאַ פּראַסעסינג
● סנפּ / ינדעל פאַך
● קאַנדידאַט געגנט זיפּונג
● קאַנדידאַט דזשין פונקציאָנירן אַנאָטאַציע
מוסטער רעקווירעמענץ און עקספּרעס
מוסטער רעקווירעמענץ:
נוקלעאָטידע:
| גDNA מוסטער | געוועב מוסטער |
| קאַנסאַנטריישאַן: ≥30 נג/μל | געוויקסן: 1-2 ג |
| סומע: ≥2 μג (באַנד ≥15 μל) | אַנימאַלס: 0.5-1 ג |
| ריינקייַט: OD260/280= 1.6-2.5 | גאַנץ בלוט: 1.5 מל |
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
1.Association אַנאַליסיס באַזע אויף עוקלידיאַן דיסטאַנסע (עד) צו ידענטיפיצירן קאַנדידאַט געגנט. אין די פאלגענדע פיגור
X-אַקס: טשראָמאָסאָם נומער; יעדער פּונקט רעפּראַזענץ אַן עד ווערט פון אַ SNP. די שווארצע שורה שטימען צו פיטאַד עד ווערט. א העכער עד ווערט ינדיקייץ אַ מער באַטייטיק פאַרבאַנד צווישן דעם פּלאַץ און די פענאָטיפּע. רויט לאָך שורה רעפּראַזענץ שוועל פון באַטייַטיק פאַרבאַנד.
2.אַססאָסיאַטיאָן אַנאַליסיס באזירט קיין סנפּ-אינדעקס
X-אַקס: טשראָמאָסאָם נומער; יעדער פּונקט רעפּראַזענץ די SNP-אינדעקס ווערט. די שוואַרץ שורה שטייט פֿאַר פיטאַד SNP-אינדעקס ווערט. די גרעסערע די ווערט איז, די מער באַטייַטיק די פאַרבאַנד איז.
BMK קאַסע
די הויפּט-ווירקונג קוואַנטיטאַטיווע טרייט לאָקוס Fnl7.1 ענקאָודאַז אַ שפּעט עמבריאָגענעסיס שעפעדיק פּראָטעין פֿאַרבונדן מיט פרוכט האַלדז לענג אין וגערקע
ארויס: פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל, 2020
סיקוואַנסינג סטראַטעגיע:
עלטערן (Jin5-508, YN): גאַנץ גענאָמע ריסעקווענסינג פֿאַר 34 × און 20 ×.
דנאַ פּאָאָלס (50 לאַנג-האַלדז און 50 קורץ-האַלדז): רעסעקווענסינג פֿאַר 61 × און 52 ×
שליסל רעזולטאַטן
אין דעם לערנען, סעגרעגאַטינג באַפעלקערונג (F2 און F2:3) איז דזשענערייטאַד דורך אַריבער די לאַנג-האַלדז וגערקע שורה Jin5-508 און קורץ-האַלדז YN. צוויי דנאַ פּאָאָלס זענען קאַנסטראַקטאַד דורך 50 עקסטרעם לאַנג-האַלדז מענטשן און 50 עקסטרעם קורץ-האַלדז מענטשן. הויפּט-ווירקונג QTL איז יידענאַפייד אויף Chr07 דורך BSA אַנאַליסיס און טראדיציאנעלן QTL מאַפּינג. דער קאַנדידאַט געגנט איז געווען ווייַטער נעראָוד דורך פייַן-מאַפּינג, דזשין אויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן און טראַנסגעניק יקספּעראַמאַנץ, וואָס אנטפלעקט שליסל דזשין אין קאַנטראָולינג האַלדז-לענג, CsFnl7.1. אין אַדישאַן, פּאָלימאָרפיסם אין CsFnl7.1 פּראָמאָטער געגנט איז געווען פארבונדן מיט קאָראַספּאַנדינג אויסדרוק. ווייַטער פילאָגענעטיק אַנאַליסיס סאַגדזשעסטיד אַז Fnl7.1 לאָקוס איז זייער מסתּמא צו זיין ערידזשאַנייטאַד פון ינדיאַ.
 QTL-מאַפּינג אין BSA אַנאַליסיס צו ידענטיפיצירן קאַנדידאַט געגנט פֿאַרבונדן מיט וגערקע האַלדז לענג |  LOD פּראָופיילז פון וגערקע האַלדז-לענג QTL יידענאַפייד אויף Chr07 |
זו, X., עט על. "די הויפּט-ווירקונג קוואַנטיטאַטיווע טרייט לאָקוס Fnl7.1 ענקאָודאַז אַ שפּעט עמבריאָגענעסיס שעפעדיק פּראָטעין פֿאַרבונדן מיט פרוכט האַלדז לענג אין וגערקע." פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל 18.7 (2020).
