● מיט צוויי מעגלעך אָפּציעס צו קלייַבן פון דיפּענדינג אויף די געבעטן גראַד פון גענעם קאַמפּליטנאַס.
● פּלאַן גענאָמע אָפּציע: קורץ-לייענען סיקוואַנסינג מיט יללומאַ נאָוואַסעק פּע 150.
● פאַרענדיקן 0 ריס דזשין.
לאנג-געלייענט סיקוואַנסינג אויף נאַנאָפּאָרע פּראָמעטהיאָן 48 אָדער פּאַקביאָ רעוואָאָ פֿאַר גענאָמע פֿאַרזאַמלונג.
● קורץ-לייענען סיקוואַנסינג אויף יללומינאַ נאָוואַסעעק פֿאַר גענאָמע וואַלאַדיישאַן און טעות קערעקשאַן (נאַנאָפּאָרע) אָדער צו דזשענערייט אַ פּלאַן גענאָמע.
●נול-גאַפּ גענעם געראַנטיד: דאָס איז רעכט צו דער ינאַגריישאַן פון ילומאַ סיקוואַנסינג מיט לאַנג לייענען סיקוואַנסינג (נאַנאָפּאָרע אָדער פּאַקביאָ).
●גאַנץ ביאָינפאָרמאַטיקס וואָרקפלאָוו:דאָס כולל גענאָמע פֿאַרזאַמלונג און פאָרויסזאָגן פון קייפל גענאָמיק עלעמענטן, פאַנגקשאַנאַל דזשין אַנאָטאַציע, און גענאָמע וויסואַליסיישאַנז אַזאַ ווי צירקס פּלאַנעווען.
●עקסטענסיווע עקספּערטיז: מיט איבער 20,000 מיקראָביאַל גענאָמעס אַסעמבאַלד, במקגענע ברענגט איבער אַ יאָרצענדלינג פון דערפאַרונג, אַ העכסט באָקע אַנאַליסיס מאַנשאַפֿט, פולשטענדיק אינהאַלט, און ויסגעצייכנט סערוויסעס פֿאַר פּאָסטן-פארקויפונג, און ויסגעצייכנט פּאָסטן-פארקויפונג שטיצן.
●שטיצן פֿאַר פּאָסטן-פארקויפונג:אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון די פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט. אין דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכפאָלגן, טראָובלעשאָאָטינג הילף, און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייך צו די רעזולטאַטן.
●קייפל סיקוואַנסינג סטראַטעגיעס פאַראַנען:פֿאַר פאַרשידענע פאָרשונג גאָולז און באדערפענישן פון גענעם קאַמפּליטנאַס.
דינסט | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע |
פּלאַן גענאָמע | ילומאַ פּ ע 150 100 קס |
0 ריס דזשין | נאַנאָפּאָרע 100 קס + ילומאַ פּע 150 100 קס Or Pacbio HiFi 30x + Ilumina Pe150 100x (אַפּשאַנאַל) |
קאָנסענטראַטיאָן (נג / μ ל) | גאַנץ סומע (μ ג) | באַנד (μL) | אָד 260/280 | אָד 260/230 | |
פּאַקביאָ | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
נאַנאָפּאָרע | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
ילומאַ | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· באַקטיריאַ: ≥3.5x1010 סעלז
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
● סיקוואַנסינג דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
● גענאָמע פֿאַרזאַמלונג
М inekome קאָמפּאָנענט אַנאַליסיס: פּראָגנאָז פון קאָמפּאַקטדיסק און קייפל גענאָמיק עלעמענטן
● פאַנגקשאַנאַל אַנאָטאַציע מיט קייפל אַלגעמיינע דאַטאַבייסיז (גיין, קאג, אאז"ו ו) און אַוואַנסירטע דאַטאַבייסיז (קאָרט, וופדב, עטק)
● גענאָמע וויזשוואַלאַזיישאַן
מיר צושטעלן די גענאָמע אין אַ גרינג צוטריטלעך פאַסטאַ פֿאָרמאַט און די זשאַנאָם אַנאָטאַציע טעקע (GFF).
דזשין אַנאָטאַציע - גיין
דזשין אַנאָטאַציע - קאָזי קאַרבאָוכיידרייץ
גענאָמע וויזשוואַלאַזיישאַן - סירקאָס פּלאַנעווען
ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene ס באַקטיריאַל גענעם פֿאַרזאַמלונג באַדינונגס דורך אַ געהאלטן זאַמלונג פון אויסגאבעס.
Dai, w. et al. (2023) 'ופדעקונג פון באַקטעראָידז וניפאָרמיס פ18-22 ווי אַ זיכער און ראָמאַן פּראָביאָטיק באַקטעריום פֿאַר די באַהאַנדלונג פון ולסעראַטיווע קאָליטיס פון די געזונט מענטשלעך קאָלידאַן',אינטערנאַציאָנאַלע דזשאָורנאַל פון מאָלעקולאַר ססיענסעס, 24 (19), פּ. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
קאַנג, ק. עט על. (2021) 'מולטידרוג-קעגנשטעליק פּראָטעוס Melabilis יסאָלאַטעס קעריינג בלאַאָקסאַ -1 און בלאַנדם -1 פון וויילדלייף אין טשיינאַ: ינקריסינג עפנטלעך געזונט ריזיקירן',ינאַגריישאַן זאָאָלאָגי, 16 (6), פּפּ. 798-809. דאָי: 10.1111 / 1749-4877.12510.
וואַנג, טט עט על. (2017) 'גאַנץ דזשענערע סיקוואַנס פון ענדאָפיטע באַסיללוס פלעקסוס klbmp 4941 ריווילז זיין פאַבריק וווּקס העכערונג מעקאַניזאַם און גענעטיק יקער פֿאַר זאַלץ טאָלעראַנץ',זשורנאַל פון ביאָטעטשנאָלאָגי, 260, פּפּ. 38-41. DOI: 10.1016 / j.jbiotecteciw.2017.09.001.
וואַנג, אַקס. עט על. (2021) 'קייפל-רעפּליקאָן קעגנשטעל, פּלאַזמדס פון קלבסיעללעללאַ מעדיאַט ברייט דיספּענסינאַטיאָן פון אַנטימיקראָביאַל גענעס',פראָנטידערס אין מיקראָביאָלאָגי, 12, פּ. 754931. DOI: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / BIBTEX.