● סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע: Pacbio ravio
● סיקוואַנסינג מאָדע: CCS (HiFi לייענט)
● אַמפּליפיקאַציע פון ציל געגנט נאכגעגאנגען דורך טאַנדאַם פֿאַרבינדונג פון אַמפּליקאָנס איידער היפי SMRT Ball Libarip
●העכער טאַקסאָנאָמיק האַכלאָטע: ההאַן קורץ-ופּפּליאָן סיקוואַנסינג,אַלאַוינג העכער אָטו קלאַסאַפאַקיישאַן רייץ אין די מינים מדרגה.
●העכסט פּינטלעך באַזע פאַך: Pacbio CCS מאָדע סיקוואַנסינג (HIFI לייענט).
●אפגעזונדערטקייט-פריי: גיך לעגיטימאַציע פון מייקראָוביאַל זאַץ אין ינווייראַנמענאַל סאַמפּאַלז.
●וויידלי אָנווענדלעך: דייווערס מיקראָביאַל קהל שטודיום.
●פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס: די לעצטע Qimime2 פּעקל (קוואַנטיטאַטיווע ינסייט אין מיקראָביאַל עקאָלאָגי) מיט דייווערס אַנאַליזעס אין טערמינען פון דאַטאַבייס, אַנאָטאַציע, OTV.
●עקסטענסיווע עקספּערטיז: מיט טויזנטער פון טינקיאָן סיקוואַנסינג פּראַדזשעקס געהאלטן אַניואַלי, במקגענע ברענגט איבער אַ יאָרצענדלינג פון דערפאַרונג, אַ העכסט באָקע אַנאַליסיס מאַנשאַפֿט, פולשטענדיק אינהאַלט, און ויסגעצייכנט סערוויסעס שטיצן.
ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד |
פּופּליקאָן | Pacbio Revio | 10/30/50 ק טאַגס (CCS) |
קאָנסענטראַטיאָן (נג / μ ל) | גאַנץ סומע (μ ג) | באַנד (μL) |
≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
פרירן די סאַמפּאַלז אין פליסיק ניטראָגען פֿאַר 3-4 שעה און קראָם אין פליסיק ניטראָגען אָדער -80 גראַד צו לאַנג-טערמין רעזערוואַציע. מוסטער שיפּינג מיט טרוקן ייַז איז פארלאנגט.
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
● רוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
● אָטו קלאַסטערינג / דע-ראַש (ASV)
Otu אַנאָטאַציע
● אַלף דייווערסיטי אַנאַליסיס: קייפל ינדעקסיז, אַרייַנגערעכנט שאַננאָן, סימפּסאָן און מויז.
● ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס
● ינטער-גרופּע אַנאַליסיס
קאָראַליישאַן אַנאַליסיס: צווישן ינווייראַנמענאַל סיבות און אָוט זאַץ און דייווערסיטי
● 16 ס פאַנגקשאַנאַל דזשינט פּראָגנאָז
היסטאָגראַם פון טאַקסאָנאָמיק פאַרשפּרייטונג
קהל פאַרשפּרייטונג פילאָגענעטיק בוים
אַלף דייווערסיטי אַנאַליסיס: מויז
ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס: פּקאָאַ
ינטערגראָופּ אַנאַליסיס: Anova
ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene's Uplicon Sequencing Sequensing באַדינונגען מיט פּאַסאַביאָ דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.
Gao, x. און וואַנג, ה. (2023) 'קאָמפּאַראַטיווע אַנאַליסיס פון רומעניש באַקטיריאַל פּראָופיילז און פאַנגקשאַנז בעשאַס אַדאַפּטיישאַן צו פאַרשידענע פענאָלאָגי (רעגולער. 1), פּ. 16. DOI: 10.3390 / פערמאַנטיישאַן9010016 / S1.
Li, s. et al. (2023) 'קאַפּטשערינג די מייקראָוביאַל פינצטער ענין אין מדבר סוילז ניצן ספּולטוראָמיקס-באזירט מעטאַגענאָמיקס-באזירט מעטאַגענאָמיקס און הויך-האַכלאָטע אַנאַליסיס 2023 9: 1, 9 (1), פּפּ. 1-14-14. DOI: 10.1038 / S41522-023-00439-8.
מו, ל עט על. (2022) 'יפעקס פון פאַטי זויער סאָלץ אויף פערמאַנטיישאַן קעראַקטעריסטיקס, באַקטיריאַל דייווערסיטי און עראָוביק פעסטקייַט פון געמישט סילאַגע צוגעגרייט מיט אַלפאַלפאַ, רייז שטראָף פון די וויסנשאַפֿט פון עסנוואַרג און אַגריקולטורע, 102 (42 (252 (42 (42 (42 (2022). 1487. DOI: 10.1002 / jsfa.11482.
יאַנג, דזש. עט על. (2023) 'די ינטעראַקשאַן צווישן אָקסידאַטיווע דרוק בייאָמאַרקערס און קישקע מיקראָביאָטאַ אין די אַנטיאַקסאַדאַנט יפעקס פון אויסצוגן פון עקסטראַקץ פון סאָטשוס בראַטשיאָטוס דק. אין אָקסאַזאָלאָנע-ינדאַקייטיד ינטעסטאַנאַל אָקסידאַטיווע דרוק אין דערוואַקסן פּילז 2023, חלק. 12, זייַט 192, 12 (1), פּ. 192. דאָי: 10.3390 / אַנטיאָקס 12010192.