条形 Banner-03

פּראָדוקטן

16 ס / 18 ס / זייַן אַמפּליאָן סיקוואַנסינג-פּאַקביאָ

די 16 ס און 18 ס ררן גענעס, מיט די ינערלעך טראַנסקריבד ספּייסער (זיין) געגנט, דינען ווי אַ פּילז פון פּראָקאַריזינג מכשירים רעכט צו קעראַקטעראַפיישאַן פון פּראָקאַריקאָטיק אָרגאַנאַזיישאַן. אַמפּלאַפאַקיישאַן און סיקוואַנסינג פון די געגנטן פאָרשלאָגן אַן אפגעזונדערטקייט-פריי צוגאַנג פֿאַר ינוועסטאַגייטינג די מייקראָוביאַל זאַץ און דייווערסיטי אַריבער פאַרשידן יקאָוסיסטאַמז. While Illumina sequencing typically targets short hypervariable regions like V3-V4 of 16S and ITS1, it has been demonstrated that superior taxonomic annotation is achievable by sequencing the full length of 16S, 18S, and ITS. די פולשטענדיק צוגאַנג רעזולטאַטן אין העכער פּערסאַנטידזשיז פון אַקיעראַטלי קלאַסאַפייד סיקוואַנסיז, אַטשיווינג אַ הייך פון האַכלאָטע וואָס יקסטענדז צו מינים לעגיטימאַציע. Pacbio ס איין-מאַלאַקיול פאַקטיש-צייט (סמרט) סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע שטייט דורך דורך צושטעלן הויך אַפּלייז צו די פול-לענג וגלאַפּ די פיייקייט אַלאַוז פאָרטשערז צו דערגרייכן אַן גלייַכן די גלייַכן - אַ פּאַנאָראַמיק מיינונג פון די גענעטיק לאַנדשאַפט. די עקסטענדעד קאַווערידזש באטייטיק הייליונגען די האַכלאָטע אין מינים אַנאָטאַציע, דער הויפּט אין באַקטיריאַל אָדער פונגאַל קהילות, וואָס אַלאַוז אַ דיפּער פארשטאנד פון די ינטראַקאַסיז פון מייקראָוביאַל פּאַפּיאַליישאַנז.


דינסט דעטאַילס

ביאָינפאָרמאַטיקס

דעמאָ רעזולטאַטן

פיטשערד אויסגאבעס

סערוויס פֿעיִקייטן

● סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע: Pacbio ravio

● סיקוואַנסינג מאָדע: CCS (HiFi לייענט)

● אַמפּליפיקאַציע פון ​​ציל געגנט נאכגעגאנגען דורך טאַנדאַם פֿאַרבינדונג פון אַמפּליקאָנס איידער היפי SMRT Ball Libarip

סערוויס אַדוואַנטאַגעס

העכער טאַקסאָנאָמיק האַכלאָטע: ההאַן קורץ-ופּפּליאָן סיקוואַנסינג,אַלאַוינג העכער אָטו קלאַסאַפאַקיישאַן רייץ אין די מינים מדרגה.

העכסט פּינטלעך באַזע פאַך: Pacbio CCS מאָדע סיקוואַנסינג (HIFI לייענט).

אפגעזונדערטקייט-פריי: גיך לעגיטימאַציע פון ​​מייקראָוביאַל זאַץ אין ינווייראַנמענאַל סאַמפּאַלז.

וויידלי אָנווענדלעך: דייווערס מיקראָביאַל קהל שטודיום.

פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס: די לעצטע Qimime2 פּעקל (קוואַנטיטאַטיווע ינסייט אין מיקראָביאַל עקאָלאָגי) מיט דייווערס אַנאַליזעס אין טערמינען פון דאַטאַבייס, אַנאָטאַציע, OTV.

עקסטענסיווע עקספּערטיז: מיט טויזנטער פון טינקיאָן סיקוואַנסינג פּראַדזשעקס געהאלטן אַניואַלי, במקגענע ברענגט איבער אַ יאָרצענדלינג פון דערפאַרונג, אַ העכסט באָקע אַנאַליסיס מאַנשאַפֿט, פולשטענדיק אינהאַלט, און ויסגעצייכנט סערוויסעס שטיצן.

סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז

ביבליאָטעק

סיקוואַנסינג סטראַטעגיע

דאַטן רעקאַמענדיד

פּופּליקאָן

Pacbio Revio

10/30/50 ק טאַגס (CCS)

מוסטער באדערפענישן

קאָנסענטראַטיאָן (נג / μ ל)

גאַנץ סומע (μ ג)

באַנד (μL)

≥5

≥0.3

≥20

רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס

פרירן די סאַמפּאַלז אין פליסיק ניטראָגען פֿאַר 3-4 שעה און קראָם אין פליסיק ניטראָגען אָדער -80 גראַד צו לאַנג-טערמין רעזערוואַציע. מוסטער שיפּינג מיט טרוקן ייַז איז פארלאנגט.

סערוויס אַרבעט לויפן

מוסטער עקספּרעס

מוסטער עקספּרעס

ביבליאָטעק צוגרייטונג

ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן

סיקוואַנסינג

סיקוואַנסינג

דאַטן אַנאַליסיס

דאַטן אַנאַליסיס

נאָך פאַרקויף באַדינונגס

נאָך-פאַרקויף באַדינונגס


  • פרייַערדיק:
  • ווייַטער:

  • 流程图第三版 2-02

    כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:

    ● רוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל

    ● אָטו קלאַסטערינג / דע-ראַש (ASV)

    Otu אַנאָטאַציע

    ● אַלף דייווערסיטי אַנאַליסיס: קייפל ינדעקסיז, אַרייַנגערעכנט שאַננאָן, סימפּסאָן און מויז.

    ● ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס

    ● ינטער-גרופּע אַנאַליסיס

    קאָראַליישאַן אַנאַליסיס: צווישן ינווייראַנמענאַל סיבות און אָוט זאַץ און דייווערסיטי

    ● 16 ס פאַנגקשאַנאַל דזשינט פּראָגנאָז

     

    היסטאָגראַם פון טאַקסאָנאָמיק פאַרשפּרייטונג

    图片 57

    קהל פאַרשפּרייטונג פילאָגענעטיק בוים

    图片 58

    אַלף דייווערסיטי אַנאַליסיס: מויז

    ינדעקס图片 59

     

    ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס: פּקאָאַ

    图片 60

     

    ינטערגראָופּ אַנאַליסיס: Anova

    图片 61

     

     

     

    ויספאָרשן די אַדוואַנסמאַנץ פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene's Uplicon Sequencing Sequensing באַדינונגען מיט פּאַסאַביאָ דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.

    Gao, x. און וואַנג, ה. (2023) 'קאָמפּאַראַטיווע אַנאַליסיס פון רומעניש באַקטיריאַל פּראָופיילז און פאַנגקשאַנז בעשאַס אַדאַפּטיישאַן צו פאַרשידענע פענאָלאָגי (רעגולער. 1), פּ. 16. DOI: 10.3390 / פערמאַנטיישאַן9010016 / S1.

    Li, s. et al. (2023) 'קאַפּטשערינג די מייקראָוביאַל פינצטער ענין אין מדבר סוילז ניצן ספּולטוראָמיקס-באזירט מעטאַגענאָמיקס-באזירט מעטאַגענאָמיקס און הויך-האַכלאָטע אַנאַליסיס 2023 9: 1, 9 (1), פּפּ. 1-14-14. DOI: 10.1038 / S41522-023-00439-8.

    מו, ל עט על. (2022) 'יפעקס פון פאַטי זויער סאָלץ אויף פערמאַנטיישאַן קעראַקטעריסטיקס, באַקטיריאַל דייווערסיטי און עראָוביק פעסטקייַט פון געמישט סילאַגע צוגעגרייט מיט אַלפאַלפאַ, רייז שטראָף פון די וויסנשאַפֿט פון עסנוואַרג און אַגריקולטורע, 102 (42 (252 (42 (42 (42 (2022). 1487. DOI: 10.1002 / jsfa.11482.

    יאַנג, דזש. עט על. (2023) 'די ינטעראַקשאַן צווישן אָקסידאַטיווע דרוק בייאָמאַרקערס און קישקע מיקראָביאָטאַ אין די אַנטיאַקסאַדאַנט יפעקס פון אויסצוגן פון עקסטראַקץ פון סאָטשוס בראַטשיאָטוס דק. אין אָקסאַזאָלאָנע-ינדאַקייטיד ינטעסטאַנאַל אָקסידאַטיווע דרוק אין דערוואַקסן פּילז 2023, חלק. 12, זייַט 192, 12 (1), פּ. 192. דאָי: 10.3390 / אַנטיאָקס 12010192.

    באַקומען אַ ציטירן

    שרייב דיין אָנזאָג דאָ און שיקן עס צו אונדז

    שיקן דיין אָנזאָג צו אונדז: