16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
סערוויס פֿעיִקייטן
● סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq.
● אַמפּלאַפאַקיישאַן פון קורץ מקומות פון 16S, 18S און ITS, צווישן אנדערע אַמפּלאַפאַקיישאַן טאַרגאַץ.
● פלעקסאַבאַל ברירות פון אַמפּליקאָן.
● פרייַערדיק פּרויעקט דערפאַרונג מיט קייפל אַמפּלאַפאַקיישאַן טאַרגאַץ.
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●אפגעזונדערטקייט:גיך לעגיטימאַציע פון מייקראָוביאַל זאַץ אין ינווייראַנמענאַל סאַמפּאַלז.
●הויך האַכלאָטע: אין נידעריק-שעפעדיק קאַמפּאָונאַנץ אין ינווייראַנמענאַל סאַמפּאַלז.
●וויידלי אָנווענדלעך: דייווערס מיקראָביאַל קהל שטודיום.
●פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַליסיס: די לעצטע QIIME2 פּעקל (קוואַנטיטאַטיווע ינסייט אין מייקראָוביאַל יקאַלאַדזשי) מיט פאַרשידן אַנאַליזעס אין טערמינען פון דאַטאַבייס, אַנאָטאַציע, OTU / ASV.
●ברייט עקספּערטיז: מיט 150 טויזנט אַמפּליקאָן סיקוואַנסינג פּראַדזשעקס געפירט אַניואַלי, BMKGENE ברענגט איבער אַ יאָרצענדלינג פון דערפאַרונג, אַ העכסט באָקע אַנאַליסיס מאַנשאַפֿט, פולשטענדיק אינהאַלט און ויסגעצייכנט שטיצן פֿאַר נאָך פארקויפונג.
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטן רעקאַמענדיד |
| אַמפּליקאָן | Illumina PE250 | 50/100/300 ק טאַגס (לייענען פּערז) |
סערוויס רעקווירעמענץ
| קאַנסאַנטריישאַן (נג / μ ל) | גאַנץ סומע (נג) | באַנד (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● באָדן / סלאַדזש: קסנומקס-קסנומקסג
● ינטעסטאַנאַל צופרידן-כייַע: 0.5-2ג
● ינטעסטאַנאַל אינהאַלט-ינסעקט: 0.1-0.25ג
● פּלאַנט ייבערפלאַך (ענריטשט אָפּזאַץ): 0.1-0.5ג
● פערמאַנטיישאַן יויך ענריטשט אָפּזאַץ): 0.1-0.5ג
● פעסעס (גרויס אַנימאַלס): 0.5-2ג
● פעסעס (מויז): 3-5גראַינס
● פּולמאַנערי אַלוועאָלאַר לאַוואַגע פליסיק: פילטער פּאַפּיר
● וואַדזשיינאַל ווישער: 5-6 סוואַבז
● הויט / דזשענאַטאַל ווישער / שפּייַעכץ / מויל ווייך געוועב / פאַרינגעאַל ווישער / רעקטאַל ווישער: 2-3 סוואַבז
● ייבערפלאַך מייקראָואָרגאַניזאַמז: פילטער פּאַפּיר
● וואַסערבאָדי / לופט / ביאָפילם: פילטער פּאַפּיר
● ענדאָפיטעס: קסנומקס-קסנומקסג
● דענטאַל פּלאַק: 0.5-1ג
סערוויס אַרבעט לויפן
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
כולל די פאלגענדע אַנאַליסיס:
- רוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
- OTU קלאַסטערינג / דע-נויז (אַסוו)
- OTU אַנאָטאַציע
- אַלף דייווערסיטי אַנאַליסיס: קייפל ינדעקסיז, אַרייַנגערעכנט שאַננאָן, סימפּסאָן און ACE.
- ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס
- ינטער-גרופּע אַנאַליסיס
- קאָראַליישאַן אַנאַליסיס: צווישן ינווייראַנמענאַל סיבות און OUT זאַץ און דייווערסיטי
- 16S פאַנגקשאַנאַל דזשין פּראָגנאָז
היסטאָגראַם פון טאַקסאָנאָמיק פאַרשפּרייטונג
טאַקסאָנאָמיק זעט קלאַסטערינג היץ מאַפּע
אַלף דייווערסיטי אַנאַליסיס: ראַרעפאַקשאַן ויסבייג
ביתא דייווערסיטי אַנאַליסיס: נמדס
ינטערגראָופּ אַנאַליסיס: LEFSE ביאָמאַרקער ופדעקונג
ויספאָרשן די אַדוואַנטידזשיז פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene ס אַמפּליקאָן סיקוואַנסינג באַדינונגס מיט Illumina דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.
דאָנג, סי עט על. (2022) 'אַסעמבלי, קאָר מיקראָביאָטאַ, און פאַנגקשאַנז פון די רהיזאָספערע באָדן און בילן מיקראָביאָטאַ אין Eucommia ulmoides', פראָנטיערס אין מיקראָביאָלאָגי, 13. דאָי: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
לי, י עט על. (2023) 'סינטעטיש באַקטיריאַל קאָנסאָרטיאַ טראַנספּלאַנטיישאַן פֿאַר די באַהאַנדלונג פון גאַרדנערעללאַ וואַגינאַליס-ינדוסט באַקטיריאַל וואַגינאָסיס אין מיסע', מיקראָביאָמע, 11 (1), פּפּ. 1-14. דאָי: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. און Liu, H. (2022) 'מיקראָביאָמעס פון לופט שטויב געזאמלט בעשאַס די ערד-באזירט פארמאכט באָרעגענעראַטיוו לעבן שטיצן עקספּערימענט "לונאַר פּאַלאַס 365"', ענוויראָנמענטאַל מיקראָביאָמעס, 17(1), פּפּ. 1–20. דאָי: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
יין, ש. עט על. (2022) 'פעעדסטאָקק-אָפענגיק זעט פון פאַנגקשאַנאַל גענעס שייַכות צו ניטראָגען טראַנספאָרמאַציע קאַנטראָולד ניטראָגען אָנווער אין קאַמפּאָוסטינג', Bioresource Technology, 361, פּ. 127678. דאָי: 10.1016/דזש.ביאָרטעטש.2022.127678.
