Ngăn kéo nhiệt được sử dụng để vẽ bản đồ nhiệt, có thể lọc, bình thường hóa và dữ liệu ma trận cụm. Nó chủ yếu được sử dụng để phân tích cụm mức độ biểu hiện gen giữa các mẫu khác nhau.
Đính kèm các chức năng sinh học vào các chuỗi trong tệp FASTA bằng cách sắp xếp các chuỗi vào cơ sở dữ liệu, bao gồm NR, KEGG, COG, SWISSPROT, Trembl, Kog, PFAM.
BLAST (Công cụ tìm kiếm căn chỉnh cục bộ cơ bản) là một thuật toán và chương trình để tìm các vùng có trình tự sinh học tương tự. Nó so sánh các chuỗi này với chuỗi dữ liệu và tính toán ý nghĩa thống kê. BLAST bao gồm bốn loại công cụ dựa trên loại trình tự: Blastn, Lastp, BlastX và Tblastn.