Exclusive Agency for Korea

Banner-03

Các sản phẩm

Trình tự RNA đơn hạt nhân

Sự phát triển của việc thu thập một tế bào và các kỹ thuật xây dựng thư viện tùy chỉnh, cùng với trình tự thông lượng cao, đã cách mạng hóa các nghiên cứu biểu hiện gen ở cấp độ tế bào. Bước đột phá này cho phép phân tích sâu hơn và toàn diện hơn về các quần thể tế bào phức tạp, khắc phục những hạn chế liên quan đến việc trung bình biểu hiện gen trên tất cả các tế bào và bảo tồn sự không đồng nhất thực sự trong các quần thể này. Mặc dù trình tự RNA đơn bào (SCRNA-seq) có những lợi thế không thể phủ nhận, nhưng nó gặp phải những thách thức trong một số mô nhất định trong đó việc tạo ra một hệ thống treo đơn bào chứng tỏ khó khăn và đòi hỏi các mẫu mới. Tại BMKGene, chúng tôi giải quyết rào cản này bằng cách cung cấp trình tự RNA đơn nucleus (SNRNA-seq) bằng cách sử dụng công nghệ crommics 10X hiện đại. Cách tiếp cận này mở rộng phổ của các mẫu có thể chấp nhận để phân tích phiên mã ở cấp độ tế bào đơn.

Sự cô lập của các hạt nhân được thực hiện thông qua chip cromomics 10x Genomics sáng tạo, có hệ thống vi mô tám kênh với giao cắt đôi. Trong hệ thống này, các hạt gel kết hợp mã vạch, mồi, enzyme và một hạt nhân duy nhất được gói gọn trong các giọt dầu có kích thước nanoliter, tạo thành hạt gel (GEM). Sau khi hình thành GEM, sự ly giải tế bào và giải phóng mã vạch xảy ra trong mỗi viên đá quý. Sau đó, các phân tử mRNA trải qua phiên mã ngược vào CDNA, kết hợp các mã vạch 10 lần và định danh phân tử độc đáo (UMIS). Các CDNA này sau đó phải chịu sự xây dựng thư viện trình tự tiêu chuẩn, tạo điều kiện cho một khám phá mạnh mẽ và toàn diện các cấu hình biểu hiện gen ở cấp độ tế bào đơn.

Nền tảng: Nền tảng 10 × Genomics Chromium và Illumina Novaseq


Chi tiết dịch vụ

Tin sinh học

Kết quả demo

Ấn phẩm nổi bật

Đề án kỹ thuật

Sự cô lập của các hạt nhân đạt được bằng 10 × Genomics Chromium ™, bao gồm hệ thống vi mô tám kênh với giao cắt đôi. Trong hệ thống này, một hạt gel có mã vạch và mồi, enzyme và một hạt nhân duy nhất được gói gọn trong việc giảm dầu kích thước nanoliter, tạo ra hạt gel (GEM). Khi GEM được hình thành, ly giải tế bào và giải phóng mã vạch được thực hiện trong mỗi viên đá quý. mRNA được sao chép ngược thành các phân tử cDNA với mã vạch 10 × và UMI, tiếp tục chịu sự xây dựng thư viện trình tự tiêu chuẩn.

_1737445364188

Đặc trưng

● Chuẩn bị huyền phù đơn nuclei từ các mô đông lạnh

● Hình thành hạt gel trong hạt (GEM) sau đó là tổng hợp cDNA

● Mỗi hạt trong một viên đá quý được tải với các đoạn mồi bao gồm 4 phần:

đuôi poly (dt) cho mồi mRNA và tổng hợp cDNA,

Định danh phân tử duy nhất (UMI) để chính xác sự thiên vị khuếch đại

Mã vạch 10 lần

Trình tự liên kết của một phần đọc 1 trình tự mồi

Thuận lợi

Trình tự RNA đơn nucleus bao gồm các hạn chế của trình tự RNA đơn bào, cho phép:

● Việc sử dụng các mẫu đông lạnh và không chỉ giới hạn ở các mẫu mới

● Ứng suất thấp của các tế bào đông lạnh khi so sánh với điều trị enzyme của các tế bào tươi

● Không cần phải loại bỏ các tế bào hồng cầu trước

● Đường kính ô không giới hạn

● Mảng lớn các mẫu đủ điều kiện để phân tích, bao gồm các loại mô phức tạp và dễ vỡ, dễ bị đóng cục tế bào hoặc phá hủy trong quá trình phân ly mô

Các mẫu không thể được phân tích bằng trình tự RNA đơn bào và đủ điều kiện cho trình tự RNA hạt nhân đơn:

Tế bào / mô

Lý do

Mô đông lạnh

Không thể có được các tổ chức mới hoặc đã tiết kiệm

Tế bào cơ, megakaryocyte, chất béo

Đường kính tế bào quá lớn để vào dụng cụ

Gan…

Quá mong manh để phá vỡ, không thể phân biệt các ô đơn lẻ

Tế bào thần kinh, não

Nhạy cảm hơn, dễ căng thẳng, sẽ thay đổi kết quả giải trình tự

Tuyến tụy, tuyến giáp

Giàu enzyme nội sinh, ảnh hưởng đến việc sản xuất huyền phù tế bào đơn

Đơn nucleus so với tế bào đơn

Đơn nucleus

Tế bào đơn

Đường kính tế bào không giới hạn

Đường kính tế bào: 10-40 m

Vật liệu có thể được đông lạnh mô

Vật liệu phải là mô tươi

Sự căng thẳng thấp của các tế bào đông lạnh

Điều trị enzyme có thể gây ra phản ứng căng thẳng tế bào

Không cần phải loại bỏ tế bào hồng cầu

Các tế bào hồng cầu cần phải được loại bỏ

Hạt nhân thể hiện thông tin sinh học

Toàn bộ tế bào thể hiện thông tin sinh học

Thông số kỹ thuật

Yêu cầu mẫu

Thư viện

Chiến lược giải trình tự

Dữ liệu được đề xuất

Kiểm soát chất lượng

Mô động vật ≥ 200 mg

Mô thực vật ≥ 400 mg

Thư viện Genomics 10X SN cDNA

Illumina PE150

100k pe đọc cho mỗi tế bào

(100-200 GB)

700-1200 hạt nhân/μl và tính toàn vẹn của hạt nhân được quan sát dưới kính hiển vi

Để biết thêm chi tiết về hướng dẫn chuẩn bị mẫu và quy trình làm việc, xin vui lòng nói chuyện với một

Lưu lượng làm việc dịch vụ

图片 117

  • Trước:
  • Kế tiếp:

  • WPS_DOC_9

     

    Bao gồm các phân tích sau:

     

    ● Kiểm soát chất lượng: số lượng tế bào, phát hiện gen, xác định chính xác các tế bào, phân tử RNA và định lượng biểu hiện

    ● Phân tích mẫu bên trong:

    Phân cụm tế bào và chú thích cụm

    Phân tích biểu thức khác biệt: Xác định DEG trong các cụm

    Chú thích chức năng và làm phong phú các DEG

    ● Phân tích giữa các nhóm:

    Kết hợp dữ liệu

    Phân tích biểu hiện khác biệt: Xác định DEG theo nhóm

    Chú thích chức năng và làm giàu của DEG nhóm

    ● Phân tích nâng cao:

    Phân tích chu kỳ tế bào

    Phân tích giả

    Phân tích giao tiếp tế bào (CellphonedB)

    Gene Set Phân tích làm giàu (GSEA)

    Phân tích mẫu bên trong

    Phân cụm ô:

    WPS_DOC_10

     

    Phân tích biểu thức khác biệt: DEGS cụm

    图片 9

     

    Phân tích liên nhóm

    Phân tích biểu hiện khác biệt: DEG nhóm

    图片 10 

    Phân tích nâng cao:

    Phân tích giả:

    图片 11

     

     

    Phân tích chu kỳ tế bào:

    12

     

    Khám phá những tiến bộ được tạo điều kiện bởi các dịch vụ giải trình tự RNA đơn nucleus của BMKGene bằng 10 lần crom trong các ấn phẩm đặc trưng này:

     

    Wang, L. et al. .Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ, 118 (2), tr. E2005590118. doi: 10.1073/pnas.2005590118

    Zheng, H. et al. .Biên giới trong miễn dịch học, 13, tr. 879824. DOI: 10.3389/fimmu.2022.879824/bibtex.

    Tian, ​​H. et al. .Nuôi trồng thủy sản, 566, tr. 739238. DOI: 10.1016/j.aquacult.2023.739238.

    Yu, Y. et al. .Ung thư dạ dày, 26 (5), trang 798 Từ813. doi: 10.1007/s10120-023-01409-x/số liệu.

     

    Nhận báo giá

    Viết tin nhắn của bạn ở đây và gửi nó cho chúng tôi

    Gửi tin nhắn của bạn cho chúng tôi: