Trình tự RNA prokaryotic
Đặc trưng
● Xử lý mẫu RNA liên quan đến sự suy giảm rRNA sau đó là chuẩn bị thư viện RNA định hướng.
● Phân tích sinh học dựa trên sự liên kết với bộ gen tham chiếu
● Phân tích bao gồm biểu hiện gen và DEG nhưng cũng có cấu trúc bảng điểm và phân tích SRNA
Lợi thế dịch vụ
●Kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt: Chúng tôi thực hiện các điểm kiểm soát cốt lõi trên tất cả các giai đoạn, từ chuẩn bị mẫu và thư viện đến trình tự và tin sinh học. Giám sát tỉ mỉ này đảm bảo việc cung cấp kết quả chất lượng cao liên tục.
●Dữ liệu giải trình tự cụ thể theo chuỗi: Do việc chuẩn bị thư viện RNA là định hướng, cho phép xác định bảng điểm chống ý nghĩa.
●Phân tích hoàn chỉnh phù hợp với bản phiên mã prokaryote: Đường ống sinh học không chỉ phân tích biểu hiện gen mà còn phân tích cấu trúc bảng điểm, bao gồm xác định các operon, UTRS và các nhà quảng bá. Nó cũng bao gồm phân tích SRNA, cụ thể là chú thích và dự đoán cấu trúc và mục tiêu thứ cấp.
●Hỗ trợ sau bán hàng: Cam kết của chúng tôi vượt ra ngoài hoàn thành dự án với thời gian dịch vụ sau bán 3 tháng. Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các phiên hỏi đáp để giải quyết bất kỳ truy vấn nào liên quan đến kết quả.
Yêu cầu mẫu và giao hàng
| Thư viện | Chiến lược giải trình tự | Dữ liệu được đề xuất | Kiểm soát chất lượng |
| RRNA đã cạn kiệt thư viện định hướng | Illumina PE150 | 1-2 GB | Q30≥85% |
Yêu cầu mẫu:
| Conc. (Ng/μl) | Số tiền (μg) | Sự thuần khiết | Chính trực |
| ≥ 50 | 1 | OD260/280 = 1.8-2.0 OD260/230 = 1.0-2.5 Giới hạn hoặc không có ô nhiễm protein hoặc DNA hiển thị trên gel. | Rin≥6.5 |
Giao hàng mẫu được đề xuất
Container: Ống ly tâm 2 ml (không nên sử dụng Lá thiếc)
Ghi nhãn mẫu: Nhóm+sao chép EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lô hàng:
1. Dry-Ice: Các mẫu cần được đóng gói trong túi và chôn trong băng khô.
2. Các ống RNastable: Các mẫu RNA có thể được sấy khô trong ống ổn định RNA (ví dụ RNastable®) và được vận chuyển ở nhiệt độ phòng.
Lưu lượng làm việc dịch vụ
Giao hàng mẫu
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Phân tích sinh học Quy trình làm việc
Bao gồm các phân tích sau:
● Kiểm soát chất lượng dữ liệu thô
● Liên kết với bộ gen tham chiếu
● Đánh giá chất lượng thư viện: Độ ngẫu nhiên phân mảnh RNA, kích thước chèn và độ bão hòa giải trình tự
● Chú thích chức năng của các gen mã hóa dự đoán
● Phân tích biểu thức: Phân tích thành phần tương quan và chính (PCA)
● Biểu hiện gen khác biệt (DEGS)
● Chú thích chức năng và làm giàu của DEGS
● Phân tích SRNA: Dự đoán, chú thích, mục tiêu và dự đoán cấu trúc thứ cấp
● Phân tích cấu trúc bảng điểm: operon, vị trí bắt đầu và kết thúc, vùng chưa được dịch (UTS), nhà quảng bá và phân tích SNP/Indel
Giải trình tự bão hòa
Chú thích chức năng của các gen mã hóa
Tương quan giữa các mẫu
Phân tích gen biểu hiện khác biệt (DEGs)
Phân tích làm giàu chức năng
Chú thích SRNA
Khám phá những tiến bộ được tạo điều kiện bởi các dịch vụ giải trình tự mRNA đầy đủ của BMKGene của BMKGene trong ấn phẩm đặc trưng này.
Guan, CP et al. .Tạp chí Vi sinh học Ba Lan, 67 (2), tr. 223. DOI: 10.21307/PJM-2018-024.
