-
BMKMANU S3000_Bản ghi không gian
Hệ thống phiên mã không gian luôn đi đầu trong đổi mới khoa học, trao quyền cho các nhà nghiên cứu đi sâu vào các mẫu biểu hiện gen phức tạp trong các mô trong khi vẫn bảo tồn bối cảnh không gian của chúng. Giữa nhiều nền tảng khác nhau, BMKGene đã phát triển Chip phiên mã không gian BMKManu S3000, có độ phân giải nâng cao 3,5µm, đạt đến phạm vi dưới tế bào và cho phép cài đặt độ phân giải đa cấp. Chip S3000, có khoảng 4 triệu điểm, sử dụng các giếng vi thể được xếp lớp với các hạt chứa đầu dò chụp mã vạch không gian. Thư viện cDNA, được bổ sung thêm mã vạch không gian, được chuẩn bị từ chip S3000 và sau đó được giải trình tự trên nền tảng Illumina NovaSeq. Sự kết hợp giữa các mẫu mã vạch không gian và UMI đảm bảo tính chính xác và tính đặc hiệu của dữ liệu được tạo ra. Chip BMKManu S3000 cực kỳ linh hoạt, cung cấp các cài đặt độ phân giải đa cấp có thể được tinh chỉnh phù hợp với các loại mô khác nhau và mức độ chi tiết mong muốn. Khả năng thích ứng này giúp chip trở thành một lựa chọn nổi bật cho các nghiên cứu về phiên mã không gian đa dạng, đảm bảo phân cụm không gian chính xác với độ nhiễu tối thiểu. Việc sử dụng công nghệ phân đoạn tế bào với BMKManu S3000 cho phép phân định dữ liệu phiên mã đến ranh giới của các tế bào, dẫn đến phân tích có ý nghĩa sinh học trực tiếp. Hơn nữa, độ phân giải được cải thiện của S3000 dẫn đến số lượng gen và UMI được phát hiện trên mỗi tế bào cao hơn, cho phép phân tích chính xác hơn nhiều về kiểu phiên mã không gian và phân cụm tế bào.
-
Trình tự RNA đơn nhân
Sự phát triển của kỹ thuật thu thập tế bào đơn và xây dựng thư viện tùy chỉnh, cùng với giải trình tự thông lượng cao, đã cách mạng hóa các nghiên cứu biểu hiện gen ở cấp độ tế bào. Bước đột phá này cho phép phân tích sâu hơn và toàn diện hơn về các quần thể tế bào phức tạp, khắc phục những hạn chế liên quan đến biểu hiện gen trung bình trên tất cả các tế bào và duy trì tính không đồng nhất thực sự trong các quần thể này. Mặc dù giải trình tự RNA đơn bào (scRNA-seq) có những ưu điểm không thể phủ nhận, nhưng nó gặp phải những thách thức ở một số mô nhất định, nơi việc tạo ra huyền phù tế bào đơn tỏ ra khó khăn và cần có mẫu mới. Tại BMKGene, chúng tôi giải quyết rào cản này bằng cách cung cấp giải trình tự RNA hạt nhân đơn (snRNA-seq) bằng công nghệ 10X Genomics Crom tiên tiến nhất. Cách tiếp cận này mở rộng phổ của các mẫu có thể tuân theo phân tích phiên mã ở cấp độ đơn bào.
Việc phân lập hạt nhân được thực hiện thông qua chip 10X Genomics Crom cải tiến, có hệ thống vi lỏng tám kênh với các giao điểm kép. Trong hệ thống này, các hạt gel kết hợp mã vạch, mồi, enzyme và một hạt nhân được gói gọn trong những giọt dầu có kích thước nanolit, tạo thành Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Sau khi hình thành GEM, quá trình ly giải tế bào và giải phóng mã vạch xảy ra trong mỗi GEM. Sau đó, các phân tử mRNA trải qua quá trình phiên mã ngược thành cDNA, kết hợp mã vạch 10X và Mã định danh phân tử duy nhất (UMI). Sau đó, các cDNA này được xây dựng thư viện giải trình tự tiêu chuẩn, tạo điều kiện cho việc khám phá mạnh mẽ và toàn diện các cấu hình biểu hiện gen ở cấp độ đơn bào.
Nền tảng: 10× Nền tảng Genomics Crom và Illumina NovaSeq
-
Bản phiên mã không gian Visium 10x Genomics
Phiên mã không gian là một công nghệ tiên tiến cho phép các nhà nghiên cứu điều tra các kiểu biểu hiện gen trong các mô trong khi vẫn bảo tồn bối cảnh không gian của chúng. Một nền tảng mạnh mẽ trong lĩnh vực này là Genomics Visium gấp 10 lần kết hợp với giải trình tự Illumina. Nguyên lý của 10X Visium nằm trên một con chip chuyên dụng có vùng chụp được chỉ định để đặt các phần mô. Vùng chụp này chứa các điểm có mã vạch, mỗi điểm tương ứng với một vị trí không gian duy nhất trong mô. Các phân tử RNA thu được từ mô sau đó được dán nhãn bằng mã định danh phân tử duy nhất (UMI) trong quá trình sao chép ngược. Những điểm mã vạch và UMI này cho phép lập bản đồ không gian chính xác và định lượng biểu hiện gen ở độ phân giải đơn ô. Sự kết hợp giữa các mẫu mã vạch không gian và UMI đảm bảo tính chính xác và tính đặc hiệu của dữ liệu được tạo ra. Bằng cách sử dụng công nghệ Phiên mã không gian này, các nhà nghiên cứu có thể hiểu sâu hơn về tổ chức không gian của tế bào và các tương tác phân tử phức tạp xảy ra trong các mô, mang lại những hiểu biết vô giá về cơ chế của các quá trình sinh học trong nhiều lĩnh vực, bao gồm ung thư, khoa học thần kinh, sinh học phát triển, miễn dịch học. và nghiên cứu thực vật.
Nền tảng: 10X Genomics Visium và Illumina NovaSeq
