Pacbio Bản ghi đầy đủ

Trình tự phiên mã có độ dài đầy đủ PacBio, Isoseq, cho phép xác định chính xác các dạng đồng phân phiên mã, làm sáng tỏ về quá trình ghép nối và polyadenylation thay thế, đồng thời dẫn đến phân tích biểu hiện gen chính xác hơn. Quy trình Phiên mã có độ dài đầy đủ BMKCloud PacBio được thiết kế để phân tích các thư viện cDNA được sắp xếp theo trình tự ở chế độ Trình tự đồng thuận tuần hoàn (CCS) và xác định các chuỗi có độ dài đầy đủ không phải chimeric (FLNC), sau đó được nhóm thành các bản phiên mã không dư thừa. Phân tích BUSCO tiếp theo đánh giá tính đầy đủ của tập hợp bảng điểm. Từ bản phiên mã được lắp ráp, nhiều phân tích được thực hiện: ghép nối thay thế, lặp lại trình tự đơn giản (SSR), dự đoán lncRNA và gen mục tiêu tương ứng, dự đoán gen mới, phân tích họ gen, phân tích yếu tố phiên mã và chú thích chức năng của bản phiên mã.