mRNA-seq (NGS) với bộ gen tham chiếu
RNA-seq là một công cụ tiêu chuẩn trong khoa học đời sống và cây trồng, thu hẹp khoảng cách giữa bộ gen và hệ protein. Sức mạnh của nó nằm ở việc khám phá các bản phiên mã mới và định lượng biểu hiện của chúng trong một xét nghiệm. Nó được sử dụng rộng rãi cho các nghiên cứu phiên mã so sánh, làm sáng tỏ các gen liên quan đến các đặc điểm hoặc kiểu hình khác nhau, như so sánh các đột biến với các kiểu hoang dã hoặc tiết lộ biểu hiện gen trong các điều kiện cụ thể. BMKCloud mRNA(Reference) APP tích hợp định lượng biểu thức, phân tích biểu thức vi phân (DEG) và phân tích cấu trúc trình tự vào quy trình tin sinh học mRNA-seq(NGS) và kết hợp các điểm mạnh của phần mềm tương tự, đảm bảo sự tiện lợi và thân thiện với người dùng. Người dùng có thể tải dữ liệu RNA-seq của mình lên đám mây, nơi Ứng dụng cung cấp giải pháp phân tích tin sinh học toàn diện, toàn diện. Ngoài ra, nó ưu tiên trải nghiệm của khách hàng, cung cấp các hoạt động được cá nhân hóa phù hợp với nhu cầu cụ thể của người dùng. Người dùng có thể tự thiết lập các tham số và gửi nhiệm vụ quy trình, kiểm tra báo cáo tương tác, xem dữ liệu/sơ đồ và khai thác dữ liệu hoàn chỉnh, chẳng hạn như: lựa chọn gen mục tiêu, phân cụm chức năng, lập sơ đồ, v.v.
Nền tảng:Chiếu sáng, MGI
Chiến lược:Trình tự RNA
Cách trình bày: Pared, dữ liệu sạch.
Loại thư viện:fr-unstranded, fr-firststrand hoặc fr-secondstrand
Độ dài đọc:150 bp
Loại tập tin:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz hoặc *.fq.gz. Hệ thống sẽtự động ghép nối các tệp .fastq theo tên tệp của chúng,ví dụ: *_1.fastq được ghép nối với *._2.fastq.
Số lượng mẫu:Không có hạn chế về số lượngcủa mẫu, nhưng thời gian phân tích sẽ tăng lên khi số lượng mẫumẫu phát triển.
Lượng dữ liệu được đề xuất:6G mỗi mẫu