Bộ gen

Lắp ráp và phân tích quy mô nhiễm sắc thể của bộ gen sinh khối Miscanthus lutarioriparius
Trình tự nanopore | Illumina | Hi-C | Trình tự RNA | Phylogeny
Trong nghiên cứu này, các công nghệ sinh học đã cung cấp hỗ trợ kỹ thuật trên trình tự nanopore, lắp ráp bộ gen de novo, lắp ráp hỗ trợ HI-C, v.v.
Tóm tắt
Miscanthus, một loại cây lâu năm rhizomatous, có tiềm năng lớn cho sản xuất năng lượng sinh học cho sinh khối cao và khả năng chịu căng thẳng. Chúng tôi báo cáo một tập hợp quy mô nhiễm sắc thể củaMiscanthus lutarioripariusBộ gen bằng cách kết hợp trình tự Nanopore Oxford và công nghệ HI-C. Lắp ráp 2,07 GB bao gồm 96,64% bộ gen, với contig N50 là 1,71 MB. Trình tự trung tâm và telomere được tập hợp cho tất cả 19 nhiễm sắc thể và nhiễm sắc thể 10, tương ứng. Nguồn gốc Allotetraploid của M. Lutarioriparius được xác nhận bằng cách sử dụng lặp lại vệ tinh trung tâm. Cấu trúc bộ gen tetraploid và một số sự sắp xếp lại nhiễm sắc thể liên quan đến lúa miến được thể hiện rõ ràng. Song song các gen củaM. Lutarioripariusđược làm giàu chức năng không chỉ về các điều khoản liên quan đến phản ứng căng thẳng, mà còn sinh tổng hợp thành tế bào. Các họ gen liên quan đến kháng bệnh, sinh tổng hợp thành tế bào và vận chuyển ion kim loại được mở rộng và phát triển rất nhiều. Sự mở rộng của các gia đình này có thể là một cơ sở bộ gen quan trọng để tăng cường các đặc điểm đáng chú ý củaM. Lutarioriparius.
Thống kê chính của lắp ráp bộ gen


Nhân vật. Tổng quan về Hội đồng bộ gen M. Lutarioriparius
Tin tức và điểm nổi bật nhằm mục đích chia sẻ các trường hợp thành công mới nhất với các công nghệ sinh học, nắm bắt các thành tựu khoa học mới cũng như các kỹ thuật nổi bật được áp dụng trong quá trình nghiên cứu.
Thời gian đăng: Tháng 1-05-2022