mRNA-seq (NGS) - De novo
Giải trình tự mRNA cho phép lập hồ sơ tất cả các bản phiên mã mRNA trong tế bào trong các điều kiện cụ thể và là công nghệ được sử dụng rộng rãi trong các lĩnh vực nghiên cứu khác nhau. Quy trình BMKCloud De novo mRNA-seq được thiết kế để phân tích các thư viện giải trình tự được làm giàu bằng poly-A khi không có sẵn bộ gen tham chiếu. Quy trình bắt đầu bằng việc kiểm soát chất lượng, tiếp theo làmới bắt đầulắp ráp bảng điểm và lựa chọn bộ unigene. Phân tích cấu trúc unigene dự đoán trình tự mã hóa (CDS) và lặp lại trình tự đơn giản (SSR). Sau đó, phân tích biểu hiện khác biệt tìm thấy các gen biểu hiện khác nhau (DEG) trong số các điều kiện được thử nghiệm, sau đó là chú thích chức năng và làm phong phú DEG để rút ra những hiểu biết sâu sắc về sinh học.
Tin sinh học
