Exclusive Agency for Korea

Banner-03

Các sản phẩm

Tương tác chromatin dựa trên HI-C

HI-C là một phương pháp được thiết kế để nắm bắt cấu hình bộ gen bằng cách kết hợp các tương tác dựa trên sự gần gũi và trình tự thông lượng cao. Phương pháp này dựa trên liên kết chéo chromatin với formaldehyd, tiếp theo là tiêu hóa và giới thiệu lại theo cách mà chỉ các mảnh được liên kết cộng hóa trị sẽ hình thành các sản phẩm thắt. Bằng cách giải trình tự các sản phẩm thắt này, có thể nghiên cứu tổ chức 3D của bộ gen. HI-C cho phép nghiên cứu sự phân bố các phần của bộ gen được đóng gói nhẹ (một ngăn, euchromatin) và nhiều khả năng hoạt động phiên mã và các vùng được đóng gói chặt chẽ hơn (các ngăn B, heterochromatin). HI-C cũng có thể được sử dụng để xác định chính xác các miền liên quan đến cấu trúc liên kết (TAD), các vùng của bộ gen có cấu trúc gấp và có khả năng có các mẫu biểu hiện tương tự và xác định các vòng chromatin, các vùng DNA được neo với nhau bởi protein và đó thường được làm giàu trong các yếu tố quy định. Dịch vụ giải trình tự HI-C của BMKGene trao quyền cho các nhà nghiên cứu khám phá các kích thước không gian của genomics, mở ra những con đường mới để hiểu điều hòa bộ gen và ý nghĩa của nó đối với sức khỏe và bệnh tật.


Chi tiết dịch vụ

Tin sinh học

Kết quả demo

Ấn phẩm nổi bật

Các tính năng dịch vụ

● Trình tự trên Illumina Novaseq với PE150.

● Dịch vụ yêu cầu các mẫu mô, thay vì chiết xuất axit nucleic, để liên kết chéo với formaldehyd và bảo tồn các tương tác protein DNA.

● Thí nghiệm HI-C liên quan đến việc hạn chế và sửa chữa cuối các đầu dính với biotin, sau đó là hình tròn của các kết thúc cùn kết quả trong khi bảo tồn các tương tác. DNA sau đó được kéo xuống với các hạt streptavidin và được tinh chế để chuẩn bị thư viện tiếp theo.

Lợi thế dịch vụ

Thiết kế enzyme hạn chế tối ưu: Để đảm bảo hiệu quả HI-C cao trên các loài khác nhau với các cặp tương tác hợp lệ lên tới 93%.

Chuyên môn và hồ sơ xuất bản rộng rãi:BMKGene có kinh nghiệm rộng lớn với> 2000 dự án giải trình tự HI-C từ 800 loài khác nhau và các bằng sáng chế khác nhau. Hơn 100 trường hợp được công bố với hệ số tác động tích lũy trên 900.

Nhóm tin sinh học có tay nghề cao:Với các bằng sáng chế trong nhà và bản quyền phần mềm cho các thử nghiệm HI-C và phân tích dữ liệu và phần mềm dữ liệu trực quan hóa tự phát triển.

Hỗ trợ sau bán hàng:Cam kết của chúng tôi vượt ra ngoài hoàn thành dự án với thời gian dịch vụ sau bán 3 tháng. Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các phiên hỏi đáp để giải quyết bất kỳ truy vấn nào liên quan đến kết quả.

Chú thích toàn diện: Chúng tôi sử dụng nhiều cơ sở dữ liệu để chú thích chức năng các gen với các biến thể được xác định và thực hiện phân tích làm giàu tương ứng, cung cấp hiểu biết về nhiều dự án nghiên cứu.

Thông số kỹ thuật dịch vụ

Thư viện

Chiến lược giải trình tự

Đầu ra dữ liệu được đề xuất

Độ phân giải tín hiệu Hi-C

Thư viện Hi-C

Illumina PE150

Vòng chromatin: 150x

Tad: 50x

Vòng chromatin: 10kb

Tad: 40kb

Yêu cầu dịch vụ

Loại mẫu

Số tiền cần thiết

Mô động vật

≥2g

Máu toàn phần

2ml

Nấm

≥1g

Thực vật- mô trẻ

1g/aliquot, 2-4 aliquotes được đề xuất

Tế bào nuôi cấy

≥1x107


  • Trước:
  • Kế tiếp:

  • 图片 98

    Bao gồm các phân tích sau:

    ● QC dữ liệu thô;

    ● Ánh xạ và Thư viện HI-C QC: Các cặp tương tác hợp lệ và số mũ phân rã tương tác (IDE);

    ● Hồ sơ tương tác trên toàn bộ gen: Phân tích CIS/Trans và Bản đồ tương tác HI-C;

    ● Phân tích phân phối ngăn A/B;

    ● Xác định các vòng lặp và chromatin;

    ● Phân tích khác biệt trên các yếu tố cấu trúc chromatin 3D giữa các mẫu và chú thích chức năng tương ứng của các gen liên quan.

    Phân phối tỷ lệ CIS và Trans

    图片 99

     

    Bản đồ nhiệt của các tương tác nhiễm sắc thể giữa các mẫu

    图片 100

     

    Phân phối toàn bộ bộ gen của các ngăn A/B图片 23

     

    Phân phối toàn bộ bộ gen của các vòng chromatin

     

    图片 102

     

    Trực quan hóa TADS

    图片 103

     

    Khám phá các tiến bộ nghiên cứu được tạo điều kiện bởi các dịch vụ giải trình tự HI-C của BMKGene thông qua một bộ sưu tập các ấn phẩm được quản lý.

     

     

    Mạnh, T. et al. .Ung thư thần kinh, 23 (10), trang 1709 Từ1722. doi: 10.1093/neuonc/noab156.

    Xu, L. et al. .Acta Pharmaceutica Sinica B, 11 (10), trang 3150 Từ3164. doi: 10.1016/j.apsb.2021.03.022.

    Nhận báo giá

    Viết tin nhắn của bạn ở đây và gửi nó cho chúng tôi

    Gửi tin nhắn của bạn cho chúng tôi: