Trình tự mRNA có độ dài đầy đủ-nanopore
Đặc trưng
● Chụp poly-a mRNA sau đó là tổng hợp cDNA và chuẩn bị thư viện
● Trình tự các bảng điểm dài đầy đủ
● Phân tích sinh học dựa trên sự liên kết với bộ gen tham chiếu
● Phân tích sinh học không chỉ biểu hiện ở cấp độ gen và isoform mà còn phân tích lncRNA, hợp nhất gen, adenylation và cấu trúc gen
Lợi thế dịch vụ
●Định lượng biểu hiện ở mức độ đồng phân: cho phép phân tích biểu hiện chi tiết và chính xác, tiết lộ sự thay đổi có thể được che dấu khi phân tích toàn bộ biểu hiện gen
●Giảm nhu cầu dữ liệu:So với giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS), trình tự nanopore thể hiện các yêu cầu dữ liệu thấp hơn, cho phép mức độ bão hòa định lượng biểu hiện gen tương đương với dữ liệu nhỏ hơn.
●Độ chính xác cao hơn của định lượng biểu thức: cả ở cấp độ gen và isoform
●Xác định thông tin phiên mã bổ sung: polyadenylation thay thế, gen hợp nhất và lcnRNA và gen mục tiêu của chúng
●Chuyên môn mở rộng: Nhóm của chúng tôi mang lại nhiều kinh nghiệm cho mọi dự án, đã hoàn thành hơn 850 dự án phiên mã đầy đủ của Nanopore và xử lý hơn 8.000 mẫu.
●Hỗ trợ sau bán hàng: Cam kết của chúng tôi vượt ra ngoài hoàn thành dự án với thời gian dịch vụ sau bán 3 tháng. Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các phiên hỏi đáp để giải quyết bất kỳ truy vấn nào liên quan đến kết quả.
Yêu cầu mẫu và giao hàng
| Thư viện | Chiến lược giải trình tự | Dữ liệu được đề xuất | Kiểm soát chất lượng |
| Poly A phong phú | Illumina PE150 | 6/12 GB | Điểm chất lượng trung bình: Q10 |
Yêu cầu mẫu:
Nucleotide:
| Conc. (Ng/μl) | Số tiền (μg) | Sự thuần khiết | Chính trực |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Giới hạn hoặc không có ô nhiễm protein hoặc DNA hiển thị trên gel. | Đối với thực vật: rin≥7.0; Đối với động vật: Rin≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; giới hạn hoặc không có độ cao cơ sở |
● Thực vật:
Rễ, thân hoặc cánh hoa: 450 mg
Lá hoặc hạt: 300 mg
Trái cây: 1,2 g
● Động vật:
Trái tim hoặc ruột: 300 mg
Viscera hoặc não: 240 mg
Cơ bắp: 450 mg
Xương, tóc hoặc da: 1g
● Động vật chân đốt:
Côn trùng: 6g
Crustacea: 300 mg
● Đầy máu toàn phần: 1 ống
● Tế bào: 106 tế bào
Giao hàng mẫu được đề xuất
Container: Ống ly tâm 2 ml (không nên sử dụng Lá thiếc)
Ghi nhãn mẫu: Nhóm+sao chép EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lô hàng:
1. Dry-Ice: Các mẫu cần được đóng gói trong túi và chôn trong băng khô.
2. Các ống RNastable: Các mẫu RNA có thể được sấy khô trong ống ổn định RNA (ví dụ RNastable®) và được vận chuyển ở nhiệt độ phòng.
Lưu lượng làm việc dịch vụ
Nucleotide:
Giao hàng mẫu
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Lưu lượng làm việc dịch vụ
Mô:
Thiết kế thí nghiệm
Giao hàng mẫu
Khai thác RNA
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
● Xử lý dữ liệu thô
● Nhận dạng bảng điểm
● Khả năng ghép nối thay thế
● Định lượng biểu hiện ở mức độ gen và mức độ đồng phân
● Phân tích biểu thức khác biệt
● Chú thích chức năng và làm giàu (DEG và DETS)
Phân tích nối thay thế
Phân tích polyadenylation thay thế (APA)
dự đoán lncRNA
Chú thích các gen mới
Phân cụm DETS
Mạng lưới protein-protein trong DEGS
Khám phá những tiến bộ được tạo điều kiện bởi các dịch vụ giải trình tự mRNA đầy đủ của BMKGene của BMKGene thông qua một bộ sưu tập các ấn phẩm được quản lý.
Gong, B. et al. . doi: 10.1016/j.jgg.2023.01.008.
Anh, Z. et al. . 108636. DOI: 10.1016/j.fsi.2023.108636.
MA, Y. et al. . 110709. DOI: 10.1016/j.ygeno.2023.110709.
Yu, D. et al. . doi: 10.1186/s13287-023-03491-5/bảng/6.
