Phân tích mRNA của sinh vật nhân chuẩn (Có sẵn các tùy chọn dựa trên tài liệu tham khảo và de novo)
Quy trình này sử dụng dữ liệu NGS RNA-Seq làm đầu vào và tạo ra kết quả từ nhiều phân tích tiếp theo bao gồm nhưng không giới hạn ở: đánh giá chất lượng dữ liệu tuần tự,mới bắt đầuchú thích vị trí phiên mã, phân tích nối biến, phân tích biểu thức vi phân, chú thích chức năng và phân tích làm giàu.
Phân tích RNA không mã hóa dài
Các RNA không mã hóa dài (lncRNA) là các bản phiên mã không mã hóa có độ dài hơn 200 nt và được biết là có vai trò trong việc tổ chức và điều hòa chất nhiễm sắc. Các công nghệ giải trình tự thông lượng cao và tin sinh học đã giúp chúng ta hiểu biết về trình tự lncRNA và thông tin định vị để xác định các lncRNA có chức năng điều tiết quan trọng. Quy trình này cung cấp phân tích lncRNA bên cạnh các phân tích được đề cập trong quy trình Phân tích mRNA của sinh vật nhân chuẩn.
Trình tự khuếch đại 16S/18S/ITS
Quy trình phân tích đa dạng vi sinh vật theo trình tự Amplicon được phát triển dựa trên nhiều năm kinh nghiệm trong phân tích dự án đa dạng vi sinh vật. Quy trình này chứa phân tích cơ bản được tiêu chuẩn hóa, bao gồm nội dung phân tích chính thống của nghiên cứu vi sinh vật hiện tại và phân tích được cá nhân hóa. Báo cáo phân tích rất phong phú và toàn diện, có tùy chọn thực hiện phân tích cá nhân đa dạng. Ngoài ra, các mẫu và nhóm có thể được sửa đổi nhanh chóng để có thể tùy chỉnh và kiểm soát bổ sung.
Phân tích Metagenomics súng ngắn
Quy trình Phân tích Metagenomic Shotgun sử dụng dữ liệu NGS từ các vật liệu gen hỗn hợp được chiết xuất từ các mẫu môi trường. Các phân tích đi kèm cung cấp thông tin chi tiết về sự đa dạng và phong phú của loài, cấu trúc quần thể, mối quan hệ phát sinh gen, gen chức năng và mạng lưới tương quan với các yếu tố môi trường.
Phân tích biến thể NGS-WGS
Phân tích biến thể NGS-WGS là một quy trình phát hiện biến thể tích hợp thực hiện kiểm soát chất lượng dữ liệu, căn chỉnh trình tự, chú thích và phân tích đột biến gen. Quy trình này tuân theo các phương pháp hay nhất của GATK để phát hiện SNP và InDel, đồng thời sử dụng Manta để gọi biến thể cấu trúc.
Nghiên cứu hiệp hội toàn bộ bộ gen (GWAS)
Quy trình GWAS là một phân tích xuôi dòng lấy các tệp VCF được tạo trước đó và dữ liệu kiểu hình tương ứng cho một nhóm cá nhân làm đầu vào. Sử dụng các phương pháp thống kê cụ thể, GWAS nhằm mục đích khám phá các biến thể nucleotide trên toàn bộ gen có liên quan đến sự khác biệt về kiểu hình. Nó đóng một vai trò quan trọng trong việc khám phá các gen chức năng liên quan đến các bệnh phức tạp ở người và các đặc điểm phức tạp ở thực vật và động vật.
Phân tích phân chia hàng loạt (BSA)
Phân tích BSA liên quan đến việc tập hợp các cá thể có đặc điểm kiểu hình cực đoan từ một quần thể tách biệt. Bằng cách so sánh các locus khác biệt giữa các mẫu gộp, phương pháp này nhanh chóng xác định các dấu hiệu phân tử liên kết chặt chẽ với gen mục tiêu. Được sử dụng rộng rãi trong lập bản đồ di truyền của thực vật và động vật, nó là một công cụ có giá trị để nhân giống được hỗ trợ bằng điểm đánh dấu.
Phân tích di truyền tiến hóa
Quy trình Phân tích Di truyền Tiến hóa tận dụng kinh nghiệm sâu rộng của BMKGENE trong các dự án tiến hóa di truyền và bao gồm xây dựng cây phát sinh gen, phân tích mất cân bằng liên kết, đánh giá đa dạng di truyền, nhận dạng quét chọn lọc, phân tích quan hệ họ hàng, phân tích thành phần chính và mô tả đặc điểm cấu trúc quần thể.
