Trình tự mRNA của Eukaryote-NGS
Đặc trưng
● Nắm bắt poly mRNA trước khi chuẩn bị thư viện
● Chuẩn bị thư viện mRNA định hướng tùy chọn để cho phép lấy dữ liệu giải trình tự dành riêng cho chuỗi
● Phân tích sinh học về biểu hiện gen và cấu trúc bảng điểm
Thuận lợi
●Chuyên môn mở rộng: Nhóm của chúng tôi đã xử lý hơn 600.000 mẫu tại BMKGene, trải dài các loại mẫu đa dạng như nuôi cấy tế bào, mô và chất lỏng cơ thể. Chúng tôi mang lại nhiều kinh nghiệm cho mọi dự án và đã hoàn thành thành công hơn 100.000 dự án mRNA-seq trong các lĩnh vực nghiên cứu khác nhau.
●Kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt: Chúng tôi thực hiện các điểm kiểm soát cốt lõi trên tất cả các giai đoạn, từ chuẩn bị mẫu và thư viện đến trình tự và tin sinh học. Giám sát tỉ mỉ này đảm bảo việc cung cấp kết quả chất lượng cao liên tục, đảm bảo với bạn rằng dự án của bạn nằm trong tay đáng tin cậy.
●Chú thích toàn diện: Chúng tôi sử dụng nhiều cơ sở dữ liệu để chú thích chức năng các gen biểu hiện khác nhau (DEG) và thực hiện các phân tích làm giàu tương ứng. Cách tiếp cận toàn diện này cung cấp những hiểu biết sâu sắc về các quy trình di động và phân tử làm cơ sở cho phản ứng bảng điểm, đảm bảo bạn được thông báo đầy đủ về kết quả của dự án.
●Hỗ trợ sau bán hàng: Cam kết của chúng tôi vượt ra ngoài hoàn thành dự án với thời gian dịch vụ sau bán 3 tháng. Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các phiên hỏi đáp để giải quyết bất kỳ truy vấn nào liên quan đến kết quả.
Yêu cầu mẫu và giao hàng
| Thư viện | Chiến lược giải trình tự | Dữ liệu được đề xuất | Kiểm soát chất lượng |
| Poly A phong phú | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Yêu cầu mẫu:
Nucleotide:
| Conc. (Ng/μl) | Số tiền (μg) | Sự thuần khiết | Chính trực | |
| Thư viện tiêu chuẩn | ≥ 10 | 0,2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Giới hạn hoặc không có ô nhiễm protein hoặc DNA hiển thị trên gel. | Đối với thực vật: Rin≥4.0; Đối với động vật: Rin≥4,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; giới hạn hoặc không có độ cao cơ sở |
| Thư viện định hướng | ≥ 10 | 0,2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Giới hạn hoặc không có ô nhiễm protein hoặc DNA hiển thị trên gel. | Đối với thực vật: Rin≥4.0; Đối với động vật: Rin≥4,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; giới hạn hoặc không có độ cao cơ sở |
● Thực vật:
Rễ, thân hoặc cánh hoa: 450 mg
Lá hoặc hạt: 300 mg
Trái cây: 1,2 g
●Động vật:
Trái tim hoặc ruột: 300 mg
Viscera hoặc não: 240 mg
Cơ bắp: 450 mg
Xương, tóc hoặc da: 1g
● Động vật chân đốt:
Côn trùng: 6g
Crustacea: 300 mg
● Đầy máu toàn phần: 1 ống
● Tế bào: 106 tế bào
Giao hàng mẫu được đề xuất
Container: Ống ly tâm 2 ml (không nên sử dụng Lá thiếc)
Ghi nhãn mẫu: Nhóm+sao chép EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Lô hàng:
1. Dry-Ice: Các mẫu cần được đóng gói trong túi và chôn trong băng khô.
2. Các ống bảng RNA: Các mẫu RNA có thể được sấy khô trong ống ổn định RNA (ví dụ RNastable®) và được vận chuyển ở nhiệt độ phòng.
Lưu lượng làm việc dịch vụ
Thiết kế thí nghiệm
Giao hàng mẫu
Khai thác RNA
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Tin sinh học
Eukaryotic Quy trình phân tích giải trình tự mRNA
Tin sinh học
ØKiểm soát chất lượng dữ liệu thô
ØTham khảo bộ gen
ØPhân tích cấu trúc bảng điểm
ØĐịnh lượng biểu hiện
ØPhân tích biểu thức khác biệt
ØChú thích và làm giàu chức năng
Tham khảo bộ gen
Độ bão hòa dữ liệu
Tương quan mẫu và đánh giá các bản sao sinh học
Các gen biểu hiện khác nhau (DEGs)
Chú thích chức năng của DEGS
Làm giàu chức năng của degs
Khám phá những tiến bộ được tạo điều kiện bởi các dịch vụ giải trình tự NGS EUKaryotic của Bmkgene thông qua một bộ sưu tập các ấn phẩm được quản lý.
Huang, L. et al. . 119736. DOI: 10.1016/j.watres.2023.119736.
JIA, LJ et al. . doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. . 884443. DOI: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et al. .
Zhang, Yujie et al. . 101798. DOI: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
