●Nền tảng:Illumina Novaseq 6000 và Novaseq X Plus
●Chế độ giải trình tự:PE150 và PE250
●Kiểm soát chất lượng thư viện trước khi giải trình tự
●Trình tự dữ liệu QC và phân phối:Cung cấp báo cáo QC và dữ liệu thô ở định dạng FASTQ sau khi phân hủy và lọc Q30 đọc
●Tính linh hoạt của các dịch vụ giải trình tự:Khách hàng có thể chọn trình tự theo làn đường, ô lưu lượng hoặc theo lượng dữ liệu cần thiết (trình tự làn đường một phần).
●Kinh nghiệm sâu rộng trên nền tảng giải trình tự Illumina:Với hàng ngàn dự án khép kín với nhiều loài khác nhau.
●Giao hàng trình tự QC Báo cáo:Với các số liệu chất lượng, độ chính xác dữ liệu và hiệu suất tổng thể của dự án giải trình tự.
●Quá trình giải trình tự trưởng thành:với thời gian quay vòng ngắn.
●Kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt: Chúng tôi thực hiện các yêu cầu QC nghiêm ngặt để đảm bảo cung cấp kết quả chất lượng cao nhất quán.
Nền tảng | Tế bào dòng chảy | Chế độ giải trình tự | Đơn vị | Đầu ra ước tính |
Novaseq x | 10b (8 làn) | PE150 | Làn đường đơn Làn đường một phần | 375GB / làn |
25b (8 làn) | PE150 | Làn đường đơn Làn đường một phần | 1000 GB/làn | |
Novaseq 6000 | Tế bào dòng SP (2 làn) | PE250 | Tế bào dòng chảy Làn đường đơn Làn đường một phần | 325-400 m đọc / làn đường |
Tế bào dòng S4 (4 làn) | PE150 | Tế bào dòng chảy Làn đường đơn Làn đường một phần | ~ 800 GB / làn đường |
Số tiền dữ liệu (x) | Nồng độ (qPCR/nM) | Âm lượng | |
Trình tự làn đường một phần
| X ≤ 10 gb | 1nm | ≥ 25 μl |
10 Gb <x ≤ 50 Gb | 2nm | ≥ 25 μl | |
50 Gb <x ≤ 100 GB | 3nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4nm | ≥ 25 μl | |
Trình tự làn đường | Mỗi làn đường | ≥ 1,5nm / nhóm thư viện | ≥ 25 μl / nhóm thư viện |
Ngoài nồng độ và tổng số lượng, một mô hình cực đại phù hợp cũng được yêu cầu.
Lưu ý: Trình tự làn đường của các thư viện đa dạng thấp yêu cầu Phix Spike-in để đảm bảo cuộc gọi cơ sở mạnh mẽ.
Chúng tôi khuyên bạn nên gửi các thư viện làm việc sẵn dưới dạng mẫu. Nếu bạn yêu cầu BMKGene thực hiện thư viện gộp, vui lòng tham khảo
Các yêu cầu thư viện cho trình tự làn đường một phần.
Đỉnh chính phải nằm trong vòng 300-450 bp.
Các thư viện nên có một đỉnh chính duy nhất, không có ô nhiễm bộ điều hợp và không có độ mờ mồi.
Một báo cáo về chất lượng của thư viện được cung cấp trước khi giải trình tự, đánh giá số lượng thư viện và phân mảnh.
Bảng 1. Thống kê về dữ liệu giải trình tự.
ID mẫu | BMKid | Đọc thô | Dữ liệu thô (BP) | Đọc sạch (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6,861,036,000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Hình 1. Phân phối chất lượng cùng với các lần đọc trong mỗi mẫu
Hình 2. Phân phối nội dung cơ sở
Hình 3. Phân phối nội dung đọc trong dữ liệu giải trình tự