Nền tảng phân tích phân tích số lượng lớn bao gồm phân tích tiêu chuẩn một bước và phân tích nâng cao với cài đặt tham số tùy chỉnh. BSA là một kỹ thuật được sử dụng để nhanh chóng xác định các dấu hiệu di truyền liên quan đến kiểu hình. Quy trình công việc chính của BSA chứa: 1. Chọn hai nhóm cá nhân có kiểu hình cực kỳ đối lập; 2. Tập hợp DNA, RNA hoặc SLAF-seq (được phát triển bởi dấu ấn sinh học) của tất cả các cá nhân để tạo thành hai phần lớn DNA; 3. Xác định các chuỗi khác biệt đối với bộ gen tham chiếu hoặc ở giữa, 4. Dự đoán các vùng được liên kết ứng cử viên theo thuật toán chỉ số ED và SNP; 5. Phân tích chức năng và làm giàu trên các gen ở các vùng ứng cử viên, v.v ... Khai thác nâng cao hơn trong dữ liệu bao gồm sàng lọc đánh dấu di truyền và thiết kế mồi cũng có sẵn.
