Trình tự khuếch đại 16S/18S/ITS-PacBio
Tính năng dịch vụ
● Nền tảng giải trình tự: PacBio Revio
● Chế độ tuần tự: CCS (đọc HiFi)
● Khuếch đại vùng mục tiêu, sau đó là liên kết song song các bộ khuếch đại trước khi chuẩn bị thư viện chuông HiFi SMRT
Ưu điểm dịch vụ
●Độ phân giải phân loại cao hơn: Tgiải trình tự khuếch đại ngắn han,cho phép tỷ lệ phân loại OTU cao hơn ở cấp loài.
●Gọi cơ sở có độ chính xác cao: Trình tự chế độ PacBio CCS (đọc HiFi).
●Không bị cô lập: Xác định nhanh thành phần vi sinh vật trong các mẫu môi trường.
●Áp dụng rộng rãi: Nghiên cứu cộng đồng vi sinh vật đa dạng.
●Phân tích tin sinh học toàn diện: Gói QIIME2 mới nhất (thông tin chuyên sâu định lượng về hệ sinh thái vi sinh vật) với các phân tích đa dạng về cơ sở dữ liệu, chú thích, OTU/ASV.
●Chuyên môn sâu rộng: Với hàng nghìn dự án giải trình tự khuếch đại được thực hiện hàng năm, BMKGENE mang đến hơn một thập kỷ kinh nghiệm, đội ngũ phân tích có tay nghề cao, nội dung toàn diện và hỗ trợ sau bán hàng tuyệt vời.
Thông số dịch vụ
| Thư viện | Chiến lược tuần tự | Dữ liệu được đề xuất |
| khuếch đại | PacBio Revio | Thẻ 10/30/50 K (CCS) |
Yêu cầu mẫu
| Nồng độ (ng/µL) | Tổng số tiền (µg) | Thể tích (µL) |
| ≥5 | ≥0,3 | ≥20 |
Đề xuất giao hàng mẫu
Làm đông lạnh mẫu trong nitơ lỏng trong 3-4 giờ và bảo quản trong nitơ lỏng hoặc -80 độ để bảo quản lâu dài. Cần vận chuyển mẫu bằng đá khô.
Quy trình công việc dịch vụ
Giao mẫu
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Bao gồm các phân tích sau:
●Kiểm soát chất lượng dữ liệu thô
●Phân cụm/Khử nhiễu OTU (ASV)
●Chú thích OTU
●Phân tích đa dạng Alpha: nhiều chỉ số, bao gồm Shannon, Simpson và ACE.
●Phân tích đa dạng Beta
●Phân tích giữa các nhóm
●Phân tích tương quan: giữa các yếu tố môi trường với thành phần và tính đa dạng của OUT
●Dự đoán gen chức năng 16S
Biểu đồ phân bố phân loại
Cây phát sinh gen phân bố cộng đồng
Phân tích đa dạng Alpha: ACE
chỉ số
Phân tích đa dạng Beta: PCoA
Phân tích liên nhóm: ANOVA
Khám phá những tiến bộ được hỗ trợ bởi các dịch vụ giải trình tự khuếch đại của BMKGene với PacBio thông qua bộ sưu tập các ấn phẩm được tuyển chọn.
Gao, X. và Wang, H. (2023) 'Phân tích so sánh về đặc điểm và chức năng của vi khuẩn dạ cỏ trong quá trình thích ứng với hiện tượng học khác nhau (Regreen so với Grassy) ở cừu Merino Alpine với hai giai đoạn phát triển trên đồng cỏ Alpine', Quá trình lên men, 9( 1), tr. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. và cộng sự. (2023) 'Thu giữ vật chất tối của vi sinh vật trong đất sa mạc bằng cách sử dụng metagenomics dựa trên văn hóa và phân tích độ phân giải cao', npj Biofilms và Microbiome 2023 9:1, 9(1), trang 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. và cộng sự. (2022) 'Ảnh hưởng của muối axit béo đến đặc điểm lên men, sự đa dạng của vi khuẩn và độ ổn định hiếu khí của thức ăn ủ chua hỗn hợp được chế biến từ cỏ linh lăng, rơm rạ và cám lúa mì', Tạp chí Khoa học Thực phẩm và Nông nghiệp, 102(4), trang 1475– 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. và cộng sự. (2023) 'Sự tương tác giữa các dấu ấn sinh học gây căng thẳng oxy hóa và hệ vi sinh vật đường ruột trong tác dụng chống oxy hóa của chiết xuất từ Sonchus brachyotus DC. trong Căng thẳng oxy hóa đường ruột do Oxazolone gây ra ở cá ngựa vằn trưởng thành ', Chất chống oxy hóa 2023, Tập. 12, Trang 192, 12(1), tr. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
