Exclusive Agency for Korea

BMKCLOUD Đăng nhập

Các sản phẩm

16S/18S/Trình tự khuếch đại của nó

Trình tự khuếch đại với công nghệ Illumina, đặc biệt nhắm mục tiêu vào các điểm 16, 18 và các dấu hiệu di truyền của nó, là một phương pháp mạnh mẽ để làm sáng tỏ phylogeny, phân loại và sự phong phú của các loài trong các cộng đồng vi sinh vật. Cách tiếp cận này liên quan đến việc giải trình tự các vùng tăng huyết áp của các dấu hiệu di truyền vệ sinh. Ban đầu được giới thiệu như một dấu vân tay phân tử bởiWoeses et alNăm 1977, kỹ thuật này đã cách mạng hóa hồ sơ microbiome bằng cách cho phép phân tích không cô lập. Thông qua việc giải trình tự 16S (vi khuẩn), 18S (nấm) và miếng đệm được phiên mã bên trong (ITS, Fungi), các nhà nghiên cứu có thể xác định không chỉ các loài phong phú mà còn là những loài hiếm và không xác định. Được áp dụng rộng rãi như một công cụ then chốt, trình tự khuếch đại đã trở thành công cụ trong các chế phẩm vi sinh vật khác biệt trên các môi trường khác nhau, bao gồm miệng người, ruột, phân, và hơn thế nữa.

Liên hệ với chúng tôi

Chi tiết dịch vụ

Tin sinh học

Kết quả demo

Ấn phẩm nổi bật

Các tính năng dịch vụ

● Nền tảng giải trình tự: Illumina Novaseq.

● khuếch đại các vùng ngắn 16, 18 và ITS của nó, trong số các mục tiêu khuếch đại khác.

● Lựa chọn linh hoạt của khuếch đại.

● Kinh nghiệm dự án trước đây với nhiều mục tiêu khuếch đại.

Lợi thế dịch vụ

●Không bị cô lập:Xác định nhanh chóng thành phần vi sinh vật trong các mẫu môi trường.

●Độ phân giải cao: Trong các thành phần phong phú thấp trong các mẫu môi trường.

●Áp dụng rộng rãi: Nghiên cứu cộng đồng vi sinh vật đa dạng.

●Phân tích sinh học toàn diện: Gói Qiime2 mới nhất (cái nhìn sâu sắc định lượng về sinh thái vi sinh vật) với các phân tích đa dạng về cơ sở dữ liệu, chú thích, OTU/ASV.

●Chuyên môn mở rộng: Với 150 nghìn dự án giải trình tự khuếch đại được thực hiện hàng năm, BMKGene mang lại hơn một thập kỷ kinh nghiệm, một nhóm phân tích có tay nghề cao, nội dung toàn diện và hỗ trợ sau bán hàng tuyệt vời.

Thông số kỹ thuật dịch vụ

Thư viện	Chiến lược giải trình tự	Dữ liệu được đề xuất
Khuếch đại	Illumina PE250	Thẻ 50/100/300K (đọc cặp)

Yêu cầu dịch vụ

Nồng độ (ng/PhaL)	Tổng số tiền (NG)	Khối lượng (Mạnhl)
≥1	≥200	≥20

● Đất/bùn: 1-2g
● Nội dung đường ruột-động vật: 0,5-2g
● Nội dung đường ruột-Insect: 0.1-0,25g
● Bề mặt thực vật (trầm tích làm giàu): 0,1-0,5g
● Trầm tích làm giàu nước dùng lên men)
● Phân (động vật lớn): 0,5-2g
● Phân (chuột): 3-5grains
● Chất lỏng rửa sạch phổi: giấy lọc
Is
Is
● Các vi sinh vật bề mặt: giấy lọc
● Waterbody/Air/Biofilm: giấy lọc
● Endophytes: 1-2g
● Mảng nha khoa: 0,5-1g

Lưu lượng làm việc dịch vụ

Giao hàng mẫu

Xây dựng thư viện

Trình tự

Phân tích dữ liệu

Dịch vụ sau bán hàng

Trước: Trình tự gen toàn bộ bộ gen của vi khuẩn và nấm

Kế tiếp: 16S/18S/Giải trình tự khuếch đại của nó-Pacbio

Bao gồm các phân tích sau:

Kiểm soát chất lượng dữ liệu thô
Phân cụm OTU /DEME (ASV)
Chú thích OTU
Phân tích đa dạng Alpha: Nhiều chỉ số, bao gồm Shannon, Simpson và Ace.
Phân tích đa dạng beta
Phân tích liên nhóm
Phân tích tương quan: giữa các yếu tố môi trường và thành phần và sự đa dạng
Dự đoán gen chức năng 16S

Biểu đồ phân phối phân loại

Bản đồ nhiệt phân loại phân loại phân loại

Phân tích đa dạng Alpha: Đường cong RareFaction

Phân tích đa dạng beta: NMDS

Phân tích liên nhóm: Phát hiện dấu ấn sinh học của LEFSE

Khám phá những tiến bộ được tạo điều kiện bởi các dịch vụ giải trình tự khuếch đại của Bmkgene với Illumina thông qua một bộ sưu tập các ấn phẩm được quản lý.

Dong, C. et al. .

Li, Y. et al. . doi: 10.1186/s40168-023-01497-y

Yang, J., Fu, Y. và Liu, H. (2022) 'Microbiomes của bụi không khí được thu thập trong thí nghiệm hỗ trợ sinh học kín trên mặt đất Cung điện Lunar 365', vi khuẩn môi trường, 17 (1), pp. 1 trận20. doi: 10.1186/s40793-022-00399-0/con số/8.

Yin, S. et al. . 127678. DOI: 10.1016/j.biortech.2022.127678.