O'ziga xos lokusni ko'paytirish tartibi (SLAF-SAq)
Ishqiboz
Texnik sxema
Xizmat xususiyatlari
● novdalar bilan pe150 bilan ketma-ketlik.
● 1000 dan ortiq namunalarni basseynni yoqish uchun kutubxona tayyorlash.
● Ushbu usul har bir holat uchun turli xil biologikformatika quvurlar bilan ishlatilishi mumkin:
Mos keladigan genom: SNP va AGLE kashfiyoti
Maqsadli genom: namunaviy klasterlash va SNP kashfiyoti
● ichidaSilliqadaDizayndan oldingi bosqichni cheklash ferment kombinatsiyalari genom bo'ylab tekislik teglarini bir tekis taqsimlantiradigan narsalarni topish uchun namoyish etiladi.
● Oldindan tajriba paytida uchta ferment kombinatsiyalari 9 ta namunalarda 9 ta namunada sinovdan o'tkaziladi va ushbu ma'lumotni loyiha uchun optimal cheklash ferment kombinatsiyasini tanlash uchun ishlatiladi.
Xizmatning afzalliklari
●Yuqori genetik marker kashfiyot: Yuqori taklifli shtrip-kod tizimini birlashtirishning katta populyatsiyasini bir vaqtning o'zida bir vaqtning o'zida ketma-ket birlashtirish imkonini beradi va ularni konpentifikatsiya qilish samaradorligini oshirishga imkon beradi, bu esa matn raqamlari turli xil tadqiqotlarning turli xil talablariga javob beradi.
● Genomga nisbatan past qaramlikQuyidagi turlarga yoki ma'lumotsiz qo'llanilishi mumkin.
●Moslashuvchan sxema dizayni: Bir-fermme, ikki ferment, ko'p fermme hazm qilish, turli xil fermentlar turli xil ilmiy-tadqiqot maqsadlari yoki turlarini nazorat qilish uchun barcha turdagi fermentlar tanlanishi mumkin. BuSilliqadaPreparatning maqbul ferment dizaynini ta'minlash uchun amalga oshiriladi.
● Ferment hazm qilishda yuqori samaradorlik: AN ning o'tkazilishiSilliqadaPrizayndan oldingi va tajribadan oldingi tajriba xromosomadagi (1 Slaf / 4kb) va takroriy protsessor ketma-ketligini kamaytirdi (<5%).
●Keng ekspertiza: Jamoamiz har bir loyiha uchun ko'p tajribaga ega bo'lib, unda yuzlab tur turlari, shu jumladan o'simliklar, sutemizuvchilar, qushlar, hasharotlar va suv organizmlari bo'yicha 5000 dan ortiq SLF-SIQ loyihalarini yopish.
● O'z-o'zini rivojlangan bioinformatik ish oqimi: BMKGene final ishlab chiqarishning ishonchliligini va aniqligini ta'minlash uchun Slain-SeQ uchun integratsiyalashgan bioinformatik ish olib bordi.
Xizmat texnikasi
| Tahlil turi | Tavsiya etilgan aholi shkalasi | Ketma-ketlik strategiyasi | |
| Chuqurning chuqurligi | Tag raqami | ||
| Genetik xaritalar | 2 Ota-onalar va> 150 naslchilik | Ota-onalar: 20x wgs O'chirish: 10x | Genom o'lchamlari: <400 MB: WGs tavsiya etiladi <1GB: 100k teglari 1-2gb :: 200k teglari > 2GB: 300k teglari Maksimal 500k teglari |
| Genombe Worde uyushmasi bo'yicha tadqiqotlar (GWAS) | ≥200 namunalar | 10x | |
| Genetik evolyutsiya | ≥ 30 ta namunalar,> har bir kichik guruhdan 10 ta namunalar bilan | 10x | |
Xizmat talablari
Yoriq ≥ 5 NG / mkl
Umumiy miqdor ≥ 80 Ng
Nanodrop odt260 / 280 = 1.6-2.5
Agalar jeli: yo'q yoki cheklangan tanazzul yoki ifloslanish
Tavsiya etilgan namunaviy etkazib berish
Konteyner: 2 ml Centrifuugu naycha
(Ko'p namunalar uchun biz etanolni saqlab qolmaslikni maslahat beramiz)
Namuna yorlig'i: namunalar aniq belgilangan va namunaviy ma'lumot shaklini taqdim etish kerak.
Etkazib berish: Quruq-muz: birinchi navbatda namunalarni qoplash kerak va quruq muzga ko'milishi kerak.
Xizmat ishi
QC namuna
Pilot tajriba
Slaf-tajriba
Kutubxonaga tayyorgarlik
Tartibsizlik
Ma'lumotlar tahlili
Sotishdan keyingi xizmatlar
Quyidagi tahlilni o'z ichiga oladi:
- Imsiya ma'lumotlari QK
- Slaf yorlig'ini rivojlantirish
Ko'rsatilgan genomga xaritalash
Havolalar iboraisiz: klasterlash
- Slaf teglari tahlili: Genomdagi statistika, tarqatish
- Marker kashfiyot: SNP, AGP, SNV, CV CV qo'ng'iroq va izoh
Xromosomalardagi Slaf teglarini tarqatish:
SNPS xromosomalarga taqsimlanishi:
SNP binosi
| Yil | Jurnal | IF | Sarlavha | Arizalar |
| 2022 yilda | Tabiat aloqasi | 17.694 | Giga-xromosomalar va giga-genomining genom asoslari Peeoniya Ostii | Sadaqasi |
| 2015 yil | Yangi fitolog | 7.433 | Agronomik ahamiyatga ega agronomik ahamiyatga ega bo'lgan langar iziga uydagi izlanish izlari soya fasulyosi | Sadaqasi |
| 2022 yilda | Ilg'or tadqiqot jurnali | 12.822 | G. Xirsutumga gossyumbenensening genome-kengligi introgrogram paxta tolasi sifati va hosildorligini bir vaqtning o'zida yaxshilash uchun ustun lokilni oching fazilatlar | Slaf-evolyutsion genetika |
| 2019 yil | Molekulyar o'simlik | 10.81 | Aholi jinsi tahlili va de Hayajonlangan o'tlarning kelib chiqishi aniqlandi Evolyutsion o'yin sifatida guruch | Slaf-evolyutsion genetika |
| 2019 yil | Tabiat genetikasi | 31.616 | Umumiy emakkir, Kipr Carpio-ning genome ketma-ketligi va genetik xilma-xilligi | Slaf-bog'lanish xaritasi |
| 2014 yil | Tabiat genetikasi | 25.455 | Dorig'al yerfıstığı dyryumzine, polipedylarga dikteningni tushunishni ta'minlaydi evolyutsiya va ekinlarning uyida yashash. | Slaf-bog'lanish xaritasi |
| 2022 yilda | O'simlik biotexnologiya jurnali | 9.803 | ST1 ni aniqlash - bu urug 'morfologiyasining Xitfiking bilan bog'liq tanlovni ochib beradi Soyadagi uydagi uydagilar paytida yog 'miqdori | Slaf-markerni rivojlantirish |
| 2022 yilda | Molekulyar fanlar xalqaro jurnali | 6.208 | DAKDORE-Leymus Mollis 2ns uchun identifikatsiya va DNKni ishlab chiqish (2D) Midomik xromosoma almashtirish | Slaf-markerni rivojlantirish |
| Yil | Jurnal | IF | Sarlavha | Arizalar |
| 2023 yilda | O'simlik fanlari bo'yicha chegaralar | 6.735 | Pirus pirifoliyasining pishib etish paytida QTL xaritasi va shakar miqdorini txtetr taqvosini tahlil qilish | Genetik xaritada |
| 2022 yilda | O'simlik biotexnologiya jurnali | 8.154 | SHAYBANIY DOMPANIYASIDA ST1 ni aniqlash, soyadagi uydagi uydagi uydagilar uchun urug 'morfologiya va neft tarkibini o'z ichiga olgan holda tanlovni ochib beradi
| SNP qo'ng'irog'i |
| 2022 yilda | O'simlik fanlari bo'yicha chegaralar | 6.623 | Genome-Worde Uyushma uyushmasining qurg'oqchilik muhitida zo'rg'a finepotalarni xaritasi.
| Gina |
