O'simlik / hayvonlar butun genomes ketma-ketligini
Xizmat xususiyatlari
● Kutubxonaga tayyorgarlik standart yoki PCR-dan bepul bo'lishi mumkin
● 4-sonli ketma-ketlikda mavjud: Illumman Nooth, MGI T7, Nanopore Prometsiy P48 yoki Paclio Rasio.
● Biologikformatika tahlil variantlarni aniqlash bo'yicha yo'naltirilgan: SNP, SNP, SV va CNV
Xizmatning afzalliklari
●Keng ekspertiza va nashr yozuvlari: 1000 dan ortiq turdagi genome-ketma-ketlikda to'plangan tajriba natijasida 1000 dan ortiq nashr etilgan holatlar 5000 dan ortiq miqdordagi ta'sirli ish joylariga olib keldi.
●Bioinformatika bo'yicha keng qamrovli tahlil: O'zgarish qo'ng'iroqlar va funktsiyalarni izohlash.
● Sotishdan keyingi yordam:Bizning majburiyatimiz loyihani tugatgandan tashqari, sotuvdan keyin 3 oydan keyin kengayadi. Shu vaqt ichida biz loyihalarni amalga oshirish uchun har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatib borish, muammolarni bartaraf etish, Q vada o'tkazishni taklif qilamiz.
●Har tomonlama izoh: Biz bir nechta ma'lumotlar bazalarini aniqlangan o'zgarishlarni amalga oshirish va bir nechta ilmiy loyihalar bo'yicha ma'lumotlarni taqdim etadigan tegishli boyitish tahlilini amalga oshiramiz.
Xizmat texnikasi
| O'zgarish uchun variantlar | Ketma-ketlik strategiyasi | Tavsiya etilgan chuqurlik |
| SNP va AGEL | Illumina Novasq Pe150 yoki mgi t7 | 10x |
| SV va CNV (kamroq aniq) | 30x | |
| SV va CNV (aniqroq) | Nanopore rom p48 | 20x |
| SNPS, Bo'lamalar, SV va CNV | Pakbio resio | 10x |
Namuna talablari
| To'qima yoki qazib olingan nuklein kislotalar | Illumina / MGI | Nanopore | Pakbio
| ||
| Hayvonlarning ichkilari | 0,5-1 g | ≥ 3.5 g
| ≥ 3.5 g
| ||
| Hayvonlar mushaklari | ≥ 5 g
| ≥ 5 g
| |||
| Sutemizuvchi qon | 1,5 ml | ≥ 0,5 ml
| ≥ 5 ml
| ||
| Parrandachilik / baliq qon | ≥ 0,1 ml
| ≥ 0,5 ml
| |||
| O'simlik - yangi barg | 1-2 g | ≥ 2 g
| ≥ 5 g
| ||
| Madaniyatli hujayralar |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| Hasharot yumshoq to'qima / individual | 0,5-1 g | ≥ 1 g
| ≥ 3 g
| ||
| Qazib olingan DNK
| Konsentratsiya: ≥ 1 ng / mkl Miqdor: ≥ 30 ng Cheklangan yoki buzilish yoki ifloslanish
| Konsentratsiya Miqdori
OD260 / 280
OD260 / 230
Cheklangan yoki buzilish yoki ifloslanish
| ≥ 40 ng / mkl 4 mkg / oqim hujayralari / namuna
1.7-2.2
≥1.5 | Konsentratsiya Miqdori
OD260 / 280
OD260 / 230
Cheklangan yoki buzilish yoki ifloslanish | ≥ 50 ng / mkl 10 mkg / oqim hujayralari / namuna
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| PCR-BEPUL KIRITUKALARNI TUZATISH: Konsentratish natijasida 40 NG / mkl Miqdl≥ 500 NG | |||||
Xizmat ishi oqimi
Namuna etkazib berish
DNK chiqarib olish
Kutubxona qurilishi
Tartibsizlik
Ma'lumotlar tahlili
Ma'lumotlar etkazib berish
Quyidagi tahlilni o'z ichiga oladi:
- Xom ma'lumotlarning sifati nazorati
- Malosferaga moslashish statistikasi
- Variant identifikatsiya: SNP, AGEL, SV va CNV
- Varboshivlarning funktsional izohi
Ma'lumotlarning genomi - ketma-ketlik chuqurligini taqsimlash statistikasi
Snp bir nechta namunalar qatoriga qo'ng'iroq qilmoqda
KDS mintaqasida va Genom-Word mintaqalarida indele uzunligi statistikasi
Genome - s ayirimli sxemasi bo'ylab turli xil taqsimlash
Belgilangan variantlar bilan genlarning funktsional izohi - gen ontologiya
Chay, Q. (2023) "Glutatiye S-Transevarae GHTTT19" Antokyanin "paxtadagi to'planish jurnalida" Antotyanin "ni tartibga soluvchi po'stlog'ini tartibga solish orqali gulbarg pigmentatsiyasini, masalan, Faotexnologiya jurnalida, p. 433. Doi: 10.1111 / PBI.13965.
Cheng, H. va boshqalar. (2023) "Xromosoma darajasida yovvoyi Hevareya Genome genomik-boqish va qimmatbaho litsia uchun rezina hosildorlik jurnalini, 21 (5), 1158-1072. DOI: 10.1111 / PBI.14018.
Li, A. va boshqalar. (2021) "Estuarine istiridye" genomi, aloqa biologiyasi, kommunikatsiya biologiyasi, 1: 1 (1), pp. 1-12. DOI: 10.1038 / S420031028232-6.
Zeng, T. va boshqalar. (2022) Vaqt o'tishi bilan Xitoy tubidagi tovuqlarda genom va metillyatsiya o'zgarishlarining tahlili turni saqlash, 5 (1), pp. 1-12. DOI: 10.1038 / S42003-022907-7.
