Genom evolyutsiyasi
Pnas
"Oltin baliq" ning evolyutsion kelib chiqishi va uydagi uydagi tarixi (Karassus Aura)
Pakbiio | Illumina | Bionano Genom xaritasi | Hi-c genome anjumasi | Genetik xaritasi | Gvas | Rna seq
Diqqatga sazovor joylar
1.Galdemfish genomi yuqori sifatli yig'ish versiyasi bilan yangilandi, 65,75%, 50 psevproxromosomaga (Scafdollohromosomes) bilan yangilandi (Scafdollo N55 = 31.84 Mb). Ikkita subgenomadan ajralib chiqmagan.
Kelishom supurishning 2-moddasi 2013 yillarning 390 dan ortiq nomzodlar geni, ehtimol, 390 dan ortiq nomzodlar genidan iborat bo'lgan, ehtimol, 390 dan ortiq nomzodlar genini ochib berishdan iborat.
3. Uy sharoitida ishlab chiqarilgan oltin baliqlarning dorsaliy flakiga 378 nomzod (378 nomzod) ochildi. Tirosin-protein keinema muxbiri shaffoflik bilan bog'liq bo'lgan sabablar keltirilgan gen sifatida aniqlandi
Fon
Oltin baliq (Capassius Aura) - bu eng muhim fermadan qadimgi Xitoyning eng muhim fermalaridan biri. Ular Charlz Darvinni "deyarli cheksiz rang-baranglik bilan olib borish", deb izoh berishdi. Uy-joy va naslchilikning juda turli xil xususiyatlari va uzoq tarixi baliq fiziologiya va evolyutsiya uchun ajoyib genetik model tizimini ishlab chiqaradi.
Yutuqlar
Oltin bilan genom
JPakbio va Kapumina juftligi ketma-ketlik ma'lumotlarini taqqoslash 1,657 g boshlang'ich majlisni (ThIg 'N57 Kb) olib chiqadi. Bionano optik xaritasi yaratildi va yig'ishni 1,73 Gb hajmgacha tuzatdi (taxmin qilingan genom o'lchami: 1,8 Gb). Salom-C asosli majlisini 606 Kb dan 31,84 MB gacha 806 kb dan 31,84 Mb gacha yaxshilandi va 95,75% (1,65 Gb) ga yo'naltirilgan va langarchilik stavkasiga ega bo'ldi. Genom 56,251 ta kodlash gen va 10,098 uzoq kodlovchi transkriptni o'z ichiga oladi. Bundan tashqari, 38 potentsial mintaqaviy mintaqalar 50 xromosomadan taxmin qilingan.
1-chi oltin baliq genomi
TVO BRADBY to'plamlari qadimgi duragayatsiya hodisasi natijasida 50 ta oltin xromosomalar aniqlandi. Oltin baliqlari va barbiney o'rtasida mos keladigan xromosomalar to'plami (YUSH01 ~ A25), ya'ni Barbinae b (krb01 ~ b25).
Uy-joy va tanlangan supurish
AJami 16 yovvoyi tipidagi CARPlar va 185 ta vakillik valyutalari taxminan 12,5x ni tashkil etadi, taxminan 12.5xening o'rtacha tartibda amalga oshirildi, bu 4.3 terabozlarni ishlab chiqaradi. Filojenetik rekonstruktsiya va PCA tahlili boshqa ikkita liniyalarga bo'lingan boshqa oltin baliqlariga qaraganda keng tarqalgan oltin baliqlari va boshqa oltin baliqlari o'rtasidagi yaqinroq munosabatni tasdiqladi.
LD To'rtta sarpopulyatsiya bo'yicha kesmalikdagi to'rtta supopulyatsiyada uyda qolish va oltin baliqlardagi kuchli sun'iy tanlov paytida genetik muammolar mavjudligini qo'llab-quvvatladi. Wen Goldfish va tuxum oltin baliqlari uchun genetik xilma-xillikni (m) genetik xilma-xillikni oshirish (P) genetik xilma-xillikni oshirish va tuxum baliqlarini uyg'onish paytida genetik tafovutlarni sezilarli darajada oshirdi. 25,2 Mb va 946 genni o'z ichiga olgan 50 ta taniqli genom mintaqalar vakillik ma'lumotlari (33 ta oltin va 16 lochiy lol). 2013 yilda 2013 yil 393 genni kengaytirish tahlilini amalga oshirish mintaqalari. Ushbu genlar past xilma-xillik topilgan, ehtimol oltin baliqlar bilan bog'liq bo'lgan katta uyda dog 'belgilari bilan bog'liq fenotiplarga hissa qo'shgan.
3-rasm. Genom-Womer Dalencation bilan bog'liq tahlil
Uy sharoitida oltin baliqlarda Gvas
DOrsal Fin - bu chap oltin baliqni tuxumni baliq baliqlaridan ajratib turadi. 96 dona oltin baliqlari va 87 ta tuxum oltin baliqlari 13,3 xromosomalar va ya'ni kurgenomlar o'rtasida notekis taqsimlanganligi aniqlandi. Ushbu nomzodlar gellari bo'yicha funktsional tahlil biologik jarayonlarni o'z ichiga olgan "hujayra yuzasi retseptorlari", "O'tkazilishni tashish", "skelet tizimini rivojlantirish", "Skelet tizimini rivojlantirish", "Skelet tizimini rivojlantirish" va boshqalarni ta'kidladi va boshqalar.
Uy sharoitida oltin baliq ovlashda dorsal jarima floti
INaqshli shkalasi bilan bog'liq bo'lgan gvas, bitta kuchli birlashma cho'qqisi aniqlandi. Nomzodlik hududlaridan birida tirozin-protein kineas retseptorini kodlash gen kodini kodlash aniqlandi.
Shaffof miqyosli xususiyatlari
Ma'lumotnoma
Ctovuq D va boshqalar. Oltin baliqning evolyutsion kelib chiqishi va uydagi uydagi tarixi (Karassyus Aura). PNAS (2020)
Yangiliklar Bioomaker texnologiyalari bilan so'nggi muvaffaqiyatli ishlarni baham ko'rish, roman ilmiy yutuqlari, shuningdek, o'quv jarayonida qo'llaniladigan taniqli usullar.
Post vaqti: yanvar-04-2022