Genomom Evolution, Pangenome
Pan-genom nima?
Yig'ilgan dalillar turdagi turdagi farqlar katta bo'lishi mumkinligini ko'rsatmoqda. Bitta genom yagona turdagi genetik ma'lumotlarning butun rasmini olish uchun etarlicha uzoqdir. Pan-genome tadqiqotining maqsadi - turdagi keng qamrovli genomik genomik genomik genomik genomik genomik genomik genomik genomik genomik va o'zgarishlarni amalga oshiradigan va o'zgaruvchanlik chuqurlashiga imkon beradigan ko'plab shtammlarni yig'ish.
Pan-genomni o'rganish tendentsiyalari
1 1-rasmda pan-genomning nashr etilgan tadqiqot ishlari tendentsiyalari.
Izoh: Rasmda tabiatda, hujayra va fan seriyasida chop etilgan maqolalarning nomlarini qidirish uchun "pan-genom" ni qabul qilish natijasi ko'rsatilgan
a. Bir nechta namunalardan o'qilgan ma'lumotnomalarga mos keladi va tushumlar taqdim etillalar Roman kontyektlariga yig'iladi. Ushbu romani konteynerlarini asl ma'lumot ketma-ketligiga qo'shib, pangenome ma'lumotnomasi qurilishi mumkin. DISPATSION mintaqalari Pangenomga qaytib kelganlarning barchasini xaritalash asosida aniqlaydilar.
b. De Novo bir nechta kirish jinslari yig'ilishi butun genome genom mintaqalarini aniqlash uchun butunlay genome tekislash usullariga imkon beradi.
v. Pan-genomen grafigi butunlay genome tekislamasi yoki De Novo grafik anjumani tomonidan qurilishi mumkin, ular grafika orqali noyob yo'llar sifatida ajratiladigan hududlarning variantlarini samarali ravishda saqlaydi.
Pan-genomni qanday qurish kerak?
2-rasmda pan-genom yondashuvini taqqoslash1
a. Bir nechta namunalardan o'qilgan ma'lumotnomalarga mos keladi va tushumlar taqdim etillalar Roman kontyektlariga yig'iladi. Ushbu romani konteynerlarini asl ma'lumot ketma-ketligiga qo'shib, pangenome ma'lumotnomasi qurilishi mumkin. DISPATSION mintaqalari Pangenomga qaytib kelganlarning barchasini xaritalash asosida aniqlaydilar.
b. De Novo bir nechta kirish jinslari yig'ilishi butun genome genom mintaqalarini aniqlash uchun butunlay genome tekislash usullariga imkon beradi.
v. Pan-genomen grafigi butunlay genome tekislamasi yoki De Novo grafik anjumani tomonidan qurilishi mumkin, ular grafika orqali noyob yo'llar sifatida ajratiladigan hududlarning variantlarini samarali ravishda saqlaydi.
Yaqinda nashr etilgan paninlar
● Calen kenomalari2
● Pomidor paninlari 3
● guruch pan-yengi4
● Kungaboqar paneli5
● Soyban Pan-genom 6
● guruch pan-genom7
● Arley pan-genom8
● Bug'doy paneli9
● Sorogum pan-genom10
● Fitoplanton pan-genom11
Ma'lumotnoma
1 NAT O'simliklar. 2020; 6 (8): 914-920. Doi: 10.1038 / S4147.020-073-0
2. JM, Guan Z, X, va boshqalar qo'shig'i. Sakkizta yuqori sifatli genomlar paneli arxitekturasini va Brassika Napusning ekotiplarini farqlashini ochib beradi. NAT O'simliklar. 2020; 6 (1): 34-45. DOI: 10.1038 / S4147-019-057-7
3. Gao L, Gonda I, Sun H va boshqalar. Pomidor pan-genomi yangi genlarni va mevali lazzatni tartibga soluvchi noyob allele. Natenne. 2019; 51 (6): 1044-1051. DOI: 10.1038 / S4158019-0410-2
4. zhao q, feng Q, lu h va boshqalar. Pan-genomni tahlil qilish madaniyatli va yovvoyi guruchning genomiy xilma-xilligi darajasini yoritadi [Natenne Genetida tuzatiladi. 2018 Avg; 50 (8): 1196]. Natenne. 2018; 50 (2): 278-284. DOI: 10.1038 / S4158-018-0041-Z
5. Hurbun s, Bercovich N, Tadesco m va boshqalar. Kungaboqar panelli tahlil shuni ko'rsatadiki, gibridizatsiya o'zgartirilgan genologik va kasalliklarga chidamliligini ko'rsatadi. NAT O'simliklar. 2019; 5 (1): 54-62. DOI: 10.1038 / S4147-018-0329-0
6. Liu y, Du H, Li P va va boshqalar. Yovvoyi va madaniy yasalgan soya. Hujayra. 2020; 182 (1): 162-176.e13. DOI: 10.1016 / J.cell.2020.05.023
7. Qin p, lu h, Du h va va boshqalar. 33 genetik jihatdan xilma-xil guruch kirishlarining pan-genomini tahlil qilish yashirin genomik tafovutlarni ochib beradi [Print onlayn nashrdan oldin nashr etilgan, 25 may 25 may]. Hujayra. 2021; S0092-8674 (21) 00581-x. DOI: 10.1016 / J.cell.2021.046
8. Jayakodi m, padmarasu s, eler g va boshqalar. Arpa pan-genomi mutatsiya naslchilikning yashirin merosini ochib beradi. Tabiat. 2020; 588 (7837): 284-289. DOI: 10.1038 / S41586-02020-294-8
9. piyodalar s, Gao l, Monat C va boshqalar. Bir nechta bug'doy nasoslari zamonaviy naslchilikning global o'zgarishini ochib beradi. Tabiat. 2020; 588 (7837): 277-283. Doi: 10.1038 / S41586-02020-2961-X
10. Tao Y, Luo H, xu j va boshqalar. Kublik va yovvoyi jo'xori genomida keng farq [onlayn nashrdan oldin nashr etildi, 2021 may kuni]. NAT O'simliklar. 2021; 10.1038 / S4147-021-00925-X. DOI: 10.1038 / S4147-021-00925-X
11. Fan X, Qiu H, Han W va va boshqalar. Fitoplankton Pangenome keng prokaryotik gorizontal geniont gorizontal generatsiyasining turli funktsiyalarini uzatishni ochib beradi. SCI ARR. 2020; 6 (18): EABA0111. 2020 yil 29 aprel. Doi: 10.1126 / Sciadv.Baba0111
Post vaqti: yanvar-04-2022