Nanoporga asoslangan to'liq uzunlikdagi transkriptomlar ketma-ketligi
Nanopor sekvensiyasi o'zini boshqa ketma-ketlik platformalaridan ajratib turadi, chunki nukleotidlar to'g'ridan-to'g'ri DNK sintezisiz o'qiladi va o'nlab kilobazalarda uzoq o'qish hosil qiladi. Bu to'liq metrajli transkriptlarni to'g'ridan-to'g'ri o'qish va transkriptomik tadqiqotlardagi muammolarni hal qilish imkonini beradi.
√ Pastki ketma-ketlikka xos moyillik
√ Gen tuzilishini o'rganish uchun cDNKning to'liq uzunlikdagi o'qilishi
√ Bir xil miqdordagi transkriptlarni qoplash uchun kamroq ma'lumot talab qilinadi
√ Har bir gen uchun bir nechta izoformlarni aniqlash
√ Izoform darajasida ifoda miqdorini aniqlash
Oddiy bioinformatika quvur liniyasi
Biomarker texnologiyalari bilan eng so'nggi muvaffaqiyatli holatlar
1. To‘liq uzunlikdagi transkriptomlarning qiyosiy tahlillari Gnetum luofuense poyasining rivojlanish dinamikasini aniqlaydi.
Jurnal: Genetikadagi chegaralar
Nashr qilingan: 2021 yil mart
Kalit so'zlar: MinION | Muqobil birlashma | APA | lncRNA | Differensial ifodalangan transkriptlar
To'liq matnni o'qing
2. Turlararo geterotransplantlarda mayda RNKlarning kurtaklardan ildizlarga bir tomonlama harakatlanishi.
Jurnal: Tabiat o'simliklari
Nashr qilingan: 2021 yil yanvar
Kalit so'zlar: Nanopor | Illumina | to'liq uzunlikdagi mobil mRNKni aniqlash
3. Qushqo'nmas ildizlarining to'liq metrajli transkriptom tahlili arbuskulyar mikorizali zamburug'lar tomonidan qo'zg'atilgan tuzga chidamlilikning molekulyar mexanizmini ochib beradi.
Jurnal: Atrof-muhit va eksperimental botanika
Nashr qilingan: 2021 yil yanvar
Kalit so'zlar: MinION | Differensial ifodalangan transkriptlar | Transkripsiya omillari | Muqobil biriktirish
4. Qurg'oqchilik stressiga javoban atirgul (Rosa chinensis) ildizlari va barglarining fiziologik xarakteristik o'zgarishlari va to'liq uzunlikdagi transkriptomasi.
Jurnal: O'simlik va hujayra fiziologiyasi
Nashr qilingan: 2020 yil oktyabr
Kalit so'zlar: PromethION | Differensial ifodalangan transkriptlar | Funktsional bashorat | Birlashtirilgan izoformlar | TF va lncRNA
5. PacBio va Arabidopsis transkriptomining nanopora asosidagi RNK ketma-ketligini tahlil qilish va har tomonlama taqqoslash.
Jurnal: O'simlik usuli
Nashr qilingan: 2020 yil aprel
Kalit so'zlar: GridION | PromethION | PacBio davomi | Illumina NovaSeq | Genom moslashuvi | Transkriptni aniqlash | Muqobil birlashma | SSR | LncRNA | Izoformani aniqlash
Yangiliklar va muhim voqealar Biomarker Technologies bilan so'nggi muvaffaqiyatli holatlarni baham ko'rish, yangi ilmiy yutuqlar va tadqiqot davomida qo'llaniladigan taniqli texnikalarni qo'lga kiritishni maqsad qilgan.
Yuborilgan vaqt: 2022 yil 08-yanvar