Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud Kirish

Mahsulotlar

Evolyutsion genetika

Evolyutsiya genetikasi evolyutsiyaning turli shaxslar, shu jumladan SNPlar, jumladan SNPlar, SNVs va CNVS va CNV-ning ajoyib tartibini taqdim etish uchun mo'ljallangan kompleks xizmatdir. Ushbu xizmat evolyutsion siljishlar va populyatsiyalarning genetik xususiyatlarini, shu jumladan aholining tarkibi, genetik xilma-xillik va fitojenetik aloqalarni baholash uchun zarur bo'lgan barcha muhim tahlillarni o'z ichiga oladi. Bundan tashqari, u gen oqimida izlanishlarga olib keladi, bu samarali aholi sonini va tafovut vaqtini baholash imkonini beradi. Evolyutsion genetikashunoslik turlarning kelib chiqishi va moslashuvi uchun foydali tushunchalarni keltirib chiqaradi.

Bmkgenada biz yirik populyatsiyalarni amalga oshirish uchun ikkita xiyonatni taklif etamiz: butunlay genome serveri (WG) yoki INSOME-ketma-ketlik usulini, uyda rivojlangan o'ziga xos lokusni ko'paytirish (SLAF). WGs kichik genomlarga mos kelganda, Slaf uzoqroq genomlarni o'rganish uchun iqtisodiy jihatdan samarali alternativa sifatida paydo bo'ladi, ketma-ket keladigan xarajatlarni samarali ravishda kamaytiradi.

Biz bilan bog'lanish

Xizmat tafsilotlari

Bioinformatika

Demo natijalari

Tanlangan nashrlar

Xizmatning afzalliklari

Takagi va boshqalar.,O'simlik jurnalisi, 2013 yil

●Biologikformatika-ni keng qamrovli tahlil:turlarning evolyutsion salohiyatini aks ettiradigan va konvergent evolyutsiyasining evolyutsiyasi va parallel evolyutsiyasining minimallashtirilgan ta'sirini va o'zaro ta'sirli filojenetik aloqasini aniqlash

●Ixtiyoriy sozlash tahlil: masalan, nukleotid va aminokislotalar darajasidagi o'zgarishlar asosida tafovut vaqti va tezligini baholash kabi.

●Keng ekspertiza va nashr yozuvlari: BMKgena aholi va evolyutsion genetika loyihalari, minglab turlarni qamrab olgan holda, minglab turlarni, molekulyar o'simliklar, o'simlik biotexnologiya jurnalida chop etilgan 1000 dan ortiq yuqori darajadagi loyihalarni to'pladi.

● Yuqori malakali bioinformatika jamoasi va qisqa tahlil tsikllari: Kengaytirilgan genomik tahlilda katta tajribaga ega bo'lgan BMKgen jamoasi tezkor o'zgarishlar vaqtini to'liq tahlil qiladi.

● Sotishdan keyingi yordam:Bizning majburiyatimiz loyihani tugatgandan tashqari, sotuvdan keyin 3 oydan keyin kengayadi. Shu vaqt ichida biz loyihalarni amalga oshirish uchun har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatib borish, muammolarni bartaraf etish, Q vada o'tkazishni taklif qilamiz.

Xizmat texnikasi va talablari

Ketma-ketlik turi

Tavsiya etilgan aholi shkalasi

Ketma-ketlik strategiyasi

Nukleotid talablari

Butun genome ketma-ketlik

≥ 30 kishi, har bir kichik guruhdan 10 kishi

10x

Konsentratsiya: ≥ 1 ng / mkl

Jami mitti riq 30ng

Cheklangan yoki buzilish yoki ifloslanish

O'ziga xos-lokus ko'paytirilgan parcha (SLAF)

Yorliq chuqurligi:

10x

Teglar soni:

<400 MB: WGs tavsiya etiladi

<1GB: 100k teglari

1GB

> 2GB: 300k teglari

Maksimal 500k teglari

Yoriq ≥ 5 NG / mkl

Umumiy miqdor ≥ 80 Ng

Nanodrop odt260 / 280 = 1.6-2.5

Agalar jeli: yo'q yoki cheklangan tanazzul yoki ifloslanish

Xizmat ishi oqimi

Eksperiment dizayni

Namuna etkazib berish

Kutubxona qurilishi

Tartibsizlik

Ma'lumotlar tahlili

Sotishdan keyingi xizmatlar

Oldingi: Segriant tahlil

Keyingisi: Metabolomika

Xizmatda aholi tuzilmasi (floyogenetik daraxt, phitalar, populyatsiyasi jadvallari), populyatsiyaning xilma-xilligi va aholi populyatsiyasi, qulay supurishni tanlashda. Xizmat shuningdek, shaxsiylashtirilgan tahlilni (masalan, kelishmovchilik vaqti, gen oqimi) kiritilishi mumkin.

*Ko'rsatilgan demo keltirilgan natijalar BMKGen bilan nashr etilgan genomlardandir

1. Agar genetik o'zgarishlarga asoslangan filogenetik daraxt, populyatsiya tarkibi va PCAning qurilishi mavjud.

Fliojenetik daraxt umumiy ajdod bilan bo'lgan turlar orasida taksonomik va evolonal munosabatlarni anglatadi.
PCA, sub-populyatsiyalar o'rtasidagi yaqinlikni tasavvur qilishni maqsad qiladi.
Aholi tarkibi allel chastotalar nuqtai nazaridan genetik jihatdan ajratiladigan subsentsiyalarning mavjudligini ko'rsatadi.

3,1filogenetik-daraxt 3-2pca 33populyatsiyalash-tuzilishi

Chen va et. AL.,Pnas, 2020

2. -eleks supurish

Selektiv supur foydali saytning tanlangan va chastotalarining ko'payishi va bo'shatilgan joylar kamaydi va ajratilmagan joylar kamayadi.

Sekin-asta tanlangan supurgi mintaqalarning genetik indekslari (Tri, FST, TAJimaning d) Amerikaning oynasi (100 Kb) ichida (10 Kb).

Nuklotide xilma-xillik (p)
4nukleotide-rang-baranglik (p)

Tajima d
5tajima's-d d

Fiksatsiya indeksi (FST)

6Fatsion indeks (FST)

WU, ET. AL.,Molekulyar o'simlik, 2018 yil

3.Gena oqimi

7Gena oqimi

WU, ET. AL.,Molekulyar o'simlik, 2018 yil

4.Dememografik tarix

8Dememografiya tarixi

Zhang va ET. AL.,Tabiat ekologiyasi va evolyutsiyasi, 2021 yil

5.DierGence Vaqt

9Dergencent-vaqti

Zhang va ET. AL.,Tabiat ekologiyasi va evolyutsiyasi, 2021 yil

Bmkgening evolyutsion genetika xizmatlari tomonidan olib borilayotgan arizalar to'plamlari orqali olib borilayotgan yutuqlarni o'rganib chiqing:

Xassionar, AK va boshqalar. (2023) "Snpdagi molekulyar markerlar va nomzodlar genlarini" APIBUZ Virus "ga qarshi kurashish, API Ceranan Conan Cracance-ning butun genomni to'liq qondirish bilan bog'liq"Molekulyar fanlar xalqaro jurnali, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS24076238.

Chay, j. va boshqalar. (2022) "Yovvoyi tabiatni kashf etish, genetik jihatdan toza Xitoy gilamer yangi tabiat imkoniyatlarini yaratadi",Zoologiya tadqiqotlari, 2022, jild. 43, 3-son, 469-480, 43 (3), PP. 469-480. DOI: 10.24272 / J.SISN.2095-8137.2022.101.

Xan, M. va boshqalar. (2022) "Filogleografik naqsh va populyatsion uslubi va populyatsiyasining evolyutsiyasi" Elmenus Sibirik "ning" Qinghay-Tibet platosi "da,O'simlik fanlari bo'yicha chegaralar, 13, p. 882601. Doi: 10.3389 / Fils.2022.882601 / Bibtex.

Vang, jd va boshqalar. (2022) "Gromik evolyutsiya xromosoma darajasidagi genome anjuman va populyatsiyasining genomikasi",Bog'dorchilik tadqiqotlari, 9. Doi: 10.1093 / HR / UHAC021.