Illumina oldindan tayyorlangan kutubxonalar
Xususiyatlari
●Platformalar:Illumina NovaSeq 6000 va NovaSeq X Plus
●Tartiblash rejimlari:PE150 va PE250
●Ketma-ketlashdan oldin kutubxonalar sifatini nazorat qilish
●QC va yetkazib berish ma'lumotlarini ketma-ketlashtirish:Q30 o'qishlarini demultiplekslash va filtrlashdan so'ng QC hisoboti va xom ma'lumotlarni fastq formatida yetkazib berish
Xizmat afzalliklari
●Sequencing xizmatlarining ko'p qirraliligi:mijoz qator, oqim xujayrasi yoki talab qilinadigan ma'lumotlar miqdori (qisman chiziqli ketma-ketlik) bo'yicha ketma-ketlikni tanlashi mumkin.
●Illumina sequencing platformasida katta tajriba:turli xil turlari bilan minglab yopiq loyihalar bilan.
●QC hisobotini ketma-ket etkazib berish:sifat ko'rsatkichlari, ma'lumotlarning aniqligi va ketma-ketlik loyihasining umumiy ishlashi bilan.
●Yetuk ketma-ketlik jarayoni:qisqa aylanish vaqti bilan.
●Qattiq sifat nazorati: Biz doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni yetkazib berishni kafolatlash uchun qat'iy QC talablarini qo'llaymiz.
Namuna platformalar
| Platforma | Oqim xujayrasi | Sequencing rejimi | Birlik | Taxminiy chiqish |
| NovaSeq X | 10B (8 qatorli) | PE150 | Yagona qator Qisman chiziq | 375 Gb / qator |
| 25B (8 qatorli) | PE150 | Yagona qator Qisman chiziq | 1000 Gb/qator | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow xujayrasi (2 qatorli) | PE250 | Oqim xujayrasi Yagona qator Qisman chiziq | 325-400 M o'qish / Lane |
| S4 oqim xujayrasi (4 qatorli) | PE150 | Oqim xujayrasi Yagona qator Qisman chiziq | ~800 Gb / qator |
Namuna talablari
| Maʼlumot miqdori (X) | Konsentratsiya (qPCR/nM) | Ovoz balandligi | |
| Qisman chiziqli tartiblash
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 mkl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 mkl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 mkl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 mkl | |
| Yo'laklarni tartiblash | Har qatorda | ≥ 1,5 nM / Kutubxona hovuzi | ≥ 25 mkl / Kutubxona hovuzi |
Konsentratsiya va umumiy miqdorga qo'shimcha ravishda, tegishli tepalik namunasi ham talab qilinadi.
Eslatma: Kam xilma-xillikdagi kutubxonalar qatori mustahkam bazaviy qo‘ng‘iroqni ta’minlash uchun PhiX-ni faollashtirishni talab qiladi.
Biz oldindan yig'ilgan kutubxonalarni namunalar sifatida taqdim etishni tavsiya qilamiz. Agar sizga kutubxonani birlashtirish uchun BMKGENE kerak bo'lsa, iltimos, qarang
qisman qatorlar uchun kutubxona talablari.
Kutubxona hajmi (Peak xaritasi)
Asosiy tepalik 300-450 bp ichida bo'lishi kerak.
Kutubxonalarda bitta asosiy tepalik, adapterning ifloslanishi va primer dimerlari bo'lmasligi kerak.
Agar namunalaringiz boshlang'ich material talablariga javob bermasa, biz bilan bog'laning.
Xizmatning ish jarayoni
Kutubxona sifatini nazorat qilish
Ketma-ketlik
Ma'lumotlar sifatini nazorat qilish
Loyihani yetkazib berish
Kutubxona QC hisoboti
Kutubxonaning sifati to'g'risida hisobot ketma-ketlikdan, kutubxona miqdorini baholashdan va parchalanishdan oldin taqdim etiladi.
QC hisobotini ketma-ketlashtirish
Jadval 1. Ma'lumotlarni ketma-ketlashtirish bo'yicha statistik ma'lumotlar.
| Namuna ID | BMKID | Raw o'qiydi | Xom maʼlumotlar (bp) | Toza o'qishlar (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Shakl 1. Har bir namunadagi o'qishlar bo'yicha sifat taqsimoti
Shakl 2. Asosiy tarkibni taqsimlash
Shakl 3. Ma'lumotlarni ketma-ketlikda o'qish mazmunini taqsimlash
