Qiyosiy inenomika
Xizmatning afzalliklari
●Keng ekspertiza va nashr yozuvlari: Yig'ilgan, BMKGene 90 dan ortiq qiyosiy genomika loyihalari bilan yakunlandi, jami ta'sirli ta'sir darajasi 900 ga etdi.
●Bioinformatika bo'yicha keng qamrovli tahlil: Tahlillar paketida yaxshi ishlab chiqilgan sakkizta talabnomada yaxshi ishlab chiqilgan raqamlarni taqdim etadi va natijalarni oson talqin qilishga imkon beradi
●Yuqori malakali bioinformatika jamoasi va qisqa tahlil tsikllari: Qiyosiy atomika tahlilida katta tajribaga ega bo'lgan BMKgen jamoasi qisqa burilish paytida turli xil tahlil talablarini bajaradi
●Sotishdan keyingi yordam:Bizning majburiyatimiz loyihani tugatgandan tashqari, sotuvdan keyin 3 oydan keyin kengayadi. Shu vaqt ichida biz loyihalarni amalga oshirish uchun har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatib borish, muammolarni bartaraf etish, Q vada o'tkazishni taklif qilamiz.
Xizmat texnikasi
| Taxminiy burilish vaqti | Turlar soni | Tahlil qiladi |
| 30 ish kuni | 6 - 12 | Gen oilasi klasterlanmoqda Gen oilasi kengayishi va qisqarishi Fitogenetik daraxt qurilishi Vaqtni almashtirish (fossil kaliblanish kerak) Ltrni qo'shish vaqti (o'simliklar uchun) Butun genme takrorlanishi (o'simliklar uchun) Tanlangan bosim Sintinten tahlil |
Bioinformatika tahlillari
● gen oilasi
● FNilyutenika
● kelishmovchilik vaqti
Kellangan bosim
Kintinni tahlil qilish
Namuna talablari va etkazib berish
Namuna talablari:
To'qimachilik yoki genome ketma-ketligi uchun DNK
To'qima uchun
| Turlar | To'qima | Tadqiqotlar | Pacbio CCS |
| Hayvon | Visseral to'qima | 0,5 ~ 1 g | ≥ 3.5 g |
| Mushak to'qimalari | |||
| ≥ 5.0 g | |||
| ≥ 5.0 ml | |||
| Sutemizuvchi qon | |||
| ≥ 0,5 ml | |||
| Parrandachilik / baliq qon | |||
| O'simlik | Yangi barg | 1 ~ 2 g | ≥ 5.0 g |
| Petal / Pet | 1 ~ 2 g | ≥ 10.0 g | |
| Ildiz / urug ' | 1 ~ 2 g | ≥ 20,0 g | |
| Hujayralar | Madaniyatli hujayra | - | ≥ 1 x 108 |
Ma'lumotlar
Genome ketma-ketlik fayllari (.Hushta) va annotatsiya fayllari (.GF3) chang bilan bog'liq
Xizmat ishi oqimi
Eksperiment dizayni
Namuna etkazib berish
Kutubxona qurilishi
Tartibsizlik
Ma'lumotlar tahlili
Sotishdan keyingi xizmatlar
*Ko'rsatilgan demo keltirilgan natijalar Bioomaker Technologies tomonidan nashr etilgan genomlardandir
1.LTRD raqamini o'zgartirish kiriting: boshqa turlarga nisbatan "LTR-RTS" so'zlashuv vaqtlarida "LTR-RTS" so'zlashuv davrida noyob bidikal taqsimotni ko'rsatdi. Eng so'nggi cho'qqisi 0,5 million yil oldin paydo bo'lgan.
Li Guang va boshqalar.,Tabiat genetikasi, 2021 yil
2. Shayotogen va gen oilasi bilan tanishish (SechHium Edul): Chayote oilasidagi boshqa 13 ta bog'liq turlarni tahlil qilish orqali Shayxot Gerak Gurd (Trichosantes Anguina) bilan chambarchas bog'liq bo'lgan. Chayote ilon guruxidan kelib chiqdi, 27-45 ta MyA va butun genompial takroriy (WGD) 27-45 ta nusxada (WGD) CucuibitAceae-dagi uchinchi WGD tadbiri bo'lgan.
Fu a va boshqalar.,Bog'dorchilik tadqiqotlari, 2021 yil
3.Yangi anal tahluk: Meva tarmog'idagi fitoxonlarga tegishli ba'zi g genlar, shayot, ilon guruxida va qovoqda topilgan. Chayote va qovoq orasidagi korrelyatsiya chirot va ilon guruxuzi orasidagi narsadan biroz yuqori.
Fu a va boshqalar.,Bog'dorchilik tadqiqotlari, 2021 yil
4.Gena oilaviy tahlil: G.Turberiy va G.DAVIII insomosida Kegg va g.DAvidsonieni jinsi bo'yicha Keggni boyitish, steroid biosintezi va passivsonid biosintez bilan bog'liq genlar kengaytirildi.
Yang z va boshqalar,BMK Biologiya, 2021 yil
5.Bonning takrorlanishi tahlili: 4DTV va Ks tarqatish tahlili butun genom nusxalarini takrorlash tadbirini ko'rsatadi. Intrasening cho'qqilari takrorlanish hodisalarini ko'rsatdi. ChegarePecees namoyishi ko'rinadigan voqealar. Tahlil shuni ko'rsatdiki, boshqa uchta uchta uchta kesma turlari bilan taqqoslaganda, O. Europaea yaqinda katta miqyosdagi gen geniksiyasidan o'tib ketdi.
RAO G va boshqalar,Bog'dorchilik tadqiqotlari, 2021 yil
BMK ishi
Trag'ulanmasdan ko'tarildi: namlik moslashuvchanligi bilan bog'liq genomik tushunchalar
Chop etilgan: Milliy fanlar sharhi, 2021 yil
Sekezing strategiyasi:
"BasyeTikon'(R.Shim) genome:
Taxminan. 93 X PACBIION + TEXNIKA. 90 X nanopore + 267 x ilm
Asosiy natijalari
1.Hammasi 530,07 MB to'planishiga olib keladigan uzoq o'qishni keltirib chiqaradigan uzoq o'quvchilarning fazilatlari va 525,9 MB atrofida 525,9 MB ni tashkil etdi; Busco hisobi 93,9% ni tashkil etdi. "Eski qizarish" (Gaploob) bilan taqqoslash, ushbu genomning sifati va to'liqligi bazaviy aniqlik va ltr yig'ish indeksi (La = 20.03) tomonidan tasdiqlangan. R.VICHURAANA GENOMESda 32,674 protein kodlash genlari mavjud.
2. Qiyosiy genomikalar, tazyalar, tozaligi, QTL genetik populyatsiyasidan tashkil topgan qo'shma tahlil, R. Wichuraiana va Rosa Chinensis o'rtasidagi muhim spetsifikatsiyalarni aniqladi. Shuningdek, QTL-da tegishli genlarning ifodasi ko'rinishi Prickle patch bilan bog'liq bo'lishi mumkin edi.
Qiyosiy inzomika Basye; Sangsiz va roza chinensi, jumladan, sintnidni tahlil qilish, gen oilasi klaster, kengaytirish va qisqarish tahlili, atirgullardagi muhim xususiyatlar bilan bog'liq ko'plab tafovutlarni aniqladi. NAK va Far1 / Frs geni oilasidagi noyob kengayish qora nuqtaga qarshilik bilan bog'liq edi.
BT va Gaploob genomlari o'rtasidagi qiyosiy atomik tahlil.
Zhong, M., va boshqalar. "Prickle-da ko'tarildi: namlik moslashish bilan bog'liq genomik tushunchalar"Milliy fanlar sharhi, 2021 ;, nwab092.
