Segriant tahlil
Xizmatning afzalliklari
Takagi va al., 2013 yil zavodi jurnalida
● To'g'ri mahalliylashtirish: OBLATALARNI 30 + 30 + 200 + 200 + 200 + 200 + 200 dan ortiq, fon shovqinini minimallashtirish uchun aralashtirish; Sinonon bo'lmagan mutatanonchilar tomonidan asoslangan nomzodlar uchun mo'ljallangan.
● Comprehensive analysis: In-depth candidate gene function annotation, including NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG ,etc.
● Tezroq burilish vaqti: 45 ish kuni ichida tezkor gen mahalliylashtirish.
● Keng tajriba: BMK minglab belgilar mahalliylashtirishda, ekinlar, suvli mahsulotlar, o'rmon, gullar, mevalar va boshqa turlarni qamrab olgan.
Xizmat texnikasi
Aholisi:
Ota-onalarning qarama-qarshi falotiplari bilan ajralib turadi.
masalan, F2 naslini, orqaga burilish (mil.), rekombinant inbred liniyasi (ril)
Basseyn aralashmasi
Sifat belgilari uchun: 30 dan 50 kishi (kamida 20) / asosiy
Miqdoriy tatis uchun: butun aholi sonidagi ekstremal fenotiplari bo'lgan eng yaxshi 5% dan 10% gacha (kamida 30 + 30).
Tavsiya etilgan tartibda tavsiya etilgan
Kamida 20x / ota-onasi va 1x / avlodlar aralashmasi 30 + 30 individual individual individual, ketma-ketlik chuqurligi katta miqdorda 30x bo'ladi)
Bioinformatika tahlillari
● butun atrome to'liq tuzilish
● Ma'lumotlarni qayta ishlash
● SNP / AGEL qo'ng'iroq
● Skidki
● Nomzod Gen funktsiyasi binosi
Namuna talablari va etkazib berish
Namuna talablari:
Nukleotidlar:
| GDNA namunasi | To'qima namunasi |
| Konsentratsiya: ≥ 30 ng / mkl | O'simliklar: 1-2 g |
| Miqdor: ≥2 mkg (≥15 mkl) | Hayvonlar: 0,5-1 g |
| Tozalar: OD260 / 280 = 1.6-2.5 | Butun qon: 1,5 ml |
Xizmat ishi oqimi
Eksperiment dizayni
Namuna etkazib berish
RNNni olish
Kutubxona qurilishi
Tartibsizlik
Ma'lumotlar tahlili
Sotishdan keyingi xizmatlar
4. Nomzodlar mintaqasini aniqlash uchun Evklidlar masofasiga (Ed) yo'nalishi bo'yicha (tahrirlash) bazasi. Quyidagi raqamda
X-o'q: xromosoma raqami; Har bir nuqta SNP ning ed qiymatini anglatadi. Qora chiziq ed qiymatiga mos keladi. ER ning yuqori qiymati sayt va fenotip o'rtasidagi muhim birlashmalardan dalolat beradi. Qizil davolash liniyasi muhim birlashmaning ostonasini aks ettiradi.
2. SNP-indeksga asoslanmagan holda
X-o'q: xromosoma raqami; Har bir nuqta SNP-indeks qiymatini taqdim etadi. Qora chiziq o'rnatilgan SNP-indeks qiymatini anglatadi. Qiymat qanchalik katta bo'lsa, assotsiatsiya shunchalik muhim bo'lsa.
BMK ishi
Katta ta'sirni miqdoriy belgilar FNL7.1 Bodringda mevali bo'yin uzunligi bilan bog'liq bo'lgan va bo'yin uzunligi bilan bog'liq kech embronogenezezning ko'paygan oqsilni kodlaydi
Chop etilgan: O'simlik biotexnologiya jurnali, 2020
Sekezing strategiyasi:
Ota-onalar (Jin5-508, yn): 34 × va 20 ×.
DNK basseynlari (50 ta bo'yli va 50 qisqa va bo'yli): 61 × 52 ×
Asosiy natijalari
Ushbu tadqiqotda Amrellection (F2 va F2: 3) uzoq bo'yinli bodring liniyasini kesib o'tish orqali, jin5-508 va qisqa bo'yin yostini kesib o'tish orqali yaratildi. Ikkita DNK basseynlari 50 ta uzun bo'yli odamlar va 50 ekstremal qisqa bo'yli shaxslar qurildi. Asosiy effekt QTL CH07-da BSA tahlili va an'anaviy QTL xaritasi tomonidan aniqlandi. Nomzodlar mintaqa, genni aniqlashning miqdorini va transgen tajribasi bilan yanada torayib, bo'yin uzunligi, bo'yin uzunligini nazorat qilishda kalit genini ochib berdi. Bundan tashqari, CSFNL7.1 Procoter mintaqasida polimorfizm tegishli ifoda bilan bog'liq deb topildi. Keyingi filogenetik tahlil shuni ko'rsatdiki, FNL7.1 lokuslari Hindistondan paydo bo'lishi mumkin.
 Bodring bo'yin uzunligi bilan bog'liq bo'lgan nomzodlikni aniqlash uchun BSA tahlilida BSA tahlilini aniqlash |  Chr07-da bodring uzunligi bo'yinbog 'uzunligi profillari aniqlandi |
Xu, X. va va boshqalar. "Katta efirning miqdoriy vujudga kelishini belgilash" FNL7.1 Bodringda meva bo'yinining uzunligi bilan bog'liq bo'lgan oxirgi embronogenezez ko'p oqsilni kodlaydi ". 18.7 (2020) zavodi biotexnologiya jurnali.
