Amplikon ketma-ketligi (16S/18S/ITS)

Illumina bilan Amplikon (16S/18S/ITS) sekvensiyasi mikrobial xilma-xillikni ularning ketma-ketligiga ko'ra mikrobial profillarni aniqlash va so'ngra har bir namunadagi va namunalar orasidagi jamiyat boyligi va xilma-xilligini aniqlashga urinish orqali tahlil qilish usulidir. BMKCloud Amplicon (NGS) quvur liniyasi 16S, 18S, ITS va bir nechta funktsional genlarni tahlil qilish imkonini beradi. U o'qishni kesish, juftlashtirilgan o'qish yig'ilishi va sifatni baholashdan boshlanadi, so'ngra olti xil tahlil bo'limida ishlatiladigan Operatsion Taksonomik Birliklarni (OTU) yaratish uchun o'xshash o'qishlarni klasterlashdan boshlanadi. Taksonomik izoh har bir namunaning nisbiy ko'pligi va tarkibi haqida ma'lumot beradi, alfa va beta xilma-xillik tahlillari mos ravishda namunalar ichidagi va namunalar orasidagi mikrobial xilma-xillikka qaratilgan. Guruhlar orasidagi differentsial tahlil parametrik va parametrik bo'lmagan testlardan foydalangan holda farq qiluvchi OTUlarni topadi, korrelyatsiya tahlili esa bu farqlarni atrof-muhit omillari bilan bog'laydi. Va nihoyat, funktsional genlarning ko'pligi marker genlarining ko'pligiga qarab bashorat qilinadi, bu har bir namunadagi funktsiya va ekologiya haqida tushuncha beradi.