مکمل جینوم بیسلفائٹ کی ترتیب (WGBS)
مکمل جینوم بیسلفائٹ سیکوینسنگ (WGBS) DNA میتھیلیشن کی گہرائی سے تلاش کے لیے سونے کے معیاری طریقہ کار کے طور پر کھڑا ہے، خاص طور پر cytosine (5-mC) میں پانچویں پوزیشن، جین کے اظہار اور سیلولر سرگرمی کا ایک اہم ریگولیٹر۔ WGBS کے بنیادی اصول میں بیسلفائٹ ٹریٹمنٹ شامل ہے، غیر میتھلیٹیڈ سائٹوسائنز کو uracil (C سے U) میں تبدیل کرتا ہے، جبکہ میتھلیٹیڈ سائٹوزائنز کو بغیر کسی تبدیلی کے چھوڑ دیتا ہے۔ یہ تکنیک سنگل بیس ریزولوشن پیش کرتی ہے، جس سے محققین میتھائلوم کی جامع تحقیقات کر سکتے ہیں اور مختلف حالات، خاص طور پر کینسر سے وابستہ غیر معمولی میتھیلیشن پیٹرن کو بے نقاب کر سکتے ہیں۔ ڈبلیو جی بی ایس کو ملازمت دے کر، سائنس دان جینوم کے وسیع میتھیلیشن مناظر کے بارے میں بے مثال بصیرت حاصل کر سکتے ہیں، جس سے ایپی جینیٹک میکانزم کی ایک باریک تفہیم فراہم کی جا سکتی ہے جو متنوع حیاتیاتی عمل اور بیماریوں کو زیر کرتے ہیں۔
سروس کی خصوصیات
● ایک حوالہ جینوم کی ضرورت ہے۔
● لیمبڈا ڈی این اے بیسلفائٹ کی تبدیلی کی کارکردگی کی نگرانی کے لیے شامل کیا جاتا ہے۔
● Illumina NovaSeq پر ترتیب۔
سروس کے فوائد
●ڈی این اے میتھیلیشن ریسرچ کے لیے گولڈ اسٹینڈرڈ: اس پختہ میتھیلیشن کنورژن پروسیسنگ ٹیکنالوجی میں اعلیٰ درستگی اور اچھی تولیدی صلاحیت ہے۔
●وسیع کوریج اور سنگل بیس ریزولوشن:جینوم وسیع سطح پر میتھیلیشن سائٹس کا پتہ لگانا۔
●مکمل پلیٹ فارم:سیمپل پروسیسنگ، لائبریری کی تعمیر، بایو انفارمیٹکس کے تجزیے کی ترتیب سے ون اسٹاپ بہترین سروس فراہم کریں۔
●وسیع مہارت: WGBS کی ترتیب کے منصوبوں کے ساتھ مختلف اقسام کی مختلف اقسام میں کامیابی کے ساتھ مکمل ہوئے، BMKGENE ایک دہائی سے زیادہ کا تجربہ، ایک انتہائی ہنر مند تجزیہ ٹیم، جامع مواد، اور فروخت کے بعد بہترین معاونت لاتا ہے۔
●ٹرانسکرپٹومکس تجزیہ کے ساتھ شامل ہونے کا امکان: WGBS کے دوسرے omics ڈیٹا جیسے RNA-seq کے ساتھ مربوط تجزیہ کی اجازت دینا۔
نمونہ نردجیکرن
| لائبریری | ترتیب کی حکمت عملی | تجویز کردہ ڈیٹا آؤٹ پٹ | کوالٹی کنٹرول |
| بیسلفائٹ کا علاج کیا گیا۔ | Illumina PE150 | 30x گہرائی | Q30 ≥ 85% بیسلفائٹ کی تبدیلی > 99% |
نمونے کے تقاضے
| ارتکاز (ng/µL) | کل رقم (µg) | اضافی ضروریات | |
| جینومک ڈی این اے | ≥ 5 | ≥ 400 این جی | محدود انحطاط یا آلودگی |
سروس ورک فلو
نمونہ کی ترسیل
ڈی این اے نکالنا
لائبریری کی تعمیر
ترتیب دینا
ڈیٹا کا تجزیہ
ڈیٹا کی ترسیل
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
● خام ترتیب کوالٹی کنٹرول؛
● حوالہ جینوم کی نقشہ سازی؛
● 5mC میتھلیٹیڈ بیسز کا پتہ لگانا؛
● میتھیلیشن کی تقسیم اور تشریح کا تجزیہ؛
● تفریق میتھلیٹیڈ ریجنز (DMRs) کا تجزیہ؛
● DMRs سے وابستہ جینوں کی فنکشنل تشریح۔
5mC میتھیلیشن کا پتہ لگانا: میتھلیٹیڈ سائٹس کی اقسام
میتھیلیشن کا نقشہ۔ 5mC میتھیلیشن جینوم کی وسیع تقسیم
انتہائی میتھلیٹیڈ علاقوں کی تشریح
امتیازی طور پر میتھلیٹیڈ ریجنز: منسلک جین
متفرق طور پر میتھلیٹیڈ ریجنز: منسلک جینوں کی تشریح (جین اونٹولوجی)
BMKGene کی مکمل جینوم بیسلفائٹ سیکوینسنگ سروسز کے ذریعے دستیاب تحقیقی پیشرفت کو پبلیکیشنز کے مرتب کردہ مجموعہ کے ذریعے دریافت کریں۔
فین، Y. et al. (2020) 'پورے جینوم بیسلفائٹ کی ترتیب کا استعمال کرتے ہوئے بھیڑوں کے کنکال کے پٹھوں کی نشوونما کے دوران ڈی این اے میتھیلیشن پروفائلز کا تجزیہ'،بی ایم سی جینومکس، 21(1)، صفحہ 1-15۔ doi: 10.1186/S12864-020-6751-5۔
Zhao, X. et al. (2022) 'وائنل کلورائڈ کے سامنے آنے والے کارکنوں میں ناول ڈی آکسیریبونیوکلک ایسڈ میتھیلیشن کی خرابی'،ٹاکسیکولوجی اور صنعتی صحت، 38(7)، صفحہ 377–388۔ doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo، J. et al. (2020) 'جینوم میتھیلیشن، نان کوڈنگ RNAs کی سطح، mRNAs اور ٹماٹر کے پھل کو پکنے میں میٹابولائٹس کے درمیان تعلقات'،پلانٹ جرنل، 103(3)، صفحہ 980-994۔ doi: 10.1111/TPJ.14778۔
